seq1 = pF1KB8477.tfa, 2742 bp
seq2 = pF1KB8477/gi568815596r_201280546.tfa (gi568815596r:201280546_201520507), 239962 bp

>pF1KB8477 2742
>gi568815596r:201280546_201520507 (Chr2)

(complement)

1-91  (100001-100091)   100% ->
92-286  (112911-113105)   100% ->
287-363  (119414-119490)   100% ->
364-480  (121015-121131)   100% ->
481-690  (122154-122363)   100% ->
691-769  (122928-123006)   100% ->
770-900  (125064-125194)   99% ->
901-975  (125636-125710)   100% ->
976-1113  (127462-127599)   100% ->
1114-1193  (130628-130707)   100% ->
1194-1397  (131005-131208)   100% ->
1398-1696  (132507-132805)   99% ->
1697-1963  (134024-134290)   100% ->
1964-2069  (136292-136397)   100% ->
2070-2742  (139290-139962)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCAATCCCAGAATGCAATTTTTACATCACCAACAGGTGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCAATCCCAGAATGCAATTTTTACATCACCAACAGGTGAAGAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCATGAATAGCAATCACAGAGACTCGGAGAGCATCACTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100051 CCTCATGAATAGCAATCACAGAGACTCGGAGAGCATCACTGGTA...TAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGTCTGCTCCAATGAGGATCTCCCTGAAGTTGAGCTGGTGAGTCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112911 ATGTCTGCTCCAATGAGGATCTCCCTGAAGTTGAGCTGGTGAGTCTGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGAACAACTACCACAGTATAGGCTAAAAGTAGACACTCTCTTTCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112961 GAAGAACAACTACCACAGTATAGGCTAAAAGTAGACACTCTCTTTCTATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAAAATCAAGACTGGACTCAGTCTCCACACCAGCGGCAGCATGCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113011 TGAAAATCAAGACTGGACTCAGTCTCCACACCAGCGGCAGCATGCATCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGCTCTCTCTCCAGTCCTTGCTGAAGAGACTTTCCGTTACATGA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 113061 ATGCTCTCTCTCCAGTCCTTGCTGAAGAGACTTTCCGTTACATGAGTG..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     TTCTAGGCACAGACAGGGTGGAGCAGATGACCAAAACTTACAATGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113111 .TAGTTCTAGGCACAGACAGGGTGGAGCAGATGACCAAAACTTACAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCGACATGGTTACACATCTCCTGGCAGAG         AGGGATCGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 119460 CATCGACATGGTTACACATCTCCTGGCAGAGGTA...CAGAGGGATCGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCTGGAACTCGCTGCTCGAATTGGACAAGCTCTCTTAAAGCGGAACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121025 ATCTGGAACTCGCTGCTCGAATTGGACAAGCTCTCTTAAAGCGGAACCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTCTTATCTGAGCAGAACGAATCCCTGGAGGAGCAATTGGGACAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121075 GTCTTATCTGAGCAGAACGAATCCCTGGAGGAGCAATTGGGACAAGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGATCAA         GTTAATCAGCTGCAGCATGAGCTATGCAAGAAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121125 TGATCAAGTA...CAGGTTAATCAGCTGCAGCATGAGCTATGCAAGAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGAGTTACTTCGAATCGTCTCCATTGCTTCTGAAGAAAGTGAAACTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122188 ATGAGTTACTTCGAATCGTCTCCATTGCTTCTGAAGAAAGTGAAACTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCCAGCTGTTCTACACCTCTTCGGTTCAATGAGTCCTTTAGCTTATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122238 TCCAGCTGTTCTACACCTCTTCGGTTCAATGAGTCCTTTAGCTTATCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGGGTTGCTGCAGTTGGAAATGCTGCAAGAAAAGCTCAAGGAACTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122288 AGGGTTGCTGCAGTTGGAAATGCTGCAAGAAAAGCTCAAGGAACTGGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGAGAATATGGCTCTTCGATCCAAG         GCTTGTCACATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122338 AAGAGAATATGGCTCTTCGATCCAAGGTA...AAGGCTTGTCACATAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACAGAAACTGTTACCTATGAAGAAAAGGAACAACAGCTTGTCAGCGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122943 ACAGAAACTGTTACCTATGAAGAAAAGGAACAACAGCTTGTCAGCGACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGTTAAAGAACTTC         GTGAAACAAATGCTCAGATGTCCAGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 122993 TGTTAAAGAACTTCGTG...AAGGTGAAACAAATGCTCAGATGTCCAGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGACTGAAGAATTGTCAGGGAAGAGTGATGAGCTGATTCGATACCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125091 TGACTGAAGAATTGTCAGGGAAGAGTGATGAGCTGATTCGATACCAAGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAGCTTTCCTCTCTTTTGTCACAGATTGTAGACCTTCAGCATAAACTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 125141 GAGCTTTCCTCTCTTTTGTCACAGATTGTAGACCTTCAGCACAAACTTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGAA         CATGTGATTGAGAAGGAAGAACTAAAACTTCACCTGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125191 AGAAGTA...TAGCATGTGATTGAGAAGGAAGAACTAAAACTTCACCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGCTTCCAAAGATGCCCAACGGCAACTGACAATGGAG         CTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 125673 AAGCTTCCAAAGATGCCCAACGGCAACTGACAATGGAGGTA...TAGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CACGAGTTACAAGACAGGAATATGGAGTGTCTAGGAATGTTACATGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127465 CACGAGTTACAAGACAGGAATATGGAGTGTCTAGGAATGTTACATGAATC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCAAGAAGAAATAAAGGAACTTCGTAGTAGATCTGGCCCTACTGCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127515 CCAAGAAGAAATAAAGGAACTTCGTAGTAGATCTGGCCCTACTGCTCATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCTACTTCTCCCAATCATATGGAGCTTTTACTGGG         GAATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 127565 TCTACTTCTCCCAATCATATGGAGCTTTTACTGGGGTA...TAGGAATCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TTGGCAGCTGAGATTGAGGGGACTATGCGTAAAAAGCTGAGTTTGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130634 TTGGCAGCTGAGATTGAGGGGACTATGCGTAAAAAGCTGAGTTTGGATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGAATCTTCTCTCTTTAAACAAAA         AGCCCAACAGAAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 130684 GGAATCTTCTCTCTTTAAACAAAAGTA...CAGAGCCCAACAGAAGCGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TATTTGATACCGTCAGGATTGCCAATGACACACGGGGCCGCTCTATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131022 TATTTGATACCGTCAGGATTGCCAATGACACACGGGGCCGCTCTATCTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TTCCCAGCTCTGTTACCCATTCCAGGCTCCAACCGTTCAAGTGTCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131072 TTCCCAGCTCTGTTACCCATTCCAGGCTCCAACCGTTCAAGTGTCATCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GACAGCAAAACCTTTTGAGTCTGGTCTTCAGCAAACAGAGGACAAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131122 GACAGCAAAACCTTTTGAGTCTGGTCTTCAGCAAACAGAGGACAAATCAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TCCTGAACCAGGGGAGCAGCTCAGAGGAGGTTGCAGG         GAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 131172 TCCTGAACCAGGGGAGCAGCTCAGAGGAGGTTGCAGGGTA...TAGGAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TCCCAGAAGATGGGCCAACCAGGACCCTCAGGAGATAGTGATTTGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132511 TCCCAGAAGATGGGCCAACCAGGACCCTCAGGAGATAGTGATTTGGCTAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AGCACTGCATCGCCTTAGCTTGCGTCGACAAAACTATTTAAGTGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132561 AGCACTGCATCGCCTTAGCTTGCGTCGACAAAACTATTTAAGTGAGAAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AGTTCTTTGCTGAAGAATGGCAGCGGAAGATCCAGGTTCTGGCAGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132611 AGTTCTTTGCTGAAGAATGGCAGCGGAAGATCCAGGTTCTGGCAGACCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AAGGAAGGAGTTAGTGGCTGTGTCACCCCGATAGAGAGCCTTGCCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 132661 AAGGAAGGAGTTAGTGGCTGTGTCACCCCGACAGAGAGCCTTGCCTCTCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CTGCACCACCCAGTCAGAGATCACAGACCTCAGCAGTGCCAGTTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132711 CTGCACCACCCAGTCAGAGATCACAGACCTCAGCAGTGCCAGTTGCCTTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 GAGGTTTTATGCCAGAAAAATTACAAATTGTCAAGCCCCTTGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 132761 GAGGTTTTATGCCAGAAAAATTACAAATTGTCAAGCCCCTTGAAGGTA..

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697     GATCACAAACTCTGTATCACTGGCAGCAGCTTGCTCAACCAAACTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132811 .CAGGATCACAAACTCTGTATCACTGGCAGCAGCTTGCTCAACCAAACTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GGGAACCATCCTTGATCCACGACCAGGTGTCATTACTAAAGGCTTTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134070 GGGAACCATCCTTGATCCACGACCAGGTGTCATTACTAAAGGCTTTACCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGTTGCCCGGGGATGCTATTTATCACATCTCAGATTTAGAAGAGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134120 AGTTGCCCGGGGATGCTATTTATCACATCTCAGATTTAGAAGAGGATGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GAGGAGGGTATTACTTTTCAGGTTCAGCAACCTCTTGAAGTGGAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134170 GAGGAGGGTATTACTTTTCAGGTTCAGCAACCTCTTGAAGTGGAAGAGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 ACTTTCAACATCCAAGCCAGTAACAGGGATCTTCCTGCCACCCATTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134220 ACTTTCAACATCCAAGCCAGTAACAGGGATCTTCCTGCCACCCATTACTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CAGCAGGTGGACCAGTTACAG         TTGCAACCGCCAACCCAGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 134270 CAGCAGGTGGACCAGTTACAGGTG...CAGTTGCAACCGCCAACCCAGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 AAGTGCCTGTCGTGCACAAACTCAACATTCACTTTCACCACCTGTAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136312 AAGTGCCTGTCGTGCACAAACTCAACATTCACTTTCACCACCTGTAGAAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 ATTACATCCCTCTGACATCACTCAGGTTACCCCCAG         CTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 136362 ATTACATCCCTCTGACATCACTCAGGTTACCCCCAGGTA...AAGCTCTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GGTTCCCTTCATTATCCTGTGGAAGTAGCGGTAGCAGTTCATCCAACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139295 GGTTCCCTTCATTATCCTGTGGAAGTAGCGGTAGCAGTTCATCCAACACG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GCTGTGAATTCTCCTGCCTTGTCCTATAGACTCAGCATTGGTGAGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139345 GCTGTGAATTCTCCTGCCTTGTCCTATAGACTCAGCATTGGTGAGTCCAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 CACCAACCGACGAGATTCCACTACAACCTTCAGTAGCACCATGAGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139395 CACCAACCGACGAGATTCCACTACAACCTTCAGTAGCACCATGAGCTTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CCAAACTTCTACAAGAGCGAGGCATCTCTGCCAAAGTGTACCACAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139445 CCAAACTTCTACAAGAGCGAGGCATCTCTGCCAAAGTGTACCACAGCCCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 ATTTCAGAGAACCCCCTCCAGCCTCTCCCTAAATCCCTGGCTATCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139495 ATTTCAGAGAACCCCCTCCAGCCTCTCCCTAAATCCCTGGCTATCCCTTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CACACCACCAAATTCACCATCTCACTCACCTTGCCCTTCTCCTTTACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139545 CACACCACCAAATTCACCATCTCACTCACCTTGCCCTTCTCCTTTACCCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 TTGAGCCTCGAGTGCATCTCTCTGAAAATTTTTTGGCCTCTCGACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139595 TTGAGCCTCGAGTGCATCTCTCTGAAAATTTTTTGGCCTCTCGACCAGCT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 GAGACATTCCTCCAGGAGATGTATGGCTTGAGACCCTCCCGGAACCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139645 GAGACATTCCTCCAGGAGATGTATGGCTTGAGACCCTCCCGGAACCCTCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 TGATGTTGGCCAGTTGAAGATGAACTTAGTGGACAGGCTGAAGAGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139695 TGATGTTGGCCAGTTGAAGATGAACTTAGTGGACAGGCTGAAGAGACTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 GGATAGCCAGAGTGGTCAAGAACCCTGGTGCCCAAGAGAATGGAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139745 GGATAGCCAGAGTGGTCAAGAACCCTGGTGCCCAAGAGAATGGAAGATGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 CAGGAGGCAGAAATTGGTCCTCAAAAACCAGATTCTGCTGTTTATTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139795 CAGGAGGCAGAAATTGGTCCTCAAAAACCAGATTCTGCTGTTTATTTAAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 TTCAGGTAGCAGTTTATTAGGTGGACTAAGGAGGAATCAGAGTCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139845 TTCAGGTAGCAGTTTATTAGGTGGACTAAGGAGGAATCAGAGTCTTCCAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 TCATAATGGGTAGCTTTGCTGCCCCAGTTTGCACATCCTCACCCAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139895 TCATAATGGGTAGCTTTGCTGCCCCAGTTTGCACATCCTCACCCAAAATG

   2850     .    :    .
   2725 GGTGTCCTGAAGGAGGAC
        ||||||||||||||||||
 139945 GGTGTCCTGAAGGAGGAC