seq1 = pF1KB8465.tfa, 378 bp
seq2 = pF1KB8465/gi568815576f_24457675.tfa (gi568815576f:24457675_24671974), 214300 bp

>pF1KB8465 378
>gi568815576f:24457675_24671974 (Chr22)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-319  (110310-110502)   100% ->
320-378  (114242-114300)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTATTGGTGTGCCGATTAAAGTACTGCATGAGGCCGAGGGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTATTGGTGTGCCGATTAAAGTACTGCATGAGGCCGAGGGCCACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGACATGTGAGACGAACACCGGTGAGGTATATCGGGGGAAGCTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGACATGTGAGACGAACACCGGTGAGGTATATCGGGGGAAGCTCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGCAGAGGACAACATGAACTGCCAG         ATGTCCAACATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 AAGCAGAGGACAACATGAACTGCCAGGTA...CAGATGTCCAACATCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCACATACAGAGATGGCCGAGTGGCACAGCTGGAGCAGGTATACATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110325 GTCACATACAGAGATGGCCGAGTGGCACAGCTGGAGCAGGTATACATCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGCAGCAAAATCCGCTTTCTGATTTTGCCTGACATGCTGAAGAACGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110375 TGGCAGCAAAATCCGCTTTCTGATTTTGCCTGACATGCTGAAGAACGCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCATGTTAAAGAGCATGAAAAATAAAAACCAAGGCTCAGGGGCTGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110425 CCATGTTAAAGAGCATGAAAAATAAAAACCAAGGCTCAGGGGCTGGCCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGAAAAGCTGCTATTCTCAAGGCCCAAG         TGGCCGCAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 110475 GGAAAAGCTGCTATTCTCAAGGCCCAAGGTA...CAGTGGCCGCAAGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    333 AAGAGGACGTGGAATGGGACGTGGAAACATCTTTCAAAAGCGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114255 AAGAGGACGTGGAATGGGACGTGGAAACATCTTTCAAAAGCGAAGA