seq1 = pF1KB8442.tfa, 378 bp
seq2 = pF1KB8442/gi568815576f_38568055.tfa (gi568815576f:38568055_38773233), 205179 bp

>pF1KB8442 378
>gi568815576f:38568055_38773233 (Chr22)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-184  (102830-102935)   100% ->
185-303  (103016-103134)   100% ->
304-378  (105105-105179)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTTTCTTTGGGAATACGTTCAGTCCGAAGAAGACACCTCCTCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTTTCTTTGGGAATACGTTCAGTCCGAAGAAGACACCTCCTCGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCGGCATCTCTCTCCAACCTGCATTCT         TTGGATCGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 GTCGGCATCTCTCTCCAACCTGCATTCTGTG...CAGTTGGATCGATCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCGGGAGGTGGAGCTGGGCTTGGAATACGGATCCCCGACTATGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102843 CCCGGGAGGTGGAGCTGGGCTTGGAATACGGATCCCCGACTATGAACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGGGCAAAGCCTGAAGTTTGAAAATGGCCAGTGGATAGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102893 GCAGGGCAAAGCCTGAAGTTTGAAAATGGCCAGTGGATAGCAGGTG...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   AGACAGGGGTTAGTGGCGGTGTGGACCGGAGGGAGGTTCAGCGCCTTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103014 AGAGACAGGGGTTAGTGGCGGTGTGGACCGGAGGGAGGTTCAGCGCCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAGGCGGAACCAGCAGTTGGAGGAAGAGAACAATCTCTTGCGGCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103064 GCAGGCGGAACCAGCAGTTGGAGGAAGAGAACAATCTCTTGCGGCTGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGGACATCTTATTAGACATG         CTTTCAGAGTCCACTGCTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103114 GTGGACATCTTATTAGACATGGTG...CAGCTTTCAGAGTCCACTGCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ATCCCACTTAATGGAGAAGGAACTGGATGAACTGAGGATCAGCCGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105125 ATCCCACTTAATGGAGAAGGAACTGGATGAACTGAGGATCAGCCGGAAGA

    400     .
    374 GAAAA
        |||||
 105175 GAAAA