seq1 = pF1KB8412.tfa, 2769 bp
seq2 = pF1KB8412/gi568815590f_22505774.tfa (gi568815590f:22505774_22719679), 213906 bp

>pF1KB8412 2769
>gi568815590f:22505774_22719679 (Chr8)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-150  (100312-100403)   100% ->
151-242  (100834-100925)   100% ->
243-357  (101137-101251)   99% ->
358-487  (101423-101552)   100% ->
488-584  (102196-102292)   98% ->
585-704  (107244-107363)   100% ->
705-927  (108319-108541)   100% ->
928-1041  (108617-108730)   100% ->
1042-1205  (109065-109228)   100% ->
1206-1377  (109652-109823)   100% ->
1378-1608  (109909-110139)   100% ->
1609-1845  (110239-110475)   100% ->
1846-1990  (111647-111791)   100% ->
1991-2073  (111923-112005)   100% ->
2074-2220  (112576-112722)   100% ->
2221-2332  (112844-112955)   100% ->
2333-2521  (113054-113242)   100% ->
2522-2727  (113377-113582)   100% ->
2728-2769  (113865-113906)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCAGTTTAAGCGCCAGCGGATCAACCCGCTTCCAGGGGGACGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCAGTTTAAGCGCCAGCGGATCAACCCGCTTCCAGGGGGACGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCTCAG         GCACAGCTTCAACATCTCTTCTGGGCCCTCCTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCTCAGGTG...TAGGCACAGCTTCAACATCTCTTCTGGGCCCTCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGGTTTGCTCACTCCTCCTGTGGCCACAGAACTGTCCCAGAATGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100345 CTGGTTTGCTCACTCCTCCTGTGGCCACAGAACTGTCCCAGAATGCCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACCTTCAG         GGTGGGGAGAAACAGCGGGTCTTCACTGGTAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100395 CACCTTCAGGTA...CAGGGTGGGGAGAAACAGCGGGTCTTCACTGGTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTTACCAGCTTGCATGACTACTTTGGGGTTGTGGATGAAGAGGTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100866 TGTTACCAGCTTGCATGACTACTTTGGGGTTGTGGATGAAGAGGTCTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCAGCTAAG         TGTGGTGAAGGGCCGTCTGCCCCAGCTGGGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100916 TTCAGCTAAGGTA...CAGTGTGGTGAAGGGCCGTCTGCCCCAGCTGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGAAGGTGCTGGTGAAGGCTGCATACAACCCAGGCCAGGCAGTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101168 GAGAAGGTGCTGGTGAAGGCTGCATACAACCCAGGCCAGGCAGTGCCCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAATGCTGTCAAGGTGCAAATGCTCTCCAACCAG         CCCCTAC
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101218 GAATGCTGTCAAGGTGCAAACGCTCTCCAACCAGGTA...CAGCCCCTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGAAGTCCCCAGCACCTCCTCTTCTGCATGTAGCAGCCCTGGGCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101430 TGAAGTCCCCAGCACCTCCTCTTCTGCATGTAGCAGCCCTGGGCCAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAAGGGATCCTGGGAGCTCAGCCTCAGTTGATCTTCCAGCCTCACCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101480 CAAGGGATCCTGGGAGCTCAGCCTCAGTTGATCTTCCAGCCTCACCGGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCCCCCACTCTTTCCTCAGAAGC         CTCTGAGTCTCTTCCAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 101530 TCCCCCACTCTTTCCTCAGAAGCGTG...CAGCTCTGAGTCTCTTCCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CATCCCACACACTGCACCTGAGCCACCTGAACAGATTTCCTGCCCGGGGC
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102214 CATCCCACACACTTCACCTGAGCCACCTGAACAGATTTCCTGCCCGGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCTCATGGACGGTTGGATCAGGGCCGAAG         TGATGACTATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102264 CCTCATGGACGGTTGGATCAGGGCCGAAGGTA...TAGTGATGACTATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTCCAAGAAACGCAAACAGCGGGCTGGTGGAGAGCCCTGGGGTGCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107256 CTCCAAGAAACGCAAACAGCGGGCTGGTGGAGAGCCCTGGGGTGCTAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGCCAAGGCATGACCTGCCTCCTTACCGGGTCCACCTCACTCCTTACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107306 AGCCAAGGCATGACCTGCCTCCTTACCGGGTCCACCTCACTCCTTACACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTGGACAG         CCCCATCTGTGACTTCCTAGAACTCCAGCGCCG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 107356 GTGGACAGGTG...TAGCCCCATCTGTGACTTCCTAGAACTCCAGCGCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TTACCGCAGCCTCCTGGTCCCCTCAGATTTTCTGTCCGTGCATCTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108352 TTACCGCAGCCTCCTGGTCCCCTCAGATTTTCTGTCCGTGCATCTGAGTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGCTATCAGCCTTCCCCCTGAGCCAGCCCTTTTCCCTCCATCATCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108402 GGCTATCAGCCTTCCCCCTGAGCCAGCCCTTTTCCCTCCATCATCCAAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CGGATCCAGGTCTCTTCTGAAAAGGAGGCAGCTCCAGACGCTGGTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108452 CGGATCCAGGTCTCTTCTGAAAAGGAGGCAGCTCCAGACGCTGGTGCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCCCATCACTGCAGACAGTGACCCCGCTTATAGTTCGAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 108502 GCCCATCACTGCAGACAGTGACCCCGCTTATAGTTCGAAGGTA...CAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TACTGCTGCTCTCTTCCCCGGGGTTGGAGGAATTGTATCGTTGTTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108618 TACTGCTGCTCTCTTCCCCGGGGTTGGAGGAATTGTATCGTTGTTGCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTCTTTGTGGATGACATGGCTGAGCCAAGGGAGACGCCAGAGCATCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108668 CTCTTTGTGGATGACATGGCTGAGCCAAGGGAGACGCCAGAGCATCCTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GAAGCAGATTAAG         TTTTTGCTGGGCAGGAAAGAAGAGGAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 108718 GAAGCAGATTAAGGTA...CAGTTTTTGCTGGGCAGGAAAGAAGAGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CAGTGCTGGTTGGGGGTGAATGGTCTCCTTCCCTGGATGGCCTCGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109093 CAGTGCTGGTTGGGGGTGAATGGTCTCCTTCCCTGGATGGCCTCGACCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CAGGCTGACCCGCAGGTGCTGGTGCGTACCGCCATCCGCTGTGCGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109143 CAGGCTGACCCGCAGGTGCTGGTGCGTACCGCCATCCGCTGTGCGCAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCAGACTGGCATTGATTTGAGCGGCTGTACCAAGTG         GTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 109193 CCAGACTGGCATTGATTTGAGCGGCTGTACCAAGTGGTG...CAGGTGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GCTTTGCCGAGTTTCAGTACCTGCAGCCGGGACCCCCCCGGCGGCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109657 GCTTTGCCGAGTTTCAGTACCTGCAGCCGGGACCCCCCCGGCGGCTTCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ACAGTGGTGGTGTACCTGCCGGATGTCTGGACCATCATGCCTACTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109707 ACAGTGGTGGTGTACCTGCCGGATGTCTGGACCATCATGCCTACTTTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGAGTGGGAGGCCCTGTGCCAGCAGAAAGCTGCAGAGGCAGCTCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109757 GGAGTGGGAGGCCCTGTGCCAGCAGAAAGCTGCAGAGGCAGCTCCCCCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CCCAGGAGGCACAAGGG         GAAACGGAGCCTACTGAACAGGCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109807 CCCAGGAGGCACAAGGGGTA...CAGGAAACGGAGCCTACTGAACAGGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CCTGATGCCTTGGAGCAAGCAGCAGACACTTCTAGACGGAACGCAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109933 CCTGATGCCTTGGAGCAAGCAGCAGACACTTCTAGACGGAACGCAGAAAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TCCAGAGGCCACCACACAGCAGGAAACGGACACTGATCTCCCAGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109983 TCCAGAGGCCACCACACAGCAGGAAACGGACACTGATCTCCCAGAGGCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CTCCACCCCCCCTAGAACCTGCTGTCATCGCACGCCCTGGCTGTGTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110033 CTCCACCCCCCCTAGAACCTGCTGTCATCGCACGCCCTGGCTGTGTAAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTGTCCCTCCATGGGATTGTGGAGGATCGGAGGCCAAAGGAAAGGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110083 CTGTCCCTCCATGGGATTGTGGAGGATCGGAGGCCAAAGGAAAGGATCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TTTTGAG         GTGATGGTGCTGGCCGAGCTGTTTCTGGAGATGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110133 TTTTGAGGCA...CAGGTGATGGTGCTGGCCGAGCTGTTTCTGGAGATGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TCCAGAGGGATTTTGGCTATAGAGTTTATAAGATGCTACTGAGCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110273 TCCAGAGGGATTTTGGCTATAGAGTTTATAAGATGCTACTGAGCCTTCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GAAAAGGTCGTGTCCCCACCTGAACCTGAGAAGGAGGAGGCGGCCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110323 GAAAAGGTCGTGTCCCCACCTGAACCTGAGAAGGAGGAGGCGGCCAAGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 AGAAGCCACCAAGGAGGAAGAAGCCATCAAAGAGGAGGTGGTCAAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110373 AGAAGCCACCAAGGAGGAAGAAGCCATCAAAGAGGAGGTGGTCAAGGAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CCAAGGATGAGGCACAGAATGAGGGCCCGGCTACAGAGTCAGAGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110423 CCAAGGATGAGGCACAGAATGAGGGCCCGGCTACAGAGTCAGAGGCCCCG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CTG         AAGGAGGATGGGCTTTTGCCCAAACCACTCTCTTCTGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110473 CTGGTG...TAGAAGGAGGATGGGCTTTTGCCCAAACCACTCTCTTCTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GGGAGAGGAAGAAGAAAAACCCCGGGGCGAGGCTTCTGAGGACCTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111685 GGGAGAGGAAGAAGAAAAACCCCGGGGCGAGGCTTCTGAGGACCTGTGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AGATGGCCCTGGACCCAGAACTGTTGCTTCTGAGGGATGATGGAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111735 AGATGGCCCTGGACCCAGAACTGTTGCTTCTGAGGGATGATGGAGAGGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GAGTTTG         CAGGAGCAAAGCTGGAGGATTCGGAGGTCCGGTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111785 GAGTTTGGTA...TAGCAGGAGCAAAGCTGGAGGATTCGGAGGTCCGGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CGTTGCCTCAAACCAGTCAGAGATGGAGTTCTCTTCACTTCAGGACATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 111957 CGTTGCCTCAAACCAGTCAGAGATGGAGTTCTCTTCACTTCAGGACATGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2074         CCCAAGGAGCTGGATCCCTCTGCTGTGCTCCCCTTAGACTGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112007 TG...CAGCCCAAGGAGCTGGATCCCTCTGCTGTGCTCCCCTTAGACTGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CTGCTTGCTTTTGTGTTCTTTGATGCCAACTGGTGTGGCTACTTGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112618 CTGCTTGCTTTTGTGTTCTTTGATGCCAACTGGTGTGGCTACTTGCACCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GCGAGACTTAGAGAGGATCCTCCTTACCCTTGGGATCCGGCTCAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112668 GCGAGACTTAGAGAGGATCCTCCTTACCCTTGGGATCCGGCTCAGTGCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 AGCAG         GCCAAGCAGCTGGTCAGCAGGGTGGTGACCCAGAAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112718 AGCAGGTA...CAGGCCAAGCAGCTGGTCAGCAGGGTGGTGACCCAGAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 ATCTGCCAGTACCGGAGCCTTCAGTACAGCCGCCAGGAGGGCCTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112880 ATCTGCCAGTACCGGAGCCTTCAGTACAGCCGCCAGGAGGGCCTGGATGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 TGGCCTTCCCGAGGAGGTGCTCTTCG         GAAACCTGGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112930 TGGCCTTCCCGAGGAGGTGCTCTTCGGTA...TAGGAAACCTGGACCTGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 TGCCCCCTCCTGGGAAAAGCACGAAGCCAGGTGCTGCCCCCACAGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113069 TGCCCCCTCCTGGGAAAAGCACGAAGCCAGGTGCTGCCCCCACAGAACAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 AAAGCCTTGGTGTCCCACAATGGCAGCCTGATTAACGTGGGGAGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113119 AAAGCCTTGGTGTCCCACAATGGCAGCCTGATTAACGTGGGGAGCCTGCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 GCAGCGCGCGGAGCAGCAGGACAGCGGCCGGCTCTACCTAGAGAACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113169 GCAGCGCGCGGAGCAGCAGGACAGCGGCCGGCTCTACCTAGAGAACAAGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 TCCACACACTGGAGCTGAAGCTGG         AGGAGAGCCATAACCGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 113219 TCCACACACTGGAGCTGAAGCTGGGTG...CAGAGGAGAGCCATAACCGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 TTCTCAGCCACTGAAGTAACCAATAAGACGCTGGCGGCAGAGATGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113394 TTCTCAGCCACTGAAGTAACCAATAAGACGCTGGCGGCAGAGATGCAGGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 GCTGCGAGTCCGGCTGGCGGAGGCCGAGGAGACCGCCCGGACGGCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113444 GCTGCGAGTCCGGCTGGCGGAGGCCGAGGAGACCGCCCGGACGGCGGAGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 GACAGAAGAGCCAGCTCCAGCGGCTGCTGCAGGAGCTCCGCAGGCGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113494 GACAGAAGAGCCAGCTCCAGCGGCTGCTGCAGGAGCTCCGCAGGCGTCTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 ACCCCCCTGCAGCTGGAGATCCAGCGGGTGGTGGAAAAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 113544 ACCCCCCTGCAGCTGGAGATCCAGCGGGTGGTGGAAAAGGTA...CAGGC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 TGACAGCTGGGTGGAGAAGGAGGAGCCGGCACCTAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113867 TGACAGCTGGGTGGAGAAGGAGGAGCCGGCACCTAGCAAC