seq1 = pF1KB8400.tfa, 633 bp
seq2 = pF1KB8400/gi568815592f_57072698.tfa (gi568815592f:57072698_57284187), 211490 bp

>pF1KB8400 633
>gi568815592f:57072698_57284187 (Chr6)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-223  (109335-109444)   100% ->
224-633  (111081-111490)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCAGGCGAAGATCAACGCTAAAGCCAACGAGGGGCGCTTCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCAGGCGAAGATCAACGCTAAAGCCAACGAGGGGCGCTTCTGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCTCCTCCATGGCTGACCGCTCCAGCCGCCTGCTGGAGAGCCTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCTCCTCCATGGCTGACCGCTCCAGCCGCCTGCTGGAGAGCCTGGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGGAGCTCAG         GGTTGAAGCTTTGAGAGAAGCAGCAACT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGGAGCTCAGGTG...TAGGGTTGAAGCTTTGAGAGAAGCAGCAACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTGTTGAGCAAGAGAAAGAAATCCTTCTGGAAATGATCCACAGTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109363 GCTGTTGAGCAAGAGAAAGAAATCCTTCTGGAAATGATCCACAGTATCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAATAGCCAGGACATGAGGCAGATCAGTGACG         GAGAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109413 AAATAGCCAGGACATGAGGCAGATCAGTGACGGTG...TAGGAGAAAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGAATTAAATCTGACTGCAAACCGTTTGATGGGAAGAACTCTCACCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111090 AAGAATTAAATCTGACTGCAAACCGTTTGATGGGAAGAACTCTCACCGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAGTGTCAGTAGAAACAATTAGAAACCCCCAGCAGCAAGAATCCCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111140 GAAGTGTCAGTAGAAACAATTAGAAACCCCCAGCAGCAAGAATCCCTAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCATGCCACAAGGATTATTGATGAGGTGGTCAATAAGTTTCTGGATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111190 GCATGCCACAAGGATTATTGATGAGGTGGTCAATAAGTTTCTGGATGATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGGAAATGCCAAGAGTCATTTAATGTCGCTCTACAGTGCATGTTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111240 TGGGAAATGCCAAGAGTCATTTAATGTCGCTCTACAGTGCATGTTCATCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGGTGCCACATGGGCCAGTTGATCAGAAGTTTCAATCCATAGTAATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111290 GAGGTGCCACATGGGCCAGTTGATCAGAAGTTTCAATCCATAGTAATTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGTGCTCTTGAAGATCAGAAGAAAATTAAGAGAAGATTAGAGACTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111340 CTGTGCTCTTGAAGATCAGAAGAAAATTAAGAGAAGATTAGAGACTCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTAGAAATATTGAAAACTCTGACAAGGCCATCAAGCTATTAGAGCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111390 TTAGAAATATTGAAAACTCTGACAAGGCCATCAAGCTATTAGAGCATTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAAGGAGCTGGTTCCAAAACTCTGCAACAAAATGCTGAAAGCAGATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111440 AAAGGAGCTGGTTCCAAAACTCTGCAACAAAATGCTGAAAGCAGATTCAA

    650 
    633 T
        |
 111490 T