seq1 = pF1KB8399.tfa, 681 bp
seq2 = pF1KB8399/gi568815582f_74899672.tfa (gi568815582f:74899672_75206536), 306865 bp

>pF1KB8399 681
>gi568815582f:74899672_75206536 (Chr16)

1-424  (100001-100424)   100% ->
425-520  (193901-193996)   100% ->
521-626  (205113-205218)   100% ->
627-681  (206811-206865)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGGCAAGCAGAGCACGGCGGCCCGCTCCCGGGGCCCCTTCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGGCAAGCAGAGCACGGCGGCCCGCTCCCGGGGCCCCTTCCCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCTCCACCGATGACAGCGCCGTGCCGCCGCCGGGAGGGGCGCCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTCTCCACCGATGACAGCGCCGTGCCGCCGCCGGGAGGGGCGCCCCATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGGGCACTACCGGACGGGCGGCGGGGCCATGGGGCTGCGCAGCCGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGGGCACTACCGGACGGGCGGCGGGGCCATGGGGCTGCGCAGCCGCTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAGCTCGGTGGCAGGCATGGGCATGGACCCCAGCACGGCCGGGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCAGCTCGGTGGCAGGCATGGGCATGGACCCCAGCACGGCCGGGGGGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCCTTTGGCCTCTACACCCCCGCCTCCCGGGGCACCGGCGACTCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCCTTTGGCCTCTACACCCCCGCCTCCCGGGGCACCGGCGACTCCGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGCGCCCGGCGGCGGAGGGTCTGCGTCCGACTCCACCTATGCCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGCGCCCGGCGGCGGAGGGTCTGCGTCCGACTCCACCTATGCCCATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATGGTTACCAGGAGACGGGCGGCGGTCACCATAGAGACGGGATGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATGGTTACCAGGAGACGGGCGGCGGTCACCATAGAGACGGGATGCTGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGGGCTCCCGAGCCTCGCTGGCGGATGCTCTACCTCTGCACATCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTGGGCTCCCGAGCCTCGCTGGCGGATGCTCTACCTCTGCACATCGCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAGGTGGTTCAGCTCGCATAGTG         GTTTCAAGTGCCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100401 CCAGGTGGTTCAGCTCGCATAGTGGTG...CAGGTTTCAAGTGCCCCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGCTCCAAGTCTGTGGCTTCTGACGAGATGGAAATGCACTTTATAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193918 TGCTCCAAGTCTGTGGCTTCTGACGAGATGGAAATGCACTTTATAATGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TTTGAGCAAACCTCGCCTCTCCTACAACG         ATGATGTGCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 193968 TTTGAGCAAACCTCGCCTCTCCTACAACGGTA...CAGATGATGTGCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTAAAGACGCGGGTGAGTGTGTGATCTGCCTGGAGGAGCTGCTGCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205125 CTAAAGACGCGGGTGAGTGTGTGATCTGCCTGGAGGAGCTGCTGCAGGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACACGATAGCCAGGCTGCCCTGCCTGTGCATCTATCACAAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 205175 GACACGATAGCCAGGCTGCCCTGCCTGTGCATCTATCACAAAAGGTA...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    627    CTGCATAGACTCGTGGTTTGAAGTGAACAGATCTTGTCCGGAACACC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206808 CAGCTGCATAGACTCGTGGTTTGAAGTGAACAGATCTTGTCCGGAACACC

    700     .
    674 CTGCGGAC
        ||||||||
 206858 CTGCGGAC