seq1 = pF1KB8384.tfa, 1848 bp
seq2 = pF1KB8384/gi568815597r_151242189.tfa (gi568815597r:151242189_151446320), 204132 bp

>pF1KB8384 1848
>gi568815597r:151242189_151446320 (Chr1)

(complement)

1-116  (100001-100116)   100% ->
117-150  (100360-100393)   100% ->
151-233  (101133-101215)   100% ->
234-353  (101474-101593)   100% ->
354-473  (101785-101904)   100% ->
474-555  (102043-102124)   100% ->
556-757  (102439-102640)   99% ->
758-858  (102879-102979)   100% ->
859-1848  (103143-104132)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAAGATGAGCCTGATGCTAAGAGCCCCAAGACTGGGGGAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAAGATGAGCCTGATGCTAAGAGCCCCAAGACTGGGGGAAGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCCCAGGTGGTGCTGAGGCTGGGGAACCTACCACCCTTCTTCAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCCCAGGTGGTGCTGAGGCTGGGGAACCTACCACCCTTCTTCAGAGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCGAGGTACCATTTC         CAAGGCCGTGCAGAACAAAGTAGAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCGAGGTACCATTTCGTA...CAGCAAGGCCGTGCAGAACAAAGTAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGATCCTG         CAAGATGTACAGAAATTTTCTGACAATGACAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100385 GGGATCCTGGTA...CAGCAAGATGTACAGAAATTTTCTGACAATGACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGTATCTCTACCTTCAGCTCCCCTCAGGACCCACCACTGGAGACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101165 GCTGTATCTCTACCTTCAGCTCCCCTCAGGACCCACCACTGGAGACAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 G         CTCAGAGCCAAGTACACTGAGCAATGAGGAGTACATGTAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101215 GGTA...TAGCTCAGAGCCAAGTACACTGAGCAATGAGGAGTACATGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCTATAGGTGGATCCGCAACCACCTGGAAGAGCACACTGACACCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101514 GCCTATAGGTGGATCCGCAACCACCTGGAAGAGCACACTGACACCTGTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCCAAAGCAAAGTGTTTATGATGCCTATCG         GAAGTACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101564 GCCAAAGCAAAGTGTTTATGATGCCTATCGGTG...CAGGAAGTACTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGAGTCTTGCCTGTTGCCGCCCACTCAGCACAGCCAACTTTGGCAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101796 AGAGTCTTGCCTGTTGCCGCCCACTCAGCACAGCCAACTTTGGCAAGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCAGAGAGATCTTCCCTGACATCAAAGCTCGAAGGCTTGGTGGCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101846 ATCAGAGAGATCTTCCCTGACATCAAAGCTCGAAGGCTTGGTGGCCGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCAGTCCAA         ATATTGCTACAGTGGCATAAGGAGGAAGACCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101896 CCAGTCCAAGTA...CAGATATTGCTACAGTGGCATAAGGAGGAAGACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGGTGTCTATGCCACCCCTGCCTGGACTTGACCTAAAGGGTTCTGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102075 TGGTGTCTATGCCACCCCTGCCTGGACTTGACCTAAAGGGTTCTGAGAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556          CCAGAAATGGGCCCAGAAGTAACCCCAGCACCTCGAGATGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102125 GTA...CAGCCAGAAATGGGCCCAGAAGTAACCCCAGCACCTCGAGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ACTGGTGGAGGCAGCGTGTGCCCTGACCTGTGACTGGGCAGAGCGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102480 ACTGGTGGAGGCAGCGTGTGCCCTGACCTGTGACTGGGCAGAGCGGATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGAAACGGTCCTTCAGTTCCATCGTTGAGGTCGCCCGCTTCCTGCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102530 TGAAACGGTCCTTCAGTTCCATCGTTGAGGTCGCCCGCTTCCTGCTACAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAGCATCTCATCTCTGCCCGATCTGCACATGCCCATGTGCTTAAGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102580 CAGCATCTCATCTCTGCCCGATCTGCACATGCCCATGTGCTTAAGGCCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGGGCTTGCTG         AAGAGGACGAACATGCACCTCGGGAACGGT
        |||||| ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102630 GGGGCTCGCTGGTG...CAGAAGAGGACGAACATGCACCTCGGGAACGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CATCTAAACCAAAGAATGGTTTAGAGAACCCAGAGGGTGGAGCCCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102909 CATCTAAACCAAAGAATGGTTTAGAGAACCCAGAGGGTGGAGCCCACAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAGCCAGAGAGACTGGCCCAG         CCTCCTAAGGATCTGGAAGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102959 AAGCCAGAGAGACTGGCCCAGGTA...TAGCCTCCTAAGGATCTGGAAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCGAACTGGGGCCGGTCCTCTCGCACGTGGAGAGCGGAAGAAGAGTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103163 CCGAACTGGGGCCGGTCCTCTCGCACGTGGAGAGCGGAAGAAGAGTGTAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TTGAGAGCTCGGCCCCAGGAGCCAATAACCTGCAGGTTAATGCCCTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103213 TTGAGAGCTCGGCCCCAGGAGCCAATAACCTGCAGGTTAATGCCCTAGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCTCGGCTGCCTCTGCTCCTTCCCCGGGCCCCTCGCTCACTAATTCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103263 GCTCGGCTGCCTCTGCTCCTTCCCCGGGCCCCTCGCTCACTAATTCCGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AATCCCAGTCTCTCCACCTATTCTGGCCCCCAGGCTTTCTTCAGGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103313 AATCCCAGTCTCTCCACCTATTCTGGCCCCCAGGCTTTCTTCAGGTGCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGAAAGTGGCTACACTGCCTCTGTCTAGTAGGGCCGGGGCACCCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103363 TGAAAGTGGCTACACTGCCTCTGTCTAGTAGGGCCGGGGCACCCCCAGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCTGTGCCCATCATTAACATGATCTTACCAACTGTTCCTGCTTTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103413 GCTGTGCCCATCATTAACATGATCTTACCAACTGTTCCTGCTTTGCCTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ACCTGGACCTGGGCCTGGGCGAGCTCCACCTGGGGGACTCACTCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103463 ACCTGGACCTGGGCCTGGGCGAGCTCCACCTGGGGGACTCACTCAGCCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GGGGCACAGAGAACAGAGAGGTAGGCATAGGTGGTGACCAAGGACCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103513 GGGGCACAGAGAACAGAGAGGTAGGCATAGGTGGTGACCAAGGACCACAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GACAAGGGTGTCAAGAGGACAGCTGAAGTACCTGTGAGTGAGGCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103563 GACAAGGGTGTCAAGAGGACAGCTGAAGTACCTGTGAGTGAGGCCAGTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GCAGGCTCCACCAGCTAAAGCAGCAAAGCAGGATATAGAGGATACAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103613 GCAGGCTCCACCAGCTAAAGCAGCAAAGCAGGATATAGAGGATACAGCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GTGATGCCAAAAGGAAACGGGGGCGCCCTCGAAAAAAGTCAGGTGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103663 GTGATGCCAAAAGGAAACGGGGGCGCCCTCGAAAAAAGTCAGGTGGAAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GGGGAAAGGAATTCTACCCCTCTCAAGTCAGCAGCTGCCATGGAATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103713 GGGGAAAGGAATTCTACCCCTCTCAAGTCAGCAGCTGCCATGGAATCTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CCAGTCCTCAAGGTTACCATGGGAGACATGGGGCTCAGGAGGGGAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103763 CCAGTCCTCAAGGTTACCATGGGAGACATGGGGCTCAGGAGGGGAAGGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 ACTCAGCTGGAGGGGCAGAGAGGCCAGGGCCAATGGGAGAGGCTGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103813 ACTCAGCTGGAGGGGCAGAGAGGCCAGGGCCAATGGGAGAGGCTGAAAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GGGGCAGTACTTGCCCAGGGTCAGGGAGATGGTACTGTTTCCAAAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103863 GGGGCAGTACTTGCCCAGGGTCAGGGAGATGGTACTGTTTCCAAAGGAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 AAGGGGCCCCGGTTCCCAGCATACCAAAGAAGCAGAAGATAAAATTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103913 AAGGGGCCCCGGTTCCCAGCATACCAAAGAAGCAGAAGATAAAATTCCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 TGGTCCCCTCAAAAGTGAGTGTCATCAAGGGCAGCAGAAGCCAAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103963 TGGTCCCCTCAAAAGTGAGTGTCATCAAGGGCAGCAGAAGCCAAAAGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GCTTTTCCTTTGGCAAAGGGAGAGGTAGACACTGCACCACAGGGTAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104013 GCTTTTCCTTTGGCAAAGGGAGAGGTAGACACTGCACCACAGGGTAATAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 AGACTTAAAGGAGCATGTGCTTCAAAGTTCCTTATCCCAGGAGCATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104063 AGACTTAAAGGAGCATGTGCTTCAAAGTTCCTTATCCCAGGAGCATAAAG

   1900     .    :    .    :
   1829 ACCCAAAAGCAACACCCCCA
        ||||||||||||||||||||
 104113 ACCCAAAAGCAACACCCCCA