seq1 = pF1KB8368.tfa, 1866 bp
seq2 = pF1KB8368/gi568815593r_34965092.tfa (gi568815593r:34965092_35189620), 224529 bp

>pF1KB8368 1866
>gi568815593r:34965092_35189620 (Chr5)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-203  (103281-103413)   100% ->
204-373  (104982-105151)   100% ->
374-543  (116877-117046)   100% ->
544-685  (119356-119497)   100% ->
686-785  (120743-120842)   100% ->
786-855  (121336-121405)   100% ->
856-1866  (123519-124529)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGAAAATGTGGCATCTGCAACCGTTTTCACTCTGCTACTTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGAAAATGTGGCATCTGCAACCGTTTTCACTCTGCTACTTTTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACACCTGCCTTCTGAATG         GACAGTTACCTCCTGGAAAAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CAACACCTGCCTTCTGAATGGTA...TAGGACAGTTACCTCCTGGAAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGAGATCTTTAAATGTCGTTCTCCCAATAAGGAAACATTCACCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103302 CTGAGATCTTTAAATGTCGTTCTCCCAATAAGGAAACATTCACCTGCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGAGGCCTGGGACAGATGGAGGACTTCCTACCAATTATTCACTGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103352 TGGAGGCCTGGGACAGATGGAGGACTTCCTACCAATTATTCACTGACTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCACAGGGAAGG         AGAGACACTCATGCATGAATGTCCAGACT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103402 CCACAGGGAAGGGTA...CAGAGAGACACTCATGCATGAATGTCCAGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACATAACCGGTGGCCCCAACTCCTGCCACTTTGGCAAGCAGTACACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105011 ACATAACCGGTGGCCCCAACTCCTGCCACTTTGGCAAGCAGTACACCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGTGGAGGACATACATCATGATGGTCAATGCCACTAACCAGATGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105061 ATGTGGAGGACATACATCATGATGGTCAATGCCACTAACCAGATGGGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGTTTCTCGGATGAACTTTATGTGGACGTGACTTACATAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105111 CAGTTTCTCGGATGAACTTTATGTGGACGTGACTTACATAGGTA...CAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCAGCCAGACCCTCCTTTGGAGCTGGCTGTGGAAGTAAAACAGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116877 TTCAGCCAGACCCTCCTTTGGAGCTGGCTGTGGAAGTAAAACAGCCAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACAGAAAACCCTACCTGTGGATTAAATGGTCTCCACCTACCCTGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116927 GACAGAAAACCCTACCTGTGGATTAAATGGTCTCCACCTACCCTGATTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTAAAAACTGGTTGGTTCACGCTCCTGTATGAAATTCGATTAAAACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116977 CTTAAAAACTGGTTGGTTCACGCTCCTGTATGAAATTCGATTAAAACCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAAAGCAGCTGAGTGGGAG         ATCCATTTTGCTGGGCAGCAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 117027 AGAAAGCAGCTGAGTGGGAGGTG...TAGATCCATTTTGCTGGGCAGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACAGAGTTTAAGATTCTCAGCCTACATCCAGGACAGAAATACCTTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119377 ACAGAGTTTAAGATTCTCAGCCTACATCCAGGACAGAAATACCTTGTCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGTTCGCTGCAAACCAGACCATGGATACTGGAGTGCATGGAGTCCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119427 GGTTCGCTGCAAACCAGACCATGGATACTGGAGTGCATGGAGTCCAGCGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCTTCATTCAGATACCTAGTG         ACTTCACCATGAATGATACA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 119477 CCTTCATTCAGATACCTAGTGGTG...TAGACTTCACCATGAATGATACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACCGTGTGGATCTCTGTGGCTGTCCTTTCTGCTGTCATCTGTTTGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120763 ACCGTGTGGATCTCTGTGGCTGTCCTTTCTGCTGTCATCTGTTTGATTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGTCTGGGCAGTGGCTTTGAAGGGCTATAG         CATGGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 120813 TGTCTGGGCAGTGGCTTTGAAGGGCTATAGGTA...TAGCATGGTGACCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCATCTTTCCGCCAGTTCCTGGGCCAAAAATAAAAGGATTTGATGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121347 GCATCTTTCCGCCAGTTCCTGGGCCAAAAATAAAAGGATTTGATGCTCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTGTTGGAG         AAGGGCAAGTCTGAAGAACTACTGAGTGCCTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 121397 CTGTTGGAGGTA...TAGAAGGGCAAGTCTGAAGAACTACTGAGTGCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGGATGCCAAGACTTTCCTCCCACTTCTGACTATGAGGACTTGCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123551 GGGATGCCAAGACTTTCCTCCCACTTCTGACTATGAGGACTTGCTGGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGTATTTAGAAGTAGATGATAGTGAGGACCAGCATCTAATGTCAGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123601 AGTATTTAGAAGTAGATGATAGTGAGGACCAGCATCTAATGTCAGTCCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TCAAAAGAACACCCAAGTCAAGGTATGAAACCCACATACCTGGATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123651 TCAAAAGAACACCCAAGTCAAGGTATGAAACCCACATACCTGGATCCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CACTGACTCAGGCCGGGGGAGCTGTGACAGCCCTTCCCTTTTGTCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123701 CACTGACTCAGGCCGGGGGAGCTGTGACAGCCCTTCCCTTTTGTCTGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGTGTGAGGAACCCCAGGCCAATCCCTCCACATTCTATGATCCTGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123751 AGTGTGAGGAACCCCAGGCCAATCCCTCCACATTCTATGATCCTGAGGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATTGAGAAGCCAGAGAATCCTGAAACAACCCACACCTGGGACCCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123801 ATTGAGAAGCCAGAGAATCCTGAAACAACCCACACCTGGGACCCCCAGTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CATAAGCATGGAAGGCAAAATCCCCTATTTTCATGCTGGTGGATCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123851 CATAAGCATGGAAGGCAAAATCCCCTATTTTCATGCTGGTGGATCCAAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GTTCAACATGGCCCTTACCACAGCCCAGCCAGCACAACCCCAGATCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123901 GTTCAACATGGCCCTTACCACAGCCCAGCCAGCACAACCCCAGATCCTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TACCACAATATTACTGATGTGTGTGAGCTGGCTGTGGGCCCTGCAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123951 TACCACAATATTACTGATGTGTGTGAGCTGGCTGTGGGCCCTGCAGGTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 ACCGGCCACTCTGTTGAATGAAGCAGGTAAAGATGCTTTAAAATCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124001 ACCGGCCACTCTGTTGAATGAAGCAGGTAAAGATGCTTTAAAATCCTCTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 AAACCATTAAGTCTAGAGAAGAGGGAAAGGCAACCCAGCAGAGGGAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124051 AAACCATTAAGTCTAGAGAAGAGGGAAAGGCAACCCAGCAGAGGGAGGTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GAAAGCTTCCATTCTGAGACTGACCAGGATACGCCCTGGCTGCTGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124101 GAAAGCTTCCATTCTGAGACTGACCAGGATACGCCCTGGCTGCTGCCCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GGAGAAAACCCCCTTTGGCTCCGCTAAACCCTTGGATTATGTGGAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124151 GGAGAAAACCCCCTTTGGCTCCGCTAAACCCTTGGATTATGTGGAGATTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 ACAAGGTCAACAAAGATGGTGCATTATCATTGCTACCAAAACAGAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124201 ACAAGGTCAACAAAGATGGTGCATTATCATTGCTACCAAAACAGAGAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 AACAGCGGCAAGCCCAAGAAGCCCGGGACTCCTGAGAACAATAAGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124251 AACAGCGGCAAGCCCAAGAAGCCCGGGACTCCTGAGAACAATAAGGAGTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 TGCCAAGGTGTCCGGGGTCATGGATAACAACATCCTGGTGTTGGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124301 TGCCAAGGTGTCCGGGGTCATGGATAACAACATCCTGGTGTTGGTGCCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 ATCCACATGCTAAAAACGTGGCTTGCTTTGAAGAATCAGCCAAAGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124351 ATCCACATGCTAAAAACGTGGCTTGCTTTGAAGAATCAGCCAAAGAGGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 CCACCATCACTTGAACAGAATCAAGCTGAGAAAGCCCTGGCCAACTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124401 CCACCATCACTTGAACAGAATCAAGCTGAGAAAGCCCTGGCCAACTTCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TGCAACATCAAGCAAGTGCAGGCTCCAGCTGGGTGGTTTGGATTACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124451 TGCAACATCAAGCAAGTGCAGGCTCCAGCTGGGTGGTTTGGATTACCTGG

   1900     .    :    .    :    .
   1838 ATCCCGCATGTTTTACACACTCCTTTCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 124501 ATCCCGCATGTTTTACACACTCCTTTCAC