seq1 = pF1KB8361.tfa, 432 bp
seq2 = pF1KB8361/gi568815597r_19875704.tfa (gi568815597r:19875704_20078773), 203070 bp

>pF1KB8361 432
>gi568815597r:19875704_20078773 (Chr1)

(complement)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-185  (100250-100394)   100% ->
186-292  (100653-100759)   100% ->
293-432  (102931-103070)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGACCCTCCTACTGTTGGCAGTGATCATGATCTTTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGAAGACCCTCCTACTGTTGGCAGTGATCATGATCTTTGGTA...CAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCTACTGCAGGCCCATGGGAATTTGGTGAATTTCCACAGAATGATCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTACTGCAGGCCCATGGGAATTTGGTGAATTTCCACAGAATGATCAAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGACGACAGGAAAGGAAGCCGCACTCAGTTATGGCTTCTACGGCTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGACGACAGGAAAGGAAGCCGCACTCAGTTATGGCTTCTACGGCTGCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTGGCGTGGGTGGCAGAGGATCCCCCAAGGATGCAACGGATCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100351 TGTGGCGTGGGTGGCAGAGGATCCCCCAAGGATGCAACGGATCGGTG...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    186    CTGCTGTGTCACTCATGACTGTTGCTACAAACGTCTGGAGAAACGTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100650 CAGCTGCTGTGTCACTCATGACTGTTGCTACAAACGTCTGGAGAAACGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GATGTGGCACCAAATTTCTGAGCTACAAGTTTAGCAACTCGGGGAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100700 GATGTGGCACCAAATTTCTGAGCTACAAGTTTAGCAACTCGGGGAGCAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCACCTGTG         CAAAACAGGACTCCTGCAGAAGTCAACTGTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100750 ATCACCTGTGGTA...CAGCAAAACAGGACTCCTGCAGAAGTCAACTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAGTGTGATAAGGCTGCTGCCACCTGTTTTGCTAGAAACAAGACGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102962 TGAGTGTGATAAGGCTGCTGCCACCTGTTTTGCTAGAAACAAGACGACCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAATAAAAAGTACCAGTACTATTCCAATAAACACTGCAGAGGGAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103012 ACAATAAAAAGTACCAGTACTATTCCAATAAACACTGCAGAGGGAGCACC

    450     .
    424 CCTCGTTGC
        |||||||||
 103062 CCTCGTTGC