seq1 = pF1KB8351.tfa, 822 bp
seq2 = pF1KB8351/gi568815587r_1177042.tfa (gi568815587r:1177042_1395795), 218754 bp

>pF1KB8351 822
>gi568815587r:1177042_1395795 (Chr11)

(complement)

1-33  (86298-86330)   100% ->
34-183  (100002-100151)   100% ->
184-366  (105387-105569)   100% ->
367-519  (107020-107172)   100% ->
520-610  (109704-109794)   100% ->
611-822  (118543-118754)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACCACCGTCAGCACTCAGCGCGGGCCG         GTGTACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  86298 ATGGCGACCACCGTCAGCACTCAGCGCGGGCCGGTG...CAGGTGTACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CGGTGAGCTCCCGCAGGACTTCCTCCGCATCACGCCCACACAGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100010 CGGTGAGCTCCCGCAGGACTTCCTCCGCATCACGCCCACACAGCAGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGCAGGTCCAGCTGGACGCCCAGGCGGCCCAGCAGCTGCAGTACGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100060 GGCAGGTCCAGCTGGACGCCCAGGCGGCCCAGCAGCTGCAGTACGGAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGTGGGCACCGTGGGCCGACTGAACATCACGGTGGTACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100110 GCAGTGGGCACCGTGGGCCGACTGAACATCACGGTGGTACAGGTG...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  GCAAAGTTGGCCAAGAATTACGGCATGACCCGCATGGACCCCTACTGCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105386 GGCAAAGTTGGCCAAGAATTACGGCATGACCCGCATGGACCCCTACTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GACTGCGCCTGGGCTACGCGGTGTACGAGACGCCCACGGCACACAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105436 GACTGCGCCTGGGCTACGCGGTGTACGAGACGCCCACGGCACACAATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCAAGAATCCCCGCTGGAATAAGGTCATCCACTGCACGGTGCCCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105486 GCCAAGAATCCCCGCTGGAATAAGGTCATCCACTGCACGGTGCCCCCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGTGGACTCTTTCTATCTCGAGATCTTCGATGAG         AGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 105536 CGTGGACTCTTTCTATCTCGAGATCTTCGATGAGGTG...CAGAGAGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTCCATGGACGACCGCATTGCCTGGACCCACATCACCATCCCGGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107027 TCTCCATGGACGACCGCATTGCCTGGACCCACATCACCATCCCGGAGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGAGGCAGGGCAAGGTGGAGGACAAGTGGTACAGCCTGAGCGGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107077 CTGAGGCAGGGCAAGGTGGAGGACAAGTGGTACAGCCTGAGCGGGAGGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGGGACGACAAGGAGGGCATGATCAACCTCGTCATGTCCTACGCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 107127 GGGGGACGACAAGGAGGGCATGATCAACCTCGTCATGTCCTACGCGGTG.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    520      CTGCTTCCAGCTGCCATGGTGATGCCACCCCAGCCCGTGGTCCTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107177 ..CAGCTGCTTCCAGCTGCCATGGTGATGCCACCCCAGCCCGTGGTCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGCCAACAGTGTACCAGCAGGGCGTTGGCTATGTGCCCATCACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 109749 ATGCCAACAGTGTACCAGCAGGGCGTTGGCTATGTGCCCATCACAGGTG.

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    611      GGATGCCCGCTGTCTGTAGCCCCGGCATGGTGCCCGTGGCCCTGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109799 ..CAGGGATGCCCGCTGTCTGTAGCCCCGGCATGGTGCCCGTGGCCCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCCCGGCCGCCGTGAACGCCCAGCCCCGCTGTAGCGAGGAGGACCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118588 CCCCGGCCGCCGTGAACGCCCAGCCCCGCTGTAGCGAGGAGGACCTGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCATCCAGGACATGTTCCCCAACATGGACCAGGAGGTGATCCGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118638 GCCATCCAGGACATGTTCCCCAACATGGACCAGGAGGTGATCCGCTCCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCTGGAAGCCCAGCGAGGGAACAAGGATGCCGCCATCAACTCCCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118688 GCTGGAAGCCCAGCGAGGGAACAAGGATGCCGCCATCAACTCCCTGCTGC

    850     .    :    .
    806 AGATGGGGGAGGAGCCA
        |||||||||||||||||
 118738 AGATGGGGGAGGAGCCA