seq1 = pF1KB8334.tfa, 564 bp
seq2 = pF1KB8334/gi568815575r_52597991.tfa (gi568815575r:52597991_52805749), 207759 bp

>pF1KB8334 564
>gi568815575r:52597991_52805749 (ChrX)

1-69  (154691-154759)   100% ->
70-184  (155198-155312)   99% ->
185-280  (155848-155943)   100% ->
281-330  (157810-157859)   100% ->
331-466  (159864-159999)   100% ->
467-564  (162354-162451)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGGAGACGACGCCTTTGCAAGGAGACCCACGGTTGGTGCTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154691 ATGAACGGAGACGACGCCTTTGCAAGGAGACCCACGGTTGGTGCTCAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCAGAGAAGATCCAAAAG         GCCTTCGATGATATTGCCAAAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 154741 ACCAGAGAAGATCCAAAAGGTG...TAGGCCTTCGATGATATTGCCAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTTCTCTAAGGAAGAGTGGGAAAAGATGAAAGCCTCAGAGAAAATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 155220 ACTTCTCTAAGGAAGAGTGGGAAAAGATGAAAGCCTCGGAGAAAATCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGTGTATATGAAGAGAAAGTATGAGGCTATGACTAAACTAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 155270 TATGTGTATATGAAGAGAAAGTATGAGGCTATGACTAAACTAGGTA...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   GTTTCAAGGCCACCCTCCCACCTTTCATGTGTAATAAACGGGCCGAAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155846 AGGTTTCAAGGCCACCCTCCCACCTTTCATGTGTAATAAACGGGCCGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTTCCAGGGGAATGATTTGGATAATGACCCTAACCGTGGGAATCAGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 155896 ACTTCCAGGGGAATGATTTGGATAATGACCCTAACCGTGGGAATCAGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281        TTGAACGTCCTCAGATGACTTTCGGCAGGCTCCAGGGAATCTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155946 G...CAGTTGAACGTCCTCAGATGACTTTCGGCAGGCTCCAGGGAATCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCGAAG         ATCATGCCCAAGAAGCCAGCAGAGGAAGGAAATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157853 CCCGAAGGTG...AAGATCATGCCCAAGAAGCCAGCAGAGGAAGGAAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATTCGGAGGAAGTGCCAGAAGCATCTGGCCCACAAAATGATGGGAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159898 ATTCGGAGGAAGTGCCAGAAGCATCTGGCCCACAAAATGATGGGAAAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGTGCCCCCCGGGAAAACCAACTACCTCTGAGAAGATTCACGAGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159948 CTGTGCCCCCCGGGAAAACCAACTACCTCTGAGAAGATTCACGAGAGATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TG         GACCCAAAAGGGGGGAACATGCCTGGACCCACAGACTGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159998 TGGTA...CAGGACCCAAAAGGGGGGAACATGCCTGGACCCACAGACTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTGAGAGAAAACAGCTGGTGATTTATGAAGAGATCAGCGACCCTGAGGAA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162393 GTGAGAGAAAACAGCTGGTGATTTATGAAGAGATCAGCGACCCTGAGGAA

    600     .
    556 GATGACGAG
        |||||||||
 162443 GATGACGAG