seq1 = pF1KB8333.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KB8333/gi568815584r_24190862.tfa (gi568815584r:24190862_24399106), 208245 bp

>pF1KB8333 939
>gi568815584r:24190862_24399106 (Chr14)

(complement)

1-150  (100001-100150)   100% ->
151-294  (102226-102369)   100% ->
295-374  (102519-102598)   100% ->
375-507  (106323-106455)   100% ->
508-654  (106777-106923)   100% ->
655-724  (107482-107551)   100% ->
725-805  (107888-107968)   100% ->
806-939  (108112-108245)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCTCCCATGAATGGCCAAGTGTGTGTGGTGACTGGTGCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCTCCCATGAATGGCCAAGTGTGTGTGGTGACTGGTGCCTCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGTATTGGCCGTGGCATTGCCTTGCAGCTCTGCAAAGCAGGCGCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGTATTGGCCGTGGCATTGCCTTGCAGCTCTGCAAAGCAGGCGCCACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTACATCACTGGCCGCCATCTGGACACCCTTCGCGTTGTTGCTCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTACATCACTGGCCGCCATCTGGACACCCTTCGCGTTGTTGCTCAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151          GCACAATCCCTCGGGGGCCAATGTGTGCCTGTGGTGTGCGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTG...CAGGCACAATCCCTCGGGGGCCAATGTGTGCCTGTGGTGTGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCAAGCCAGGAGAGTGAAGTGCGAAGCCTGTTTGAGCAAGTGGATCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102267 TTCAAGCCAGGAGAGTGAAGTGCGAAGCCTGTTTGAGCAAGTGGATCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AACAGCAAGGGCGTCTAGATGTGCTGGTCAACAATGCTTATGCAGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102317 AACAGCAAGGGCGTCTAGATGTGCTGGTCAACAATGCTTATGCAGGGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAG         ACGATCCTGAACACCAGGAATAAGGCATTCTGGGAAAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102367 CAGGTA...CAGACGATCCTGAACACCAGGAATAAGGCATTCTGGGAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCTGCCTCCATGTGGGATGATATCAACAACGTCGGACTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 102557 CCCTGCCTCCATGTGGGATGATATCAACAACGTCGGACTCAGGTG...TA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    375  AGGCCACTACTTTTGCTCAGTGTATGGGGCACGGCTGATGGTACCAGCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106322 GAGGCCACTACTTTTGCTCAGTGTATGGGGCACGGCTGATGGTACCAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCCAGGGGCTCATCGTGGTCATCTCCTCCCCAGGAAGCCTGCAGTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106372 GGCCAGGGGCTCATCGTGGTCATCTCCTCCCCAGGAAGCCTGCAGTATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTCAATGTCCCCTATGGTGTGGGCAAAGCTGCG         TGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 106422 GTTCAATGTCCCCTATGGTGTGGGCAAAGCTGCGGTG...CAGTGTGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGCTGGCTGCTGACTGTGCCCACGAGCTGCGGCGCCATGGGGTCAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106784 AGCTGGCTGCTGACTGTGCCCACGAGCTGCGGCGCCATGGGGTCAGCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGTCTCTGTGGCCGGGGATTGTGCAGACAGAACTGCTGAAGGAGCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106834 GTGTCTCTGTGGCCGGGGATTGTGCAGACAGAACTGCTGAAGGAGCATAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGCAAAGGAGGAGGTCCTGCAGGATCCTGTGTTGAAGCAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106884 GGCAAAGGAGGAGGTCCTGCAGGATCCTGTGTTGAAGCAGGTT...CAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCAAATCAGCCTTCTCATCTGCGGAAACCACAGAATTGAGTGGCAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107483 TCAAATCAGCCTTCTCATCTGCGGAAACCACAGAATTGAGTGGCAAATGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGGTGGCTTTGGCAACAG         ATCCCAATATCCTGAGCCTGAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107533 GTGGTGGCTTTGGCAACAGGTG...CAGATCCCAATATCCTGAGCCTGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGGTAAGGTGCTGCCATCCTGTGACCTTGCTCGACGCTATGGCCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107910 TGGTAAGGTGCTGCCATCCTGTGACCTTGCTCGACGCTATGGCCTTCGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATGTGGACG         GCCGCCCCGTCCAAGACTATTTGTCTTTGAGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 107960 ATGTGGACGGTG...CAGGCCGCCCCGTCCAAGACTATTTGTCTTTGAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TCTGTTCTCTCACACGTGTCCGGCCTGGGCTGGCTGGCCTCCTACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108144 TCTGTTCTCTCACACGTGTCCGGCCTGGGCTGGCTGGCCTCCTACCTGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTCCTTCCTCCGTGTGCCCAGGTGGATTATTGCCCTCTACACTAGCAAGT
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 108194 CTCCTTCCTCCGTGTGCCCAAGTGGATTATTGCCCTCTACACTAGCAAGT

   1000 
    938 TC
        ||
 108244 TC