seq1 = pF1KB8320.tfa, 387 bp
seq2 = pF1KB8320/gi568815596r_64988496.tfa (gi568815596r:64988496_65204806), 216311 bp

>pF1KB8320 387
>gi568815596r:64988496_65204806 (Chr2)

(complement)

1-23  (74892-74914)   100% ->
24-96  (100001-100073)   100% ->
97-192  (106741-106836)   100% ->
193-387  (116117-116311)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAGCATGAATCCCGAATA         TGATTATTTATTCAAGTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
  74892 ATGTCCAGCATGAATCCCGAATAGTG...CAGTGATTATTTATTCAAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACTTCTGATTGGCGACTCAGGGGTTGGAAAGTCTTGCCTTCTTCTTAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 ACTTCTGATTGGCGACTCAGGGGTTGGAAAGTCTTGCCTTCTTCTTAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGCA         GATGATACATATACAGAAAGCTACATCAGCACAATT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 TTGCAGTA...CAGGATGATACATATACAGAAAGCTACATCAGCACAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GGTGTGGATTTCAAAATAAGAACTATAGAGTTAGACGGGAAAACAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106777 GGTGTGGATTTCAAAATAAGAACTATAGAGTTAGACGGGAAAACAATCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTTCAAATA         GAATTTGCTGATTCCCTTGGAATTCCGTTTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106827 GCTTCAAATAGTA...TAGGAATTTGCTGATTCCCTTGGAATTCCGTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGGAAACCAGTGCTAAGAATGCAACGAATGTAGAACAGTCTTTCATGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116148 TGGAAACCAGTGCTAAGAATGCAACGAATGTAGAACAGTCTTTCATGACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATGGCAGCTGAGATTAAAAAGCGAATGGGTCCCGGAGCAACAGCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116198 ATGGCAGCTGAGATTAAAAAGCGAATGGGTCCCGGAGCAACAGCTGGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGCTGAGAAGTCCAATGTTAAAATTCAGAGCACTCCAGTCAAGCAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116248 TGCTGAGAAGTCCAATGTTAAAATTCAGAGCACTCCAGTCAAGCAGTCAG

    400     .    :
    374 GTGGAGGTTGCTGC
        ||||||||||||||
 116298 GTGGAGGTTGCTGC