seq1 = pF1KB8315.tfa, 762 bp
seq2 = pF1KB8315/gi568815575f_154279485.tfa (gi568815575f:154279485_154481194), 201710 bp

>pF1KB8315 762
>gi568815575f:154279485_154481194 (ChrX)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-187  (100206-100310)   100% ->
188-265  (100458-100535)   100% ->
266-399  (100750-100883)   100% ->
400-449  (101269-101318)   100% ->
450-762  (101398-101710)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAACTACGCAGATCTTTCGGATACCGAGCTGACCACCTTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAACTACGCAGATCTTTCGGATACCGAGCTGACCACCTTGCTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGTACAACATCCCGCACGGGCCTGTAGTAG         GATCAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 CCGGTACAACATCCCGCACGGGCCTGTAGTAGGTA...CAGGATCAACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTAGGCTTTACGAGAAGAAGATCTTCGAGTACGAGACCCAGAGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100215 GTAGGCTTTACGAGAAGAAGATCTTCGAGTACGAGACCCAGAGGCGGCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCTCGCCCCCCAGCTCGTCCGCCGCCTCCTCTTATAGCTTCTCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100265 CTCTCGCCCCCCAGCTCGTCCGCCGCCTCCTCTTATAGCTTCTCTGGTG.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188      ACTTGAATTCGACTAGAGGGGATGCAGATATGTATGATCTTCCCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100315 ..CAGACTTGAATTCGACTAGAGGGGATGCAGATATGTATGATCTTCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAAGAGGACGCTTTACTCTACCAGAGCAAGG         GCTACAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100503 AGAAAGAGGACGCTTTACTCTACCAGAGCAAGGGTA...AAGGCTACAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACGACTACTATGAAGAGAGCTACTTCACCACCAGGACTTATGGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100758 GACGACTACTATGAAGAGAGCTACTTCACCACCAGGACTTATGGGGAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGAGTCTGCCGGCCCGTCCAGGGCTGTCCGCCAGTCAGTGACTTCATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100808 CGAGTCTGCCGGCCCGTCCAGGGCTGTCCGCCAGTCAGTGACTTCATTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGATGCTGACGCTTTCCATCACCAG         GTGCATGATGACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100858 CAGATGCTGACGCTTTCCATCACCAGGTG...CAGGTGCATGATGACGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTTTTGTCTTCTTCTGAAGAGGAGTGCAAGGATAG         GGAACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101284 CTTTTGTCTTCTTCTGAAGAGGAGTGCAAGGATAGGTG...CAGGGAACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CCCCATGTACGGCCGGGACAGTGCCTACCAGAGCATCACGCACTACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101404 CCCCATGTACGGCCGGGACAGTGCCTACCAGAGCATCACGCACTACCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTGTTTCAGCCTCCAGGAGCTCCCTGGACCTGTCCTATTATCCTACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101454 CTGTTTCAGCCTCCAGGAGCTCCCTGGACCTGTCCTATTATCCTACTTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCCTCCACCTCTTTTATGTCCTCCTCATCATCTTCCTCTTCATGGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101504 TCCTCCACCTCTTTTATGTCCTCCTCATCATCTTCCTCTTCATGGCTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCGCCGTGCCATCCGGCCTGAAAACCGTGCTCCTGGGGCTGGGCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101554 CCGCCGTGCCATCCGGCCTGAAAACCGTGCTCCTGGGGCTGGGCTGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGATCGCCAGGTCCCGCTCTGGGGCCAGCTGCTGCTTTTCCTGGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101604 AGGATCGCCAGGTCCCGCTCTGGGGCCAGCTGCTGCTTTTCCTGGTCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGATCGTCCTCTTCTTCATTTACCACTTCATGCAGGCTGAAGAAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101654 GTGATCGTCCTCTTCTTCATTTACCACTTCATGCAGGCTGAAGAAGGCAA

    800     .
    756 CCCCTTC
        |||||||
 101704 CCCCTTC