seq1 = pF1KB8306.tfa, 426 bp
seq2 = pF1KB8306/gi568815577f_29033345.tfa (gi568815577f:29033345_29274889), 241545 bp

>pF1KB8306 426
>gi568815577f:29033345_29274889 (Chr21)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-132  (115845-115906)   100% ->
133-248  (126597-126712)   98% ->
249-426  (141368-141545)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCAGCACAGCCAGGGTACCTGCTGACAAGCCTGTACGCATCGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCAGCACAGCCAGGGTACCTGCTGACAAGCCTGTACGCATCGCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAGCCTCAATGACGCCTCAG         ATGATACACCCCCTGAAGACT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 TAGCCTCAATGACGCCTCAGGTA...TAGATGATACACCCCCTGAAGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATTCCTTTGGTCTTTCCAGAATTAGACCAGCAGCTACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 115866 CCATTCCTTTGGTCTTTCCAGAATTAGACCAGCAGCTACAGGTA...AAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCCCTGCCGCCTTGTCATGACTCCGAGGAATCCATGGAGGTGTTCAGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 126597 CCCCTGCCGCCTTGTCATGACTCCGAGGAATCCATGGAGGTGTTCAAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCACTGCCAAATAGCAGAAGAATACCTTGAGGTCAAAAAGGAAATCACCC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 126647 GCACTGCCAAATAGCAGAAGAATACCATGAGGTCAAAAAGGAAATCACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCTTGAGCAAAGGAA         GAAGGAGCTCATTGCCAAGTTAGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 126697 TGCTTGAGCAAAGGAAGTA...CAGGAAGGAGCTCATTGCCAAGTTAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CAGGCAGAAGAGGAGAAGGTGGATGCTGCTGAGCTGGTTCGGGAATTCGA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141393 CAGGCAGAAAAGGAGAAGGTGGATGCTGCTGAGCTGGTTCGGGAATTCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCTCTGACGGAGGAGAATCGGACGTTGAGGTTGGCCCAGTCTCAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141443 GGCTCTGACGGAGGAGAATCGGACGTTGAGGTTGGCCCAGTCTCAATGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGAACAACTGGAGAAACTTCGAATACAGTATCAGAAGAGGCAGGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141493 TGGAACAACTGGAGAAACTTCGAATACAGTATCAGAAGAGGCAGGGCTCG

    450 
    424 TCC
        |||
 141543 TCC