seq1 = pF1KB8272.tfa, 483 bp
seq2 = pF1KB8272/gi568815582r_2671475.tfa (gi568815582r:2671475_2877128), 205654 bp

>pF1KB8272 483
>gi568815582r:2671475_2877128 (Chr16)

(complement)

1-138  (100000-100136)   99% ->
139-244  (101573-101678)   100% ->
245-353  (105027-105135)   100% ->
354-483  (105525-105654)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGTGTTCCTCATGATCCGGCGCCACAAGACCACCATCTTCACGGA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGACGTGTTCCTCATGATCCGGCGCCACAAGACCACCATCTTCACGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCAAGGAGTCCAGCACGGTGTTCGAACTGAAGCGCATCGTCGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 CGCCAAGGAGTCCAGCACGGTGTTCGAACTGAAGCGCATCGTCGAGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTCAAGCGGCCTCCTGACGAGCAGCGGCTGTACAAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100099 TCCTCAAGCGGCCTCCTGACGAGCAGCGGCTGTACAAGGTG...CAGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCAACTCTTGGATGATGGCAAGACACTGGGCGAGTGTGGCTTCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101576 GACCAACTCTTGGATGATGGCAAGACACTGGGCGAGTGTGGCTTCACCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAAACAGCACGGCCACAGGCCCCAGCCACAGTGGGGCTGGCCTTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101626 TCAAACAGCACGGCCACAGGCCCCAGCCACAGTGGGGCTGGCCTTCCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAG         ATGACACCTTTGAGGCCCTGTGCATCGAGCCGTTTTCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101676 CAGGTG...CAGATGACACCTTTGAGGCCCTGTGCATCGAGCCGTTTTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCCCGCCAGAGCTGCCCGATGTGATGAAGCCCCAGGACTCGGGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105065 AGCCCGCCAGAGCTGCCCGATGTGATGAAGCCCCAGGACTCGGGAAGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCCAATGAACAAGCCGTGCA         CCTGCATGTCCACTCCCAGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105115 TGCCAATGAACAAGCCGTGCAGTG...TAGCCTGCATGTCCACTCCCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGATGGCCAAGAACAGAAACACAAGCTGGAGCCAGTGTCCTGGTTTGACA
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105545 CGATGGCCAAGAGCAGAAACACAAGCTGGAGCCAGTGTCCTGGTTTGACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCATGTTCAACGAGGGAACCCCAAGACGGACCCACACAGGTCCACCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105595 GCATGTTCAACGAGGGAACCCCAAGACGGACCCACACAGGTCCACCCACG

    500     .    :
    474 CTGGGGGCTG
        ||||||||||
 105645 CTGGGGGCTG