seq1 = pF1KB8265.tfa, 1353 bp
seq2 = pF1KB8265/gi568815586f_49169464.tfa (gi568815586f:49169464_49373184), 203721 bp

>pF1KB8265 1353
>gi568815586f:49169464_49373184 (Chr12)

(complement)

1-226  (186350-186574)   97% ->
227-375  (186727-186875)   97% ->
376-1353  (187195-188172)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGG
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186350 A GCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTGCCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186399 CAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTGCCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGACTCCTTCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 186449 GCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGATTCCTTCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCTTCTTCAGTGAGACGGGCGCTGGCAAGCACGTGCCCCGGGCTGTGTT
        |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||
 186499 ACCTTCTTCAGTGAGACGGGGGCTGGCAAGCATGTGCCCCGGGCAGTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTAGACTTGGAACCCACAGTCATTG         ATGAAGTTCGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 186549 TGTAGACTTGGAACCCACAGTCATTGGTG...CAGATGAAGTTCGCACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAGCTCATCACAGGCAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||
 186742 GCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAACTTATCACAGGCAAAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATGCTGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186792 GATGCTGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATTGACCTTGTGTTGGACCGAATTCGCAAGCTG         GCTGACC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| ||||
 186842 CATTGACCTCGTGTTGGACCGAATTCGCAAGCTGGTA...TAGGCCGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGA
        ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187202 AGTGCACGGGTCTCCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACTGGTTCTGGGTTCACCTCCCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 187252 ACTGGTTCTGGGTTCACCTCGCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGGCAAGAAATCCAAGCTGGAGTTCTCCATTTACCCGGCACCCCAGGTTT
        ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
 187302 TGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCTATTTACCCGGCGCCCCAGGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187352 CCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGGAGCACTCTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187402 CTGGAGCACTCTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCAACCTACACTAACCTTA
        |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |
 187452 CATCTGTCGTAGAAACCTCGATATTGAGCGTCCAACCTATACTAACCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACCGCCTTATTA GCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATT
        |  | -||| ||-| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
 187502 ATAGG TTAATAGGTCAAATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    732 TGATGGAGCCCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187551 TGATGGAGCCCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    782 CCTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACATATGCCCCTGTCATCTCT
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187601 CCTATCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACATATGCCCCTGTCATCTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    832 GCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187651 GCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    882 TTGCTTTGAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187701 TTGCTTTGAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    932 AATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGGTGACGTGGTTCCCAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187751 AATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGGTGACGTGGTTCCCAAAGAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    982 GTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGCAGCATCCAGTTTGT
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||
 187801 GTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAGACCAAGCGTACCATCCAGTTTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1032 GGATTGGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187851 GGATTGGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1082 CTGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAGGTACAGAGAGCTGTGTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187901 CTGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAGGTACAGAGAGCTGTGTGCATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1132 CTGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187951 CTGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1182 GTTTGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGT GGGT
        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||-|||-
 188001 GTTTGACCTGATGTATGCCAAACGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTTGGG 

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1231 GAGGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAGAGGCCCGTGAAGATATGGCTGC
        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||
 188050 GAGGGGATGGAGGAAGGTGAGTTTTCAGAGGCCCGTGAGGACATGGCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1281 CCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188100 CCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGG

   1350     .    :    .    :
   1331 GTGAGGAAGAAGGAGAGGAATAC
        |||||||||||||||||||||||
 188150 GTGAGGAAGAAGGAGAGGAATAC