seq1 = pF1KB8254.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KB8254/gi568815594r_46623833.tfa (gi568815594r:46623833_46824408), 200576 bp

>pF1KB8254 576
>gi568815594r:46623833_46824408 (Chr4)

(complement)

1-576  (100001-100576)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGCCATCAAGTGTGTGGTGGTGGGAGACGGAGCTGTAGGTAAAAC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGCCATCAAGTTTGTGGTGGTGGGAGACGGAGCTGTAGGTAAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGCCTACTGATCAGTTACACAACCAATGCATTTCCTGGAGAATATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTGCCTACTGATCAGTTACACAACCAATGCATTTCCTGGAGAATATATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTACTGTCTTTGACAATTATTCTGCCAATGTTATGGTAGATGGAAAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTACTGTCTTTGACAATTATTCTGCCAATGTTATGGTAGATGGAAAACCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGAATCTGGGCTTATGGGATACAGCTGGACAAGAAGATTATGACAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGAATCTGGGCTTATGGGATACAGCTGGACAAGAAGATTATGACAGATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACGCCCCCTATCCTATCCGCAAACAGATGTGTTCTTAATTTGCTTTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACGCCCCCTATCCTATCCGCAAACAGATGTGTTCTTAATTTGCTTTTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGTGAGTCCTGCATCATTTGAAAATGTCCGTGCAAAGTGGTATCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGTGAGTCCTGCATCATTTGAAAATGTCCGTGCAAAGTGGTATCCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCGGCACCACTGTCCCAACACTCCCATCATCCTAGTGGGAACTAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCGGCACCACTGTCCCAACACTCCCATCATCCTAGTGGGAACTAAACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGATCTTAGGGATGATAAAGACACGATCGAGAAACTGAAGGAGAAGAAGC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGATCTTAGGGATGATAAAGACCCGATCGAGAAACTGAAGGAGAAGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGACTCCCATCACCTATCCGCAGGGTCTAGCCATGGCTAAGGAGATTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGACTCCCATCACCTATCCGCAGGGTCTAGCCATGGCTAAGGAGATTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGTAAAATACCTGGAGTGCTCGGCGCTCACACAGCGAGGCCTCAAGAC
        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
 100451 GCTGTAAAATACCTGGAGCGCTCGGCGCTCACACAGCGAGGCATCAAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTGTTTGACGAAGCGATCCGAGCAGTCCTCTGCCCGCCTCCCGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTGTTTGACGAAGCGATCCGAGCAGTCCTCTGCCCGCCTCCCGTGAAGA

    550     .    :    .    :    .
    551 AGAGGAAGAGAAAATGCCTGCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGAGGAAGAGAAAATGCCTGCTGTTG