seq1 = pF1KB8247.tfa, 771 bp
seq2 = pF1KB8247/gi568815579f_38274881.tfa (gi568815579f:38274881_38483387), 208507 bp

>pF1KB8247 771
>gi568815579f:38274881_38483387 (Chr19)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-154  (101280-101352)   100% ->
155-257  (101472-101574)   100% ->
258-423  (104360-104525)   100% ->
424-524  (106019-106119)   100% ->
525-636  (107237-107348)   100% ->
637-771  (108373-108507)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACGAGCAACTCAAGGGCGAGTGGAACCGTAAAAGCCCCAATCTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACGAGCAACTCAAGGGCGAGTGGAACCGTAAAAGCCCCAATCTTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGTGCGGGGAAGAGCTGGGTCGACTCAAG         CTAGTTCTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 CAAGTGCGGGGAAGAGCTGGGTCGACTCAAGGTA...CAGCTAGTTCTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGAGCTCAACTTCTTGCCAACCACAGGGACCAAGCTGACCAAACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101290 TGGAGCTCAACTTCTTGCCAACCACAGGGACCAAGCTGACCAAACAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTAATTCTGGCCC         GTGACATACTGGAGATCGGGGCCCAATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101340 CTAATTCTGGCCCGTG...CAGGTGACATACTGGAGATCGGGGCCCAATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAGCATCCTACGCAAGGACATCCCCTCCTTCGAGCGCTACATGGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101500 GAGCATCCTACGCAAGGACATCCCCTCCTTCGAGCGCTACATGGCCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAAATGCTACTACTTTGATTACAA         GGAGCAGCTCCCCGAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101550 TCAAATGCTACTACTTTGATTACAAGTG...CAGGGAGCAGCTCCCCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCAGCCTATATGCACCAGCTCTTGGGCCTCAACCTCCTCTTCCTGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104376 TCAGCCTATATGCACCAGCTCTTGGGCCTCAACCTCCTCTTCCTGCTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCAGAACCGGGTGGCTGAGTTCCACACGGAGTTGGAGCGGCTGCCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104426 CCAGAACCGGGTGGCTGAGTTCCACACGGAGTTGGAGCGGCTGCCTGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGACATACAGACCAATGTCTACATCAAGCACCCAGTGTCCCTGGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104476 AGGACATACAGACCAATGTCTACATCAAGCACCCAGTGTCCCTGGAGCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424          TACCTGATGGAGGGCAGCTACAACAAAGTGTTCCTGGCCAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104526 GTG...CAGTACCTGATGGAGGGCAGCTACAACAAAGTGTTCCTGGCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGGTAACATCCCCGCCGAGAGCTACACCTTCTTCATTGACATCCTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106060 GGGTAACATCCCCGCCGAGAGCTACACCTTCTTCATTGACATCCTGCTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACACTATCAG         GGATGAGATCGCTGGGTGCATCGAGAAGGCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106110 ACACTATCAGGTG...CAGGGATGAGATCGCTGGGTGCATCGAGAAGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TACGAGAAAATCCTTTTCACTGAGGCCACCCGGATCCTCTTCTTCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107268 TACGAGAAAATCCTTTTCACTGAGGCCACCCGGATCCTCTTCTTCAACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACCCAAAAAGATGACAGACTACGCCAAGAAG         CGAGGGTGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 107318 ACCCAAAAAGATGACAGACTACGCCAAGAAGGTG...CAGCGAGGGTGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCCTGGGCCCCAACAACTACTACAGTTTTGCCAGCCAGCAGCAGAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108383 TCCTGGGCCCCAACAACTACTACAGTTTTGCCAGCCAGCAGCAGAAGCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAAGACACCACCATTCCCTCCACAGAACTGGCCAAACAGGTCATCGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108433 GAAGACACCACCATTCCCTCCACAGAACTGGCCAAACAGGTCATCGAGTA

    800     .    :    .    :    .
    747 TGCCCGGCAGCTGGAGATGATCGTC
        |||||||||||||||||||||||||
 108483 TGCCCGGCAGCTGGAGATGATCGTC