seq1 = pF1KB8244.tfa, 1002 bp
seq2 = pF1KB8244/gi568815590r_66943236.tfa (gi568815590r:66943236_67161996), 218761 bp

>pF1KB8244 1002
>gi568815590r:66943236_67161996 (Chr8)

(complement)

1-143  (100001-100143)   100% ->
144-378  (102552-102786)   100% ->
379-507  (103786-103914)   100% ->
508-573  (104552-104617)   100% ->
574-659  (105393-105478)   100% ->
660-771  (110656-110767)   100% ->
772-920  (116037-116185)   100% ->
921-1002  (118680-118761)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGTCCGGGAGCGGTATGGCCCAGAAAACCTGGGAACTGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGTCCGGGAGCGGTATGGCCCAGAAAACCTGGGAACTGGCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACATGCAGGAAGCTCAGAGTATCGATGAAATCTACAAATACGACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACATGCAGGAAGCTCAGAGTATCGATGAAATCTACAAATACGACAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AACAGCAGCAAGAAATCCTGGCGGCGAAGCCCTGGACTAAGGA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100101 AACAGCAGCAAGAAATCCTGGCGGCGAAGCCCTGGACTAAGGAGTG...C

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    144   TCACCATTACTTTAAGTACTGCAAAATCTCAGCATTGGCTCTGCTGAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102550 AGTCACCATTACTTTAAGTACTGCAAAATCTCAGCATTGGCTCTGCTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATGGTGATGCATGCCAGATCGGGAGGCAACTTGGAAGTGATGGGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102600 GATGGTGATGCATGCCAGATCGGGAGGCAACTTGGAAGTGATGGGTCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCTAGGAAAGGTGGATGGTGAAACCATGATCATTATGGACAGTTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102650 TGCTAGGAAAGGTGGATGGTGAAACCATGATCATTATGGACAGTTTTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGCCTGTGGAGGGCACTGAAACCCGAGTAAATGCTCAGGCTGCTGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102700 TTGCCTGTGGAGGGCACTGAAACCCGAGTAAATGCTCAGGCTGCTGCATA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGAATACATGGCTGCATACATAGAAAATGCAAAACAG         GTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102750 TGAATACATGGCTGCATACATAGAAAATGCAAAACAGGTA...TAGGTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCCGCCTTGAAAATGCAATCGGGTGGTATCATAGCCACCCTGGCTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103790 GCCGCCTTGAAAATGCAATCGGGTGGTATCATAGCCACCCTGGCTATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGCTGGCTTTCTGGGATTGATGTTAGTACTCAGATGCTCAATCAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103840 TGCTGGCTTTCTGGGATTGATGTTAGTACTCAGATGCTCAATCAGCAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCAGGAACCATTTGTAGCAGTGGTG         ATTGATCCAACAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103890 CCAGGAACCATTTGTAGCAGTGGTGGTA...TAGATTGATCCAACAAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAATATCCGCAGGGAAAGTGAATCTTGGCGCCTTTAGGACATACCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104568 CAATATCCGCAGGGAAAGTGAATCTTGGCGCCTTTAGGACATACCCAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574          GGCTACAAACCTCCTGATGAAGGACCTTCTGAGTACCAGAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104618 GTA...TAGGGCTACAAACCTCCTGATGAAGGACCTTCTGAGTACCAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TATTCCACTTAATAAAATAGAAGATTTTGGTGTACACTGCAAACA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105434 TATTCCACTTAATAAAATAGAAGATTTTGGTGTACACTGCAAACAGTA..

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    660     ATATTATGCCTTAGAAGTCTCATATTTCAAATCCTCTTTGGATCGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105484 .TAGATATTATGCCTTAGAAGTCTCATATTTCAAATCCTCTTTGGATCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAATTGCTTGAGCTGTTGTGGAATAAATACTGGGTGAATACGTTGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110702 AAATTGCTTGAGCTGTTGTGGAATAAATACTGGGTGAATACGTTGAGTTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTCTAGCTTGCTTACT         AATGCAGACTATACCACTGGTCAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 110752 TTCTAGCTTGCTTACTGTA...CAGAATGCAGACTATACCACTGGTCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCTTTGATTTGTCTGAAAAGTTAGAGCAGTCAGAAGCCCAGCTGGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116062 TCTTTGATTTGTCTGAAAAGTTAGAGCAGTCAGAAGCCCAGCTGGGACGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGGAGTTTCATGTTGGGTTTAGAAACGCATGACCGAAAATCAGAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116112 GGGAGTTTCATGTTGGGTTTAGAAACGCATGACCGAAAATCAGAAGACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ACTTGCCAAAGCTACAAGAGACAG         CTGTAAAACTACCATAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 116162 ACTTGCCAAAGCTACAAGAGACAGGTA...CAGCTGTAAAACTACCATAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGCTATCCATGGATTGATGTCTCAGGTTATTAAGGATAAACTGTTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118697 AAGCTATCCATGGATTGATGTCTCAGGTTATTAAGGATAAACTGTTTAAT

   1050     .    :    .
    988 CAAATTAACATCTCT
        |||||||||||||||
 118747 CAAATTAACATCTCT