seq1 = pF1KB8242.tfa, 594 bp
seq2 = pF1KB8242/gi568815591r_88108507.tfa (gi568815591r:88108507_88320026), 211520 bp

>pF1KB8242 594
>gi568815591r:88108507_88320026 (Chr7)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-135  (101085-101168)   100% ->
136-205  (102836-102905)   100% ->
206-249  (109102-109145)   100% ->
250-397  (109897-110044)   100% ->
398-511  (110575-110688)   100% ->
512-570  (111462-111520)   100% ->
571-594  (113523-113546)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTACCCGGGGCATCCTGGCGCCGGCGGCGGGTACTACCCAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTACCCGGGGCATCCTGGCGCCGGCGGCGGGTACTACCCAGGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         TATGGAGGGGCTCCCGGAGGGCCTGCGTTTCCCGGACAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTA...CAGTATGGAGGGGCTCCCGGAGGGCCTGCGTTTCCCGGACAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCAGGATCCGCTGTATGGTTACTTTGCTGCTGTAGCTGGACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101125 CTCAGGATCCGCTGTATGGTTACTTTGCTGCTGTAGCTGGACAGGTT...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    136    GATGGGCAGATAGATGCTGATGAATTGCAGAGATGTCTGACACAGTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102833 AAGGATGGGCAGATAGATGCTGATGAATTGCAGAGATGTCTGACACAGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGGCATTGCTGGAGGATACAAAC         CTTTTAACCTGGAGACTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102883 TGGCATTGCTGGAGGATACAAACGTA...CAGCTTTTAACCTGGAGACTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GCCGGCTTATGGTTTCAATGCTGGAT         AGAGATATGTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 109120 GCCGGCTTATGGTTTCAATGCTGGATGTA...CAGAGAGATATGTCTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 ACAATGGGTTTCAATGAATTTAAAGAACTCTGGGCTGTACTGAATGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109912 ACAATGGGTTTCAATGAATTTAAAGAACTCTGGGCTGTACTGAATGGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GAGACAACACTTTATCAGTTTTGACACTGACAGGAGTGGAACAGTAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109962 GAGACAACACTTTATCAGTTTTGACACTGACAGGAGTGGAACAGTAGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CACAAGAATTGCAGAAGGCCCTGACAACAATGG         GATTTAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 110012 CACAAGAATTGCAGAAGGCCCTGACAACAATGGGTA...TAGGATTTAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TTGAGTCCCCAGGCTGTGAATTCAATTGCAAAACGATACAGCACCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110583 TTGAGTCCCCAGGCTGTGAATTCAATTGCAAAACGATACAGCACCAATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AAAGATCACCTTCGACGACTACATCGCCTGCTGCGTCAAACTGAGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110633 AAAGATCACCTTCGACGACTACATCGCCTGCTGCGTCAAACTGAGGGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTACAG         ACAGCTTTCGAAGACGGGATACTGCTCAGCAAGGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110683 TTACAGGTG...CAGACAGCTTTCGAAGACGGGATACTGCTCAGCAAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GTTGTGAATTTCCCATATGATGAT         TTCATTCAATGTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 111497 GTTGTGAATTTCCCATATGATGATGTA...CAGTTCATTCAATGTGTCAT

    650     .
    588 GAGTGTT
        |||||||
 113540 GAGTGTT