seq1 = pF1KB8238.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KB8238/gi568815582f_30934010.tfa (gi568815582f:30934010_31139800), 205791 bp

>pF1KB8238 891
>gi568815582f:30934010_31139800 (Chr16)

1-30  (99797-99826)   100% ->
31-132  (100004-100105)   100% ->
133-232  (100217-100316)   100% ->
233-307  (100453-100527)   100% ->
308-378  (100961-101031)   100% ->
379-487  (103917-104025)   100% ->
488-564  (104105-104181)   100% ->
565-702  (104501-104638)   100% ->
703-813  (105532-105642)   100% ->
814-891  (105714-105791)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGGACAGGACCCACGAGCTGAGACAG         GGGGATGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  99797 ATGCGGGACAGGACCCACGAGCTGAGACAGGTG...CAGGGGGATGACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTCGGACGAAGAGGACAAGGAGCGGGTCGCGCTGGTGGTGCACCCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100015 CTCGGACGAAGAGGACAAGGAGCGGGTCGCGCTGGTGGTGCACCCGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGGCACGGCTGGGGAGCCCGGACGAGGAGTTCTTCCACAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100065 CGGCACGGCTGGGGAGCCCGGACGAGGAGTTCTTCCACAAGGTA...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTCCGGACAATTCGGCAGACTATTGTCAAACTGGGGAATAAAGTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100217 GTCCGGACAATTCGGCAGACTATTGTCAAACTGGGGAATAAAGTCCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTTGGAGAAACAGCAGGTCACCATCCTGGCCACGCCCCTTCCCGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100267 GTTGGAGAAACAGCAGGTCACCATCCTGGCCACGCCCCTTCCCGAGGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233          GCATGAAGCAGGAGCTGCAGAACCTGCGCGATGAGATCAAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100317 GTG...CAGGCATGAAGCAGGAGCTGCAGAACCTGCGCGATGAGATCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CAGCTGGGGAGGGAGATCCGCCTGCAGCTGAAGG         CCATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100494 CAGCTGGGGAGGGAGATCCGCCTGCAGCTGAAGGGTG...CAGCCATAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GCCCCAGAAGGAGGAAGCTGATGAGAACTATAACTCCGTCAACACAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100968 GCCCCAGAAGGAGGAAGCTGATGAGAACTATAACTCCGTCAACACAAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGAGAAAAACCCAG         CATGGGGTCCTGTCCCAGCAATTCGTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101018 TGAGAAAAACCCAGGTG...TAGCATGGGGTCCTGTCCCAGCAATTCGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GAGCTCATCAACAAGTGCAATTCAATGCAGTCCGAATACCGGGAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103944 GAGCTCATCAACAAGTGCAATTCAATGCAGTCCGAATACCGGGAGAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CGTGGAGCGGATTCGGAGGCAGCTGAAGATCA         CCAATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 103994 CGTGGAGCGGATTCGGAGGCAGCTGAAGATCAGTG...CAGCCAATGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GGATGGTGTCTGATGAGGAGTTGGAGCAGATGCTGGACAGTGGGCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104114 GGATGGTGTCTGATGAGGAGTTGGAGCAGATGCTGGACAGTGGGCAAAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GAGGTGTTTGTGTCCAAT         ATCCTGAAGGACACGCAGGTGAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104164 GAGGTGTTTGTGTCCAATGTG...CAGATCCTGAAGGACACGCAGGTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TCGACAGGCCTTAAATGAGATCTCGGCCCGGCACAGTGAGATCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104524 TCGACAGGCCTTAAATGAGATCTCGGCCCGGCACAGTGAGATCCAGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TTGAACGCAGTATTCGTGAGCTGCACGACATATTCACTTTTCTGGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104574 TTGAACGCAGTATTCGTGAGCTGCACGACATATTCACTTTTCTGGCTACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GAAGTGGAGATGCAG         GGGGAGATGATCAATCGGATTGAGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104624 GAAGTGGAGATGCAGGTG...CAGGGGGAGATGATCAATCGGATTGAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GAACATCCTGAGCTCAGCGGACTACGTGGAACGTGGGCAGGAGCACGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105558 GAACATCCTGAGCTCAGCGGACTACGTGGAACGTGGGCAGGAGCACGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AGACGGCCCTGGAGAACCAGAAGAAGGCGAGGAAG         AAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105608 AGACGGCCCTGGAGAACCAGAAGAAGGCGAGGAAGGTG...CAGAAGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GTCTTGATTGCCATCTGTGTGTCCATCACCGTCGTCCTCCTAGCAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105720 GTCTTGATTGCCATCTGTGTGTCCATCACCGTCGTCCTCCTAGCAGTCAT

    950     .    :    .    :
    870 CATTGGCGTCACAGTGGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||
 105770 CATTGGCGTCACAGTGGTTGGA