seq1 = pF1KB8231.tfa, 633 bp
seq2 = pF1KB8231/gi568815583f_32543593.tfa (gi568815583f:32543593_32796606), 253014 bp

>pF1KB8231 633
>gi568815583f:32543593_32796606 (Chr15)

1-226  (100001-100226)   100% ->
227-376  (136174-136323)   100% ->
377-486  (140968-141077)   100% ->
487-540  (148118-148171)   100% ->
541-633  (152922-153014)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCTCCAGGATGGTCTCTACCATGCTATCTGGCCTACTGTTTTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCTCCAGGATGGTCTCTACCATGCTATCTGGCCTACTGTTTTGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCATCTGGATGGACTCCAGCATTTGCTTACAGCCCCCGGACCCCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCATCTGGATGGACTCCAGCATTTGCTTACAGCCCCCGGACCCCTGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGTCTCAGAAGCAGATATCCAGAGGCTGCTTCATGGTGTTATGGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTCTCAGAAGCAGATATCCAGAGGCTGCTTCATGGTGTTATGGAGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGGCATTGCCAGGCCCCGAGTGGAATATCCAGCTCACCAGGCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGGCATTGCCAGGCCCCGAGTGGAATATCCAGCTCACCAGGCCATGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTTGTGGGCCCCCAGAGCATTGAAG         GTGGAGCTCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100201 TCTTGTGGGCCCCCAGAGCATTGAAGGTA...CAGGTGGAGCTCATGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACTTCAGCATTTGGGTCCTTTTGGCAACATCCCCAACATCGTGGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136189 GACTTCAGCATTTGGGTCCTTTTGGCAACATCCCCAACATCGTGGCAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGACTGGAGACAACATTCCTAAGGACTTTAGTGAGGATCAGGGGTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136239 TTGACTGGAGACAACATTCCTAAGGACTTTAGTGAGGATCAGGGGTACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGACCCTCCAAATCCCTGTCCTGTTGGAAAAACAG         ATGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 136289 AGACCCTCCAAATCCCTGTCCTGTTGGAAAAACAGGTA...CAGATGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GATGTCTAGAAAACACCCCTGACACTGCAGAGTTCAGTCGAGAGTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140974 GATGTCTAGAAAACACCCCTGACACTGCAGAGTTCAGTCGAGAGTTCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTGCACCAGCATCTCTTTGATCCGGAACATGACTATCCAGGCTTGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141024 TTGCACCAGCATCTCTTTGATCCGGAACATGACTATCCAGGCTTGGGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTGG         AACAAGAAACTCCTTTACGAGAAGATGAAGGGAGGAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141074 GTGGGTA...TAGAACAAGAAACTCCTTTACGAGAAGATGAAGGGAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAGACGAAAGCGGAGG         AGTGTCAATCCATATCTACAAGGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 148155 AGAGACGAAAGCGGAGGGTA...CAGAGTGTCAATCCATATCTACAAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGAGACTGGATAATGTTGTTGCAAAGAAGTCTGTCCCCCATTTTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152946 CAGAGACTGGATAATGTTGTTGCAAAGAAGTCTGTCCCCCATTTTTCAGA

    650     .    :    .
    615 TGAGGATAAGGATCCAGAG
        |||||||||||||||||||
 152996 TGAGGATAAGGATCCAGAG