seq1 = pF1KB8225.tfa, 426 bp
seq2 = pF1KB8225/gi568815588r_100180135.tfa (gi568815588r:100180135_100386659), 206525 bp

>pF1KB8225 426
>gi568815588r:100180135_100386659 (Chr10)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-172  (100447-100563)   100% ->
173-292  (105607-105726)   100% ->
293-397  (106432-106536)   100% ->
398-426  (111167-111195)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCAGCCGAGGGCGTACTGGCGACCCGGAGTGATGAGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCAGCCGAGGGCGTACTGGCGACCCGGAGTGATGAGCCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGAG         ACGATGCCGCCGTGGAGACAGCTGAGGAAGCAAAGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGAGGTA...CAGACGATGCCGCCGTGGAGACAGCTGAGGAAGCAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCCTGCTGAAGCTGACATCACTGAGCTCTGCCGGGACATGTTCTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100483 AGCCTGCTGAAGCTGACATCACTGAGCTCTGCCGGGACATGTTCTCCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGCCACTTACCTGACTGGGGAACTGACGG         CCACCAGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100533 ATGGCCACTTACCTGACTGGGGAACTGACGGGTG...AAGCCACCAGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGACTATAAGCTCCTGGAAAATATGAATAAACTCACCAGCTTGAAGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105617 AGACTATAAGCTCCTGGAAAATATGAATAAACTCACCAGCTTGAAGTATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGAAATGAAAGATATTGCTATAAACATTAGTAGGAACTTAAAGGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105667 TTGAAATGAAAGATATTGCTATAAACATTAGTAGGAACTTAAAGGACTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AACCAGAAAT         ATGCTGGACTGCAGCCTTATCTGGATCAGAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105717 AACCAGAAATGTA...AAGATGCTGGACTGCAGCCTTATCTGGATCAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAATGTCATTGAAGAGCAGGTAGCAGCTCTTGAGCAGGCAGCTTACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106463 CAATGTCATTGAAGAGCAGGTAGCAGCTCTTGAGCAGGCAGCTTACAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGATGCATATTCAAAAAAACTGG         AAGCCAAGTACAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 106513 TGGATGCATATTCAAAAAAACTGGGTA...CAGAAGCCAAGTACAAGAAG

    450     .    :
    415 CTGGAGAAGCGA
        ||||||||||||
 111184 CTGGAGAAGCGA