seq1 = pF1KB8207.tfa, 876 bp
seq2 = pF1KB8207/gi568815591r_150954012.tfa (gi568815591r:150954012_151157848), 203837 bp

>pF1KB8207 876
>gi568815591r:150954012_151157848 (Chr7)

(complement)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-126  (100689-100777)   100% ->
127-194  (100874-100941)   100% ->
195-255  (101053-101113)   100% ->
256-312  (101213-101269)   100% ->
313-408  (102001-102096)   100% ->
409-483  (102243-102317)   100% ->
484-580  (102476-102572)   100% ->
581-652  (102753-102824)   98% ->
653-711  (103386-103444)   100% ->
712-792  (103557-103637)   100% ->
793-876  (103754-103837)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGAAATACGAGAAACTGGAAAAGATTGGGGAAG         GCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGCAGAAATACGAGAAACTGGAAAAGATTGGGGAAGGTA...TAGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTACGGAACTGTGTTCAAGGCCAAAAACCGGGAGACTCATGAGATCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100693 CTACGGAACTGTGTTCAAGGCCAAAAACCGGGAGACTCATGAGATCGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCTGAAACGGGTGAGGCTGGATGACGATGATGAG         GGTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100743 CTCTGAAACGGGTGAGGCTGGATGACGATGATGAGGTA...CAGGGTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CCGAGTTCCGCCCTCCGGGAGATCTGCCTACTCAAGGAGCTGAAGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100880 CCGAGTTCCGCCCTCCGGGAGATCTGCCTACTCAAGGAGCTGAAGCACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAACATCGTCAG         GCTTCATGACGTCCTGCACAGCGACAAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100930 GAACATCGTCAGGTG...TAGGCTTCATGACGTCCTGCACAGCGACAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGCTGACTTTGGTTTTTGAATTCTGTGACCAG         GACCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101082 AGCTGACTTTGGTTTTTGAATTCTGTGACCAGGTG...CAGGACCTGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 AAGTATTTTGACAGTTGCAATGGTGACCTCGATCCTGAGATTGTAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101222 AAGTATTTTGACAGTTGCAATGGTGACCTCGATCCTGAGATTGTAAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    313        TCATTCCTCTTCCAGCTACTAAAAGGGCTGGGATTCTGTCATA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101272 G...CAGTCATTCCTCTTCCAGCTACTAAAAGGGCTGGGATTCTGTCATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 GCCGCAATGTGCTACACAGGGACCTGAAGCCCCAGAACCTGCTAATAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102044 GCCGCAATGTGCTACACAGGGACCTGAAGCCCCAGAACCTGCTAATAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 AGG         AATGGGGAGCTGAAATTGGCTGATTTTGGCCTGGCTCG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102094 AGGGTA...CAGAATGGGGAGCTGAAATTGGCTGATTTTGGCCTGGCTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 AGCCTTTGGGATTCCCGTCCGCTGTTACTCAGCTGAG         GTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102281 AGCCTTTGGGATTCCCGTCCGCTGTTACTCAGCTGAGGTG...CAGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 TCACACTGTGGTACCGCCCACCGGATGTCCTCTTTGGGGCCAAGCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102480 TCACACTGTGGTACCGCCCACCGGATGTCCTCTTTGGGGCCAAGCTGTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 TCCACGTCCATCGACATGTGGTCAGCCGGCTGCATCTTTGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102530 TCCACGTCCATCGACATGTGGTCAGCCGGCTGCATCTTTGCAGGTG...C

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    581   AGCTGGCCAATGCTGGGCGGCCTCTTTTTCCCGGCAATGATGTCGATG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102751 AGAGCTGGCCAATGCTGGGCGGCCTCTTTTTCCCGGCAATGATGTCGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 ACCAGTTGAAGAGGATCTTCCGAC         TGCTGGGGACGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||| >>>...>>>|||||||||||||||||
 102801 ACCAGTTGAAGAGGATCTTCCGATATC...CACTGCTGGGGACGCCCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670 GAGGAGCAGTGGCCCTCTATGACCAAGCTGCCAGACTATAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103403 GAGGAGCAGTGGCCCTCTATGACCAAGCTGCCAGACTATAAGGTG...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    712  CCCTATCCGATGTACCCGGCCACAACATCCCTGGTGAACGTCGTGCCCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103556 GCCCTATCCGATGTACCCGGCCACAACATCCCTGGTGAACGTCGTGCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    761 AACTCAATGCCACAGGGAGGGATCTGCTGCAG         AACCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 103606 AACTCAATGCCACAGGGAGGGATCTGCTGCAGGTA...CAGAACCTTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    802 AAGTGTAACCCTGTCCAGCGTATCTCAGCAGAAGAGGCCCTGCAGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103763 AAGTGTAACCCTGTCCAGCGTATCTCAGCAGAAGAGGCCCTGCAGCACCC

    950     .    :    .    :    .
    852 CTACTTCTCCGACTTCTGTCCGCCC
        |||||||||||||||||||||||||
 103813 CTACTTCTCCGACTTCTGTCCGCCC