seq1 = pF1KB8206.tfa, 807 bp
seq2 = pF1KB8206/gi568815596f_74358603.tfa (gi568815596f:74358603_74560678), 202076 bp

>pF1KB8206 807
>gi568815596f:74358603_74560678 (Chr2)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-172  (101041-101143)   100% ->
173-349  (101271-101447)   100% ->
350-807  (101619-102076)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGGGCCAGCAGCGGGAACGGCAGCGAGGAGGCCTGGGGGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGGGCCAGCAGCGGGAACGGCAGCGAGGAGGCCTGGGGGGCACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGGGCGCCGCAACAGCAG         CTTCGAGAGCTGTGCCCAGGAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 TCGGGCGCCGCAACAGCAGGTA...CAGCTTCGAGAGCTGTGCCCAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAACAACCAGCCCTACCTCTGTGAGAGTGGTCACTGCTGCGGGGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101063 TGAACAACCAGCCCTACCTCTGTGAGAGTGGTCACTGCTGCGGGGAGACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCTGCTGCACCTACTACTATGAGCTCTGGT         GGTTCTGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101113 GGCTGCTGCACCTACTACTATGAGCTCTGGTGTA...CAGGGTTCTGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTCTGGACTGTCCTCATCCTCTTTAGCTGCTGTTGCGCCTTCCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101281 GCTCTGGACTGTCCTCATCCTCTTTAGCTGCTGTTGCGCCTTCCGCCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GACGAGCTAAACTCAGGCTGCAACAACAGCAGCGGCAGCGTGAAATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101331 GACGAGCTAAACTCAGGCTGCAACAACAGCAGCGGCAGCGTGAAATCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGTTGGCCTATCATGGGGCATGCCATGGGGCTGGTCCTTTCCCTACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101381 TTGTTGGCCTATCATGGGGCATGCCATGGGGCTGGTCCTTTCCCTACCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCACTGCTTGACCTTC         GCTTCCTCAGCACCTTCAAGCCCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101431 TTCACTGCTTGACCTTCGTG...CAGGCTTCCTCAGCACCTTCAAGCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGCCTACGAGGATGTGGTTCACCGCCCAGGCACACCACCCCCCCCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101643 CAGCCTACGAGGATGTGGTTCACCGCCCAGGCACACCACCCCCCCCTTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACTGTGGCCCCAGGCCGCCCCTTGACTGCTTCCAGTGAACAAACCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101693 ACTGTGGCCCCAGGCCGCCCCTTGACTGCTTCCAGTGAACAAACCTGCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTCCTCCTCATCCAGCTGCCCTGCCCACTTTGAAGGAACAAATGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101743 TTCCTCCTCATCCAGCTGCCCTGCCCACTTTGAAGGAACAAATGTGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTGTTTCCTCCCACCAGAGTGCCCCCCCCCATCAGGAGGGTGAGCCCGGG
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 101793 GTGTTTCCTCCCACCAGAGTGCCCCCCCTCATCAGGAGGGTGAGCCCGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCAGGGGTGACCCCTGCCTCCACACCCCCCTCCTGCCGCTATCGCCGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101843 GCAGGGGTGACCCCTGCCTCCACACCCCCCTCCTGCCGCTATCGCCGTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AACTGGCGACTCCGGTATTGAGCTCTGCCCTTGTCCTGCCTCCGGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101893 AACTGGCGACTCCGGTATTGAGCTCTGCCCTTGTCCTGCCTCCGGTGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTGAGCCAGTCAAGGAGGTGAGGGTTAGTGCCACCCTGCCAGATCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101943 GTGAGCCAGTCAAGGAGGTGAGGGTTAGTGCCACCCTGCCAGATCTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GACTACTCCCCGTGTGCACTACCCCCAGAGTCTGTACCGCAGATCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101993 GACTACTCCCCGTGTGCACTACCCCCAGAGTCTGTACCGCAGATCTTTCC

    800     .    :    .    :    .    :
    774 CATGGGGCTGTCTTCCAGTGAAGGGGACATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102043 CATGGGGCTGTCTTCCAGTGAAGGGGACATCCCA