seq1 = pF1KB8203.tfa, 909 bp
seq2 = pF1KB8203/gi568815582f_580526.tfa (gi568815582f:580526_782486), 201961 bp

>pF1KB8203 909
>gi568815582f:580526_782486 (Chr16)

1-159  (100001-100159)   100% ->
160-358  (100627-100825)   100% ->
359-524  (100913-101078)   100% ->
525-612  (101268-101355)   100% ->
613-669  (101495-101551)   100% ->
670-786  (101640-101756)   100% ->
787-909  (101839-101961)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGGCAAGGAGGAGAAGGAGGGCGGCGCACGGCTGGGCGCTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGGCAAGGAGGAGAAGGAGGGCGGCGCACGGCTGGGCGCTGGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGAAGCCCCGAGAAGAGCCCGAGCGCGCAGGAGCTCAAGGAGCAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGAAGCCCCGAGAAGAGCCCGAGCGCGCAGGAGCTCAAGGAGCAGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCGTCTGTTCGTGGGCCGAAAGTACCCGGAGGCGGCGGCCTGCTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCGTCTGTTCGTGGGCCGAAAGTACCCGGAGGCGGCGGCCTGCTACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCGCGATC         ACCCGGAACCCGCTGGTGGCCGTGTATTACAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCGCGATCGTG...TAGACCCGGAACCCGCTGGTGGCCGTGTATTACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACCGGGCCTTGTGCTACCTGAAGATGCAGCAGCACGAGCAGGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100659 CAACCGGGCCTTGTGCTACCTGAAGATGCAGCAGCACGAGCAGGCCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCGACTGCCGGCGCGCCCTGGAGCTGGACGGGCAGTCTGTGAAGGCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100709 CCGACTGCCGGCGCGCCCTGGAGCTGGACGGGCAGTCTGTGAAGGCGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCTTCCTGGGGCAGTGCCAGCTGGAGATGGAGAGCTATGATGAGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100759 TTCTTCCTGGGGCAGTGCCAGCTGGAGATGGAGAGCTATGATGAGGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCCAATCTGCAGCGAG         CTTACAGCCTGGCCAAGGAGCAGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100809 CGCCAATCTGCAGCGAGGTT...CAGCTTACAGCCTGGCCAAGGAGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCTGAACTTCGGGGACGACATCCCCAGCGCTCTTCGAATCGCGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100937 GGCTGAACTTCGGGGACGACATCCCCAGCGCTCTTCGAATCGCGAAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGCGCTGGAACAGCATTGAGGAGCGGCGCATCCACCAGGAGAGCGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100987 AAGCGCTGGAACAGCATTGAGGAGCGGCGCATCCACCAGGAGAGCGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCACTCCTACCTCTCCAGGCTCATTGCCGCGGAGCGTGAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101037 GCACTCCTACCTCTCCAGGCTCATTGCCGCGGAGCGTGAGAGGTG...CA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    525  GGAGCTGGAAGAGTGCCAGCGAAACCACGAGGGTGATGAGGACGACAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101267 GGGAGCTGGAAGAGTGCCAGCGAAACCACGAGGGTGATGAGGACGACAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CACGTCCGGGCCCAGCAGGCCTGCATTGAGGCCAAGCAC         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101317 CACGTCCGGGCCCAGCAGGCCTGCATTGAGGCCAAGCACGTG...CAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAAGTACATGGCGGACATGGACGAGCTTTTTTCTCAGGTGGATGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101497 CAAGTACATGGCGGACATGGACGAGCTTTTTTCTCAGGTGGATGAGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGAAG         AAGCGAGACATCCCCGACTACCTGTGTGGCAAGATC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101547 GGAAGGTG...CAGAAGCGAGACATCCCCGACTACCTGTGTGGCAAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGCTTTGAGCTGATGCGGGAGCCGTGCATCACGCCCAGTGGCATCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101676 AGCTTTGAGCTGATGCGGGAGCCGTGCATCACGCCCAGTGGCATCACCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CGACCGCAAGGACATCGAGGAGCACCTGCAG         CGTGTGGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101726 CGACCGCAAGGACATCGAGGAGCACCTGCAGGTG...CAGCGTGTGGGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATTTTGACCCCGTGACCCGGAGCCCCCTGACCCAGGAACAGCTCATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101849 ATTTTGACCCCGTGACCCGGAGCCCCCTGACCCAGGAACAGCTCATCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AACTTGGCTATGAAGGAGGTTATTGACGCATTCATCTCTGAGAATGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101899 AACTTGGCTATGAAGGAGGTTATTGACGCATTCATCTCTGAGAATGGCTG

    950     .    :
    897 GGTGGAGGACTAC
        |||||||||||||
 101949 GGTGGAGGACTAC