seq1 = pF1KB8202.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KB8202/gi568815587r_57604715.tfa (gi568815587r:57604715_57812179), 207465 bp

>pF1KB8202 582
>gi568815587r:57604715_57812179 (Chr11)

(complement)

1-217  (100001-100217)   100% ->
218-474  (106951-107207)   100% ->
475-582  (107365-107473)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAATTTCACGGCACTGTTTGGGGCTCAGGCTGACCCACCACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAATTTCACGGCACTGTTTGGGGCTCAGGCTGACCCACCACCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCAACCGCACTCGGCTTCGGACCAGGAAAGCCTCCACCCCCGCCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCAACCGCACTCGGCTTCGGACCAGGAAAGCCTCCACCCCCGCCACCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCCTGCGGGCGGGGGACCCGGCACGGCCCCGCCTCCCACCGCGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCCTGCGGGCGGGGGACCCGGCACGGCCCCGCCTCCCACCGCGGCCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTCCTCCTGGCGCGGACAAGTCAGGAGCTGGCTGTGGCCCTTTTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTCCTCCTGGCGCGGACAAGTCAGGAGCTGGCTGTGGCCCTTTTTACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGAGGGAACTGCCAG         GTAGCACAGAGCTGACAGGCAGCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGAGGGAACTGCCAGGTG...TAGGTAGCACAGAGCTGACAGGCAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGAATCTGATCACACACTACAACTTGGAACAAGCCTATAATAAATTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106975 CGAATCTGATCACACACTACAACTTGGAACAAGCCTATAATAAATTCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGAAGAAGGTGAAGGAGAAGCTAAGTAACTTCCTGCCTGACCTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107025 GGGAAGAAGGTGAAGGAGAAGCTAAGTAACTTCCTGCCTGACCTGCCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GATGATTGATCTGCCTGGTTCCCATGATAACAGCAGCCTCCGCTCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107075 GATGATTGATCTGCCTGGTTCCCATGATAACAGCAGCCTCCGCTCTCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTGAGAAGCCCCCTATTCTCAGTAGCTCTTTCAATCCTATCACAGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107125 TTGAGAAGCCCCCTATTCTCAGTAGCTCTTTCAATCCTATCACAGGGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATGCTGGCCGGCTTCCGCCTCCACACTGGCCCG         TTGCCGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107175 ATGCTGGCCGGCTTCCGCCTCCACACTGGCCCGGTG...CAGTTGCCGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCAGTGTCGTCTGATGCATATTCAGCCTCCCAAGAAGAAGAATAAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107373 GCAGTGTCGTCTGATGCATATTCAGCCTCCCAAGAAGAAGAATAAGCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCACAAACAGAGCCGTACCCAGGATCCTGTCCCCCCAGGTAA ACCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|  |||
 107423 AGCACAAACAGAGCCGTACCCAGGATCCTGTCCCCCCAGGTAAGAAGCAG

    600 
    582 T
        |
 107473 T