seq1 = pF1KB8200.tfa, 1116 bp
seq2 = pF1KB8200/gi568815591f_99285715.tfa (gi568815591f:99285715_99494486), 208772 bp

>pF1KB8200 1116
>gi568815591f:99285715_99494486 (Chr7)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-169  (100971-101075)   99% ->
170-392  (102325-102547)   100% ->
393-500  (104191-104298)   100% ->
501-707  (105179-105385)   100% ->
708-783  (105464-105539)   100% ->
784-989  (106957-107162)   100% ->
990-1080  (108315-108405)   100% ->
1081-1116  (108737-108772)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTACCACAGCTTCCTGGTGGAGCCCATCAGCTGCCACGCCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTACCACAGCTTCCTGGTGGAGCCCATCAGCTGCCACGCCTGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGGACCGCACCC         AGATTGCCATCTGCCCCAACAACCATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGGACCGCACCCGTG...CAGAGATTGCCATCTGCCCCAACAACCATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGTGCATATCTATGAAAAGAGCGGTGCCAAATGGACCAAGGTGCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100998 AGGTGCATATCTATGAAAAGAGCGGTGCCAAATGGACCAAGGTGCACGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCAAGGAGCACAATGGGCAGGTGACAG         GCATCGACTGGGC
        |||||||||||||| |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101048 CTCAAGGAGCACAACGGGCAGGTGACAGGTA...CAGGCATCGACTGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCCGAGAGTAACCGTATTGTGACCTGCGGCACAGACCGCAACGCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102338 CCCCGAGAGTAACCGTATTGTGACCTGCGGCACAGACCGCAACGCCTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTGGACGCTGAAGGGCCGCACATGGAAGCCCACGCTGGTCATCCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102388 TGTGGACGCTGAAGGGCCGCACATGGAAGCCCACGCTGGTCATCCTGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCAACCGGGCTGCCCGCTGCGTGCGCTGGGCCCCCAACGAGAACAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102438 ATCAACCGGGCTGCCCGCTGCGTGCGCTGGGCCCCCAACGAGAACAAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCTGTGGGCAGCGGCTCTCGTGTGATCTCCATCTGTTATTTCGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102488 TGCTGTGGGCAGCGGCTCTCGTGTGATCTCCATCTGTTATTTCGAGCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAATGACTG         GTGGGTTTGCAAGCACATCAAGAAGCCCATC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102538 AGAATGACTGGTG...CAGGTGGGTTTGCAAGCACATCAAGAAGCCCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGCTCCACCGTCCTCAGCCTGGACTGGCACCCCAACAATGTGCTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104222 CGCTCCACCGTCCTCAGCCTGGACTGGCACCCCAACAATGTGCTGCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCCGGCTCCTGTGACTTCAAGTGTCG         GATCTTTTCAGCCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 104272 TGCCGGCTCCTGTGACTTCAAGTGTCGGTG...TAGGATCTTTTCAGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACATCAAGGAGGTGGAGGAACGGCCGGCACCCACCCCGTGGGGCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105193 ACATCAAGGAGGTGGAGGAACGGCCGGCACCCACCCCGTGGGGCTCCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGCCCTTTGGGGAACTGATGTTCGAATCCAGCAGTAGCTGCGGCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105243 ATGCCCTTTGGGGAACTGATGTTCGAATCCAGCAGTAGCTGCGGCTGGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACATGGCGTCTGTTTCTCAGCCAGCGGGAGCCGCGTGGCCTGGGTAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105293 ACATGGCGTCTGTTTCTCAGCCAGCGGGAGCCGCGTGGCCTGGGTAAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACGACAGCACCGTCTGCCTGGCTGATGCCGACAAGAAGATGGC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105343 ACGACAGCACCGTCTGCCTGGCTGATGCCGACAAGAAGATGGCGTG...C

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    708   CGTCGCGACTCTGGCCTCTGAAACACTACCACTGCTGGCGCTGACCTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105462 AGCGTCGCGACTCTGGCCTCTGAAACACTACCACTGCTGGCGCTGACCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATCACAGACAACAGCCTGGTGGCAGCG         GGCCACGACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105512 CATCACAGACAACAGCCTGGTGGCAGCGGTG...CAGGGCCACGACTGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCCCGGTGCTGTTCACCTATGACGCCGCCGCGGGGATGCTGAGCTTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106970 TCCCGGTGCTGTTCACCTATGACGCCGCCGCGGGGATGCTGAGCTTCGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGGCGGCTGGACGTTCCTAAGCAGAGCTCGCAGCGTGGCTTGACGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107020 GGGCGGCTGGACGTTCCTAAGCAGAGCTCGCAGCGTGGCTTGACGGCCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CGAGCGCTTCCAGAACCTGGACAAGAAGGCGAGCTCCGAGGGTGGCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107070 CGAGCGCTTCCAGAACCTGGACAAGAAGGCGAGCTCCGAGGGTGGCACGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGCGGGCGCGGGCCTAGACTCGCTGCACAAGAACAGCGTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 107120 CTGCGGGCGCGGGCCTAGACTCGCTGCACAAGAACAGCGTCAGGTG...C

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    990   CCAGATCTCGGTGCTCAGCGGCGGCAAGGCCAAGTGCTCGCAGTTCTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108313 AGCCAGATCTCGGTGCTCAGCGGCGGCAAGGCCAAGTGCTCGCAGTTCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CACCACTGGCATGGATGGCGGCATGAGTATCTGGGATGTGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 108363 CACCACTGGCATGGATGGCGGCATGAGTATCTGGGATGTGAAGGTG...C

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1081   AGCTTGGAGTCAGCCTTGAAGGACCTCAAGATCAAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108735 AGAGCTTGGAGTCAGCCTTGAAGGACCTCAAGATCAAA