seq1 = pF1KB8198.tfa, 603 bp
seq2 = pF1KB8198/gi568815587f_66171797.tfa (gi568815587f:66171797_66376235), 204439 bp

>pF1KB8198 603
>gi568815587f:66171797_66376235 (Chr11)

1-14  (96884-96897)   100% ->
15-87  (100001-100073)   100% ->
88-183  (100361-100456)   100% ->
184-279  (100569-100664)   100% ->
280-411  (104008-104139)   100% ->
412-603  (104248-104439)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCCCGAATA         TGACTACCTGTTTAAGCTGCTTTTGAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
  96884 ATGAACCCCGAATAGTG...CAGTGACTACCTGTTTAAGCTGCTTTTGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGGCGACTCAGGCGTGGGCAAGTCATGCCTGCTCCTGCGGTTTGCT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100028 TGGCGACTCAGGCGTGGGCAAGTCATGCCTGCTCCTGCGGTTTGCTGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     88      GATGACACGTACACAGAGAGCTACATCAGCACCATCGGGGTGGAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 ..CAGGATGACACGTACACAGAGAGCTACATCAGCACCATCGGGGTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTCAAGATCCGAACCATCGAGCTGGATGGCAAAACTATCAAACTTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100406 TTCAAGATCCGAACCATCGAGCTGGATGGCAAAACTATCAAACTTCAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 C         TGGGACACAGCGGGCCAGGAACGGTTCCGGACCATCACTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100456 CGTG...TAGTGGGACACAGCGGGCCAGGAACGGTTCCGGACCATCACTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CCAGCTACTACCGGGGGGCTCATGGCATCATCGTGGTGTATGACGTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100609 CCAGCTACTACCGGGGGGCTCATGGCATCATCGTGGTGTATGACGTCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACCAG         GAATCCTACGCCAACGTGAAGCAGTGGCTGCAGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100659 GACCAGGTA...TAGGAATCCTACGCCAACGTGAAGCAGTGGCTGCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GATTGACCGCTATGCCAGCGAGAACGTCAATAAGCTCCTGGTGGGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104043 GATTGACCGCTATGCCAGCGAGAACGTCAATAAGCTCCTGGTGGGCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGAGCGACCTCACCACCAAGAAGGTGGTGGACAACACCACAGCCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 104093 AGAGCGACCTCACCACCAAGAAGGTGGTGGACAACACCACAGCCAAGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    412       GAGTTTGCAGACTCTCTGGGCATCCCCTTCTTGGAGACGAGCGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104143 ...CAGGAGTTTGCAGACTCTCTGGGCATCCCCTTCTTGGAGACGAGCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CAAGAATGCCACCAATGTCGAGCAGGCGTTCATGACCATGGCTGCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104292 CAAGAATGCCACCAATGTCGAGCAGGCGTTCATGACCATGGCTGCTGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCAAAAAGCGGATGGGGCCTGGAGCAGCCTCTGGGGGCGAGCGGCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104342 TCAAAAAGCGGATGGGGCCTGGAGCAGCCTCTGGGGGCGAGCGGCCCAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    556 CTCAAGATCGACAGCACCCCTGTAAAGCCGGCTGGCGGTGGCTGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104392 CTCAAGATCGACAGCACCCCTGTAAAGCCGGCTGGCGGTGGCTGTTGC