seq1 = pF1KB8197.tfa, 495 bp
seq2 = pF1KB8197/gi568815593r_81909599.tfa (gi568815593r:81909599_82110093), 200495 bp

>pF1KB8197 495
>gi568815593r:81909599_82110093 (Chr5)

(complement)

1-495  (100001-100495)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCAACCCCACCGTGTTCTTCGACATTGCCGTCGACGGCGAGCCCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100001 ATGGTCAACCCCACCGTGTTCTTCGACATTGCCGTCGATGGCGAGCCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCGCGTCTCCTTTGAGCTGTTTGCAGACAAGGTCCCAAAGACAGCAG
        |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCCGCGTCTCCTTTGAGCTGTTAGCTGACAAGGTCCCAAAGACAGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAATTTTCGTGCTCTGAGCACTGGAGAGAAAGGATTTGGTTATAAGGGT
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAATTTTCATGCTCTGAGCACTGGAGAGAAAGGATTTGGTTATAAGGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTGCTTTCACAGAATTATTCCAGGGTTTATGTGTCAGGGTGGTGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTGCTTTCACAGAATTATTCCAGGGTTTATGTGTCAGGGTGGTGACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACACGCCATAATGGCACTGGTGGCAAGTCCATCTATGGGGAGAAATTTG
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACACGCCATAATGGCACTAGTGGCAAGTCCATCTATGGGGAGAAATTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGATGAGAACTTCATCCTAAAGCATACGGGTCCTGGCATCTTGTCCATG
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100251 AAGATGAGAACTTCATCCTAAAGCATACAGGTCCTGGCATCTTGTCCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAAATGCTGGACCCAACACAAATGGTTCCCAGTTTTTCATCTGCACTGC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100301 GCAAATGCTGGACCCAACACAAATGGCTCCCAGTTTTTCATCTGCACTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAGACTGAGTGGTTGGATGGCAAGCATGTGGTGTTTGGCAAAGTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||
 100351 CAAGACTGAGTGGTTGGATGGCATGCATGTGATCTGTGGCAAAGTGAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAGGCATGAATATTGTGGAGGCCATGGAGCGCTTTGGGTCCAGGAATGGC
        ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
 100401 AAGGCATGAATATTGTGGAGGTCATGGAGTGCTTTGGGTCCAGGAATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    451 AAGACCAGCAAGAAGATCACCATTGCTGACTGTGGACAACTCGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGACCAGCAAGAAGATCACCATTGCTGACTGTGGACAACTCGAA