seq1 = pF1KB8170.tfa, 1107 bp
seq2 = pF1KB8170/gi568815595r_9684027.tfa (gi568815595r:9684027_9891466), 207440 bp

>pF1KB8170 1107
>gi568815595r:9684027_9891466 (Chr3)

(complement)

1-207  (100001-100207)   100% ->
208-458  (101504-101754)   100% ->
459-564  (101853-101958)   100% ->
565-706  (104127-104268)   100% ->
707-810  (104358-104461)   100% ->
811-920  (106042-106151)   100% ->
921-1107  (107254-107440)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGAGTTGAAAGACTGCCCCTTGCAGTTCCACGACTTCAAGTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGAGTTGAAAGACTGCCCCTTGCAGTTCCACGACTTCAAGTCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGATCACCTGAAGGTCTGTCCCCGCTACACGGCAGTGCTGGCACGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGATCACCTGAAGGTCTGTCCCCGCTACACGGCAGTGCTGGCACGCTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGATGATGGCATCGGCATCGAGGAGCTGGACACCCTGCAGCTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGATGATGGCATCGGCATCGAGGAGCTGGACACCCTGCAGCTGGAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGACCCTGCTGTCTTCTGCCAGCCGGCGCCTGCGTGTGCTTGAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGACCCTGCTGTCTTCTGCCAGCCGGCGCCTGCGTGTGCTTGAGGCCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AACCCAG         ATCCTCACCGACTGGCAGGATAAGAAAGGTGACA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AACCCAGGTG...CAGATCCTCACCGACTGGCAGGATAAGAAAGGTGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACGATTCCTGAAGCTGGGTCGAGACCATGAACTTGGAGCTCCCCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101538 GACGATTCCTGAAGCTGGGTCGAGACCATGAACTTGGAGCTCCCCCCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATGGGAAGCCCAAGAAGCAGAAACTGGAAGGGAAGGCAGGACATGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101588 CATGGGAAGCCCAAGAAGCAGAAACTGGAAGGGAAGGCAGGACATGGGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGCCCTGGCCCAGGACGGCCCAAATCCAAAAACCTTCAGCCCAAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101638 GGGCCCTGGCCCAGGACGGCCCAAATCCAAAAACCTTCAGCCCAAGATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGGAATATGAATTCACTGATGACCCTATCGACGTGCCACGGATCCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101688 AGGAATATGAATTCACTGATGACCCTATCGACGTGCCACGGATCCCCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AATGATGCCCCCAACAG         GTTCTGGGCTTCAGTGGAGCCCTA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101738 AATGATGCCCCCAACAGGTT...CAGGTTCTGGGCTTCAGTGGAGCCCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGTGCTGACATCACCAGCGAGGAGGTCCGCACACTTGAGGAGTTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101877 CTGTGCTGACATCACCAGCGAGGAGGTCCGCACACTTGAGGAGTTACTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCCCCCAGAAGATGAGGCTGAGCATTACAAG         ATCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101927 AGCCCCCAGAAGATGAGGCTGAGCATTACAAGGTA...CAGATCCCACCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGGGGAAGCACTACTCCCAGCGCTGGGCCCAGGAGGACCTGCTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104136 CTGGGGAAGCACTACTCCCAGCGCTGGGCCCAGGAGGACCTGCTGGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCAGAAGGATGGGGCCCGGGCAGCGGCTGTGGCTGACAAGAAGAAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104186 GCAGAAGGATGGGGCCCGGGCAGCGGCTGTGGCTGACAAGAAGAAAGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCATGGGGCCACTGACCGAACTGGACACTAAAG         ATGTGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 104236 TCATGGGGCCACTGACCGAACTGGACACTAAAGGTA...TAGATGTGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCCTGCTGAAGAAGTCTGAGGCCCAGCATGAACAGCCGGAAGATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104366 GCCCTGCTGAAGAAGTCTGAGGCCCAGCATGAACAGCCGGAAGATGGATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCCCTTTGGTGCCCTGACGCAGCGCCTCCTGCAGGCCCTGGTGGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104416 CCCCTTTGGTGCCCTGACGCAGCGCCTCCTGCAGGCCCTGGTGGAGGTG.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811      GAAAATATTATTTCCCCTATGGAGGATTCTCCTATTCCTGACATG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104466 ..TAGGAAAATATTATTTCCCCTATGGAGGATTCTCCTATTCCTGACATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TCTGGGAAAGAATCAGGGGCTGACGGGGCAAGCACCTCCCCTCGCAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106087 TCTGGGAAAGAATCAGGGGCTGACGGGGCAAGCACCTCCCCTCGCAATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAACAAGCCCTTCAG         TGTGCCGCATACTAAGTCCCTGGAGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106137 GAACAAGCCCTTCAGGTG...CAGTGTGCCGCATACTAAGTCCCTGGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCCGCATCAAGGAGGAGCTAATTGCCCAGGGCCTTTTGGAGTCTGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107280 GCCGCATCAAGGAGGAGCTAATTGCCCAGGGCCTTTTGGAGTCTGAGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CGCCCCGCAGAGGACTCCGAGGATGAGGTCCTTGCTGAGCTTCGCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107330 CGCCCCGCAGAGGACTCCGAGGATGAGGTCCTTGCTGAGCTTCGCAAACG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCAGGCTGAGCTGAAGGCACTTAGTGCCCACAACCGCACCAAGAAGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107380 GCAGGCTGAGCTGAAGGCACTTAGTGCCCACAACCGCACCAAGAAGCACG

   1150     .    :
   1097 ACCTGCTGAGG
        |||||||||||
 107430 ACCTGCTGAGG