seq1 = pF1KB8151.tfa, 912 bp
seq2 = pF1KB8151/gi568815581r_1323516.tfa (gi568815581r:1323516_1556117), 232602 bp

>pF1KB8151 912
>gi568815581r:1323516_1556117 (Chr17)

(complement)

1-241  (100001-100241)   99% ->
242-777  (118963-119498)   100% ->
778-912  (132468-132602)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGCAACTTCGACTCGGAGGAGCGGAGTAGCTGGTACTGGGGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100001 ATGGCGGGCAACTTCGACTCGGAGGAGCGGAGTAGCTGGTACTGGGGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGAGTCGGCAGGAGGCGGTGGCGCTGCTGCAGGGCCAGCGGCACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTGAGTCGGCAGGAGGCGGTGGCGCTGCTGCAGGGCCAGCGGCACGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTTCCTGGTGCGGGACTCGAGCACCAGCCCCGGGGACTATGTGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTTCCTGGTGCGGGACTCGAGCACCAGCCCCGGGGACTATGTGCTCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCTCAGAGAACTCGCGCGTCTCCCACTACATCATCAACAGCAGCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCTCAGAGAACTCGCGCGTCTCCCACTACATCATCAACAGCAGCGGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCCCGCCGGTGCCACCGTCGCCCGCCCAGCCTCCGCCCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100201 GCGCCCGCCGGTGCCACCGTCGCCCGCCCAGCCTCCGCCCGGTG...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGTGAGCCCCTCCAGACTCCGAATAGGAGATCAAGAGTTTGATTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118963 GGGTGAGCCCCTCCAGACTCCGAATAGGAGATCAAGAGTTTGATTCATTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTGCTTTACTGGAATTCTACAAAATACACTATTTGGACACTACAACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119013 CCTGCTTTACTGGAATTCTACAAAATACACTATTTGGACACTACAACGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GATAGAACCAGTTTCCAGATCCAGGCAGGGTAGTGGAGTGATTCTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119063 GATAGAACCAGTTTCCAGATCCAGGCAGGGTAGTGGAGTGATTCTCAGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGGAGGAGGCGGAGTATGTGCGAGCCCTCTTTGACTTTAATGGGAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119113 AGGAGGAGGCGGAGTATGTGCGAGCCCTCTTTGACTTTAATGGGAATGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGGAAGATCTTCCCTTTAAGAAAGGAGACATCTTGAGAATCCGGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119163 GAGGAAGATCTTCCCTTTAAGAAAGGAGACATCTTGAGAATCCGGGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCTGAAGAGCAGTGGTGGAATGCGGAGGACAGCGAAGGCAAGAGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119213 GCCTGAAGAGCAGTGGTGGAATGCGGAGGACAGCGAAGGCAAGAGAGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGATTCCAGTCCCTTACGTCGAGAAGTATAGACCTGCCTCCGCCTCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119263 TGATTCCAGTCCCTTACGTCGAGAAGTATAGACCTGCCTCCGCCTCAGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCGGCTCTGATTGGAGGTAACCAGGAGGGTTCCCACCCACAGCCACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119313 TCGGCTCTGATTGGAGGTAACCAGGAGGGTTCCCACCCACAGCCACTGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGGGCCGGAGCCTGGGCCCTATGCCCAACCCAGCGTCAACACTCCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119363 TGGGCCGGAGCCTGGGCCCTATGCCCAACCCAGCGTCAACACTCCGCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTAACCTCCAGAATGGGCCCATATATGCCAGGGTTATCCAGAAGCGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119413 CTAACCTCCAGAATGGGCCCATATATGCCAGGGTTATCCAGAAGCGAGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCCAATGCCTACGACAAGACAGCCTTGGCTTTGGAG         GTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 119463 CCCAATGCCTACGACAAGACAGCCTTGGCTTTGGAGGTA...CAGGTCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TGAGCTGGTAAAGGTTACGAAGATTAATGTGAGTGGTCAGTGGGAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132473 TGAGCTGGTAAAGGTTACGAAGATTAATGTGAGTGGTCAGTGGGAAGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AGTGTAATGGCAAACGAGGTCACTTCCCATTCACACATGTCCGTCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132523 AGTGTAATGGCAAACGAGGTCACTTCCCATTCACACATGTCCGTCTGCTG

    900     .    :    .    :    .    :
    883 GATCAACAGAATCCCGATGAGGACTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 132573 GATCAACAGAATCCCGATGAGGACTTCAGC