seq1 = pF1KB8147.tfa, 804 bp
seq2 = pF1KB8147/gi568815578f_32725928.tfa (gi568815578f:32725928_32948725), 222798 bp

>pF1KB8147 804
>gi568815578f:32725928_32948725 (Chr20)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-267  (107790-107935)   100% ->
268-475  (110707-110914)   100% ->
476-597  (113808-113929)   100% ->
598-750  (120691-120843)   100% ->
751-804  (122745-122798)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGTGAACGTATACTCAACGTCAGTGACCAGTGATAACCTAAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGTGAACGTATACTCAACGTCAGTGACCAGTGATAACCTAAGTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACATGACATGCTGGCCTGGATCAATGAGTCTCTGCAGTTGAATCTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACATGACATGCTGGCCTGGATCAATGAGTCTCTGCAGTTGAATCTGACAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATCGAACAGTTGTGCTCAG         GGGCTGCGTATTGTCAGTTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 AGATCGAACAGTTGTGCTCAGGTA...CAGGGGCTGCGTATTGTCAGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGACATGCTGTTCCCTGGCTCCATTGCCTTGAAGAAAGTGAAATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107810 ATGGACATGCTGTTCCCTGGCTCCATTGCCTTGAAGAAAGTGAAATTCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCTAAGCTAGAACACGAGTACATCCAGAACTTCAAAATACTACAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107860 AGCTAAGCTAGAACACGAGTACATCCAGAACTTCAAAATACTACAAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTTTTAAGAGAATGGGTGTTGACAAA         ATAATTCCTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107910 GTTTTAAGAGAATGGGTGTTGACAAAGTA...CAGATAATTCCTGTGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAATTAGTAAAAGGAAAGTTTCAGGACAATTTTGAATTCGTTCAGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110722 AAATTAGTAAAAGGAAAGTTTCAGGACAATTTTGAATTCGTTCAGTGGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAGAAGTTTTTCGATGCAAACTATGATGGAAAAGACTATGACCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110772 CAAGAAGTTTTTCGATGCAAACTATGATGGAAAAGACTATGACCCTGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGCCAGACAAGGTCAAGAAACTGCAGTGGCTCCTTCCCTTGTTGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110822 CTGCCAGACAAGGTCAAGAAACTGCAGTGGCTCCTTCCCTTGTTGCTCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCTCTGAATAAACCGAAGAAACCTCTCACTTCTAGCAGTGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110872 GCTCTGAATAAACCGAAGAAACCTCTCACTTCTAGCAGTGCAGGTA...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    476   CTCCCCAGAGGCCCATCTCAACACAGAGAACCGCTGCGGCTCCTAAGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113806 AGCTCCCCAGAGGCCCATCTCAACACAGAGAACCGCTGCGGCTCCTAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGGCCCTGGTGTGGTGCGAAAGAACCCTGGTGTGGGCAACGGAGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113856 CTGGCCCTGGTGTGGTGCGAAAGAACCCTGGTGTGGGCAACGGAGACGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGGCAGCTGAGTTGATGCAGCAG         GTCAACGTATTGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 113906 GAGGCAGCTGAGTTGATGCAGCAGGTG...CAGGTCAACGTATTGAAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TACTGTTGAAGACTTGGAGAAAGAGAGGGATTTCTACTTCGGAAAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120708 TACTGTTGAAGACTTGGAGAAAGAGAGGGATTTCTACTTCGGAAAGCTAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGAACATTGAATTGATTTGCCAGGAGAACGAGGGGGAAAACGACCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120758 GGAACATTGAATTGATTTGCCAGGAGAACGAGGGGGAAAACGACCCTGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTGCAGAGGATTGTAGACATTCTGTATGCCACAGAT         GAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 120808 TTGCAGAGGATTGTAGACATTCTGTATGCCACAGATGTA...CAGGAAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    756 CTTTGTGATACCTGATGAAGGGGGCCCACAGGAGGAGCAAGAAGAGTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122750 CTTTGTGATACCTGATGAAGGGGGCCCACAGGAGGAGCAAGAAGAGTAT