seq1 = pF1KB8137.tfa, 1035 bp
seq2 = pF1KB8137/gi568815594r_16402646.tfa (gi568815594r:16402646_16998485), 595840 bp

>pF1KB8137 1035
>gi568815594r:16402646_16998485 (Chr4)

(complement)

1-133  (100001-100133)   100% ==
236-408  (402611-402783)   100% ->
409-531  (409654-409776)   100% ->
532-655  (486382-486505)   100% ->
656-807  (489800-489951)   100% ->
808-1035  (495613-495840)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAGCACACCACATGACCCCTTCTATTCTTCTCCTTTCGGCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCAGCACACCACATGACCCCTTCTATTCTTCTCCTTTCGGCCCATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTATAGGAGGCATACACCATACATGGTACAGCCAGAGTACCGAATCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTATAGGAGGCATACACCATACATGGTACAGCCAGAGTACCGAATCTATG

    100     .    :    .    :    .    :
    101 AGATGAACAAGAGACTGCAGTCTCGCACAGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGATGAACAAGAGACTGCAGTCTCGCACAGAGG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    236 CTATCGGCAGGACCCTCATCCCCCGTTACTTTAGCACTGTGTTTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 402611 CTATCGGCAGGACCCTCATCCCCCGTTACTTTAGCACTGTGTTTGAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286 GGGGTGACCGACCTGTATTACATTCTCAAACACTCGAAAGAGTCATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 402661 GGGGTGACCGACCTGTATTACATTCTCAAACACTCGAAAGAGTCATACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    336 CAACTCATCCATCACGGTGGACTGCGACCAGTGTACCATGGTCACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 402711 CAACTCATCCATCACGGTGGACTGCGACCAGTGTACCATGGTCACCCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    386 ACGGGAAGCCCATGTTTACCAAG         GTATGTACAGAAGGCAGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 402761 ACGGGAAGCCCATGTTTACCAAGGTA...CAGGTATGTACAGAAGGCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    427 CTGATCTTGGAGTTCACCTTTGATGATCTCATGAGAATCAAAACATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 409672 CTGATCTTGGAGTTCACCTTTGATGATCTCATGAGAATCAAAACATGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    477 CTTTACCATTAGACAATACCGAGAGTTAGTCCCGAGAAGCATCCTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 409722 CTTTACCATTAGACAATACCGAGAGTTAGTCCCGAGAAGCATCCTAGCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    527 TGCAT         TTGTGTGTAATATTGGAGCCAATGCAGGAACTGATG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 409772 TGCATGTA...CAGTTGTGTGTAATATTGGAGCCAATGCAGGAACTGATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    568 TCGAGACATAAAACTTACAACCTCAGTCCCCGAGACTGCCTGAAGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 486418 TCGAGACATAAAACTTACAACCTCAGTCCCCGAGACTGCCTGAAGACCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    618 CTTGTTTCAGAAGTGGCAGAGGATGGTGGCTCCGCCAG         CAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 486468 CTTGTTTCAGAAGTGGCAGAGGATGGTGGCTCCGCCAGGTA...CAGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    659 AACCCACAAGGCAACCAACAACCAAACGGAGAAAAAGGAAAAATTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 489803 AACCCACAAGGCAACCAACAACCAAACGGAGAAAAAGGAAAAATTCCACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    709 AGCAGCACTTCCAACAGCAGCGCTGGGAACAATGCAAACAGCACTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 489853 AGCAGCACTTCCAACAGCAGCGCTGGGAACAATGCAAACAGCACTGGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    759 CAAGAAGAAGACCACAGCTGCAAACCTGAGTCTGTCCAGTCAGGTACCT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 489903 CAAGAAGAAGACCACAGCTGCAAACCTGAGTCTGTCCAGTCAGGTACCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    808         GATGTGATGGTGGTAGGAGAGCCAACTCTGATGGGAGGTGAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 489953 TA...CAGGATGTGATGGTGGTAGGAGAGCCAACTCTGATGGGAGGTGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    850 TTTGGGGACGAGGACGAAAGGCTAATCACTAGATTAGAAAACACGCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 495655 TTTGGGGACGAGGACGAAAGGCTAATCACTAGATTAGAAAACACGCAATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    900 TGATGCGGCCAACGGCATGGACGACGAGGAGGACTTCAACAATTCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 495705 TGATGCGGCCAACGGCATGGACGACGAGGAGGACTTCAACAATTCACCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    950 CGCTGGGGAACAACAGCCCGTGGAACAGTAAACCTCCCGCCACTCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 495755 CGCTGGGGAACAACAGCCCGTGGAACAGTAAACCTCCCGCCACTCAAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .
   1000 ACCAAATCAGAAAACCCCCCACCCCAGGCTTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 495805 ACCAAATCAGAAAACCCCCCACCCCAGGCTTCCCAA