seq1 = pF1KB8133.tfa, 1698 bp
seq2 = pF1KB8133/gi568815589r_136840931.tfa (gi568815589r:136840931_137044083), 203153 bp

>pF1KB8133 1698
>gi568815589r:136840931_137044083 (Chr9)

(complement)

1-193  (100001-100193)   100% ->
194-351  (100578-100735)   100% ->
352-526  (101141-101315)   100% ->
527-675  (101389-101537)   100% ->
676-1096  (101618-102038)   100% ->
1097-1244  (102400-102547)   100% ->
1245-1457  (102621-102833)   100% ->
1458-1698  (102913-103153)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGAGGGCGGCACGCCCCTGCTCCCCGACAGCCTGGTCTACCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGAGGGCGGCACGCCCCTGCTCCCCGACAGCCTGGTCTACCAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCTGAGCCTGGGCCCGGCCGACGTGCTGGCCGCCGGGCTGGTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCTGAGCCTGGGCCCGGCCGACGTGCTGGCCGCCGGGCTGGTGTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCAATGGCAGGCCGTGTCGCGGGACGAGTTCCTGTGGAGGGAGCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCAATGGCAGGCCGTGTCGCGGGACGAGTTCCTGTGGAGGGAGCAGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACCGCTACTACCAGGTGGCCCGCGACGTGCCCCGACACCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100151 TACCGCTACTACCAGGTGGCCCGCGACGTGCCCCGACACCCAGGTC...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    194   CGGCCATGTCCTGGTACGAGGAGTTCCAGCGGCTGTATGACACGGTGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100576 AGCGGCCATGTCCTGGTACGAGGAGTTCCAGCGGCTGTATGACACGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTGCGTGGAGGTGCAGACGCTGCGGGAACACACAGACCAGGTCCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100626 CCTGCGTGGAGGTGCAGACGCTGCGGGAACACACAGACCAGGTCCTGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCAGCTTCTCCCATTCCGGGTACCAGTTCGCGTCCTGCTCCAAGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100676 CTCAGCTTCTCCCATTCCGGGTACCAGTTCGCGTCCTGCTCCAAGGACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CACTGTGAAG         ATCTGGAGCAACGACCTGACCATCTCGCTGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100726 CACTGTGAAGGTG...CAGATCTGGAGCAACGACCTGACCATCTCGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCACAGCGCGGACATGCGGCCCTACAACTGGAGCTACACCCAGTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101172 TGCACAGCGCGGACATGCGGCCCTACAACTGGAGCTACACCCAGTTCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGTTCAACAAGGACGACTCGCTACTGCTGGCCTCGGGGGTGTTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101222 CAGTTCAACAAGGACGACTCGCTACTGCTGGCCTCGGGGGTGTTCCTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCCGCACAACTCCTCATCCGGCGAGATTGCTGTCATCAGCCTAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101272 GCCGCACAACTCCTCATCCGGCGAGATTGCTGTCATCAGCCTAGGTG...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    527    ACTCCTTCGCGCTGCTGTCCCGCGTGCGGAACAAGCCCTATGACGTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101386 CAGACTCCTTCGCGCTGCTGTCCCGCGTGCGGAACAAGCCCTATGACGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTTGGCTGTTGGCTCACCGAGACCAGCCTCATCTCGGGGAACCTGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101436 TTTGGCTGTTGGCTCACCGAGACCAGCCTCATCTCGGGGAACCTGCACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CATCGGAGATATCACCTCCTGCTCGGTGCTGTGGCTCAACAATGCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101486 CATCGGAGATATCACCTCCTGCTCGGTGCTGTGGCTCAACAATGCCTTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AG         GATGTGGAGTCAGAGAACGTCAACGTGGTGAAGCGGCTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101536 AGGTG...CAGGATGTGGAGTCAGAGAACGTCAACGTGGTGAAGCGGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTCAAGATCCAGAACCTCAATGCCAGCACCGTCCGCACGGTGATGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101657 TTCAAGATCCAGAACCTCAATGCCAGCACCGTCCGCACGGTGATGGTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGACTGCAGCCGCTTCGACAGCCCTGACCTGCTGCTGGAAGCCGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101707 CGACTGCAGCCGCTTCGACAGCCCTGACCTGCTGCTGGAAGCCGGTGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CGGCCACGTCCCCCTGCCGCATCTTTGACCTGGGCAGCGACAACGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101757 CGGCCACGTCCCCCTGCCGCATCTTTGACCTGGGCAGCGACAACGAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTGGTGGCTGGCCCGGCCCCCGCCCACGCCAAGGAGGGCTTGCGGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101807 GTGGTGGCTGGCCCGGCCCCCGCCCACGCCAAGGAGGGCTTGCGGCACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TCTGGACCGCGTGCTGGAGGGGCGGGCGCAGCCACAGCTGTCGGAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101857 TCTGGACCGCGTGCTGGAGGGGCGGGCGCAGCCACAGCTGTCGGAGCGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGCTAGAGACCAAGGTGGCCGAGCTGCTGGCCCAGGGCCACACCAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101907 TGCTAGAGACCAAGGTGGCCGAGCTGCTGGCCCAGGGCCACACCAAGCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CCCGAGCGCAGTGCCACAGGCGCCAAGAGCAAGTACCTCATCTTCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101957 CCCGAGCGCAGTGCCACAGGCGCCAAGAGCAAGTACCTCATCTTCACCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 TGGCTGCCTCACCTACTCCCCACACCAGATCG         GCATCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102007 TGGCTGCCTCACCTACTCCCCACACCAGATCGGTA...CAGGCATCAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGATCCTGCCACACCAGATGACCACGGCAGGGCCCGTGCTGGGTGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102409 AGATCCTGCCACACCAGATGACCACGGCAGGGCCCGTGCTGGGTGAGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CGGGGCTCCGATGCCTTCTTCGACGCGCTGGACCACGTCATAGACATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102459 CGGGGCTCCGATGCCTTCTTCGACGCGCTGGACCACGTCATAGACATACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CGGACACATCATCGGCATGGGCCTGTCGCCCGACAACAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102509 CGGACACATCATCGGCATGGGCCTGTCGCCCGACAACAGGTG...CAGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ACCTGTACGTGAACAGCCGCGCCTGGCCCAACGGTGCGGTGGTGGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102623 ACCTGTACGTGAACAGCCGCGCCTGGCCCAACGGTGCGGTGGTGGCCGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CCCATGCAGCCGCCACCAATCGCGGAGGAGATTGACCTGCTGGTGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102673 CCCATGCAGCCGCCACCAATCGCGGAGGAGATTGACCTGCTGGTGTTCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CCTCAAGACCATGCGGGAGGTGAGGCGGGCTCTGCGTGCGCACCGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102723 CCTCAAGACCATGCGGGAGGTGAGGCGGGCTCTGCGTGCGCACCGCGCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 ACACGCCCAACGACGAGTGCTTCTTCATCTTCCTGGACGTCAGCAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102773 ACACGCCCAACGACGAGTGCTTCTTCATCTTCCTGGACGTCAGCAGGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 TTCGTGGCCAG         CGGGGCGGAGGACCGGCACGGCTACATCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102823 TTCGTGGCCAGGTG...CAGCGGGGCGGAGGACCGGCACGGCTACATCTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GGACCGCCACTACAACATCTGTCTGGCCAGGCTGCAGCACGAGGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 102943 GGACCGCCACTACAACATCTGTCTGGCCAGGCTGCGGCACGAGGATGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 TCAACTCAGTGGTCTTCAGTCCCCAGGAGCAGGAGCTGCTGCTCACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102993 TCAACTCAGTGGTCTTCAGTCCCCAGGAGCAGGAGCTGCTGCTCACGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 AGCGACGACGCCACCATCAAAGCCTGGCGCTCCCCACGCACCATGCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103043 AGCGACGACGCCACCATCAAAGCCTGGCGCTCCCCACGCACCATGCGCGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 CCTCCAGGCACCTCGCCCACGGCCTCGCACCTTCTTCTCCTGGCTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103093 CCTCCAGGCACCTCGCCCACGGCCTCGCACCTTCTTCTCCTGGCTTGCCA

   1750     .    :
   1688 GCCAGAGGCGC
        |||||||||||
 103143 GCCAGAGGCGC