seq1 = pF1KB8122.tfa, 642 bp
seq2 = pF1KB8122/gi568815590f_21925249.tfa (gi568815590f:21925249_22136679), 211431 bp

>pF1KB8122 642
>gi568815590f:21925249_22136679 (Chr8)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-144  (100188-100273)   100% ->
145-270  (100399-100524)   100% ->
271-364  (107882-107975)   100% ->
365-531  (108861-109027)   100% ->
532-566  (109262-109296)   100% ->
567-600  (111245-111278)   100% ->
601-642  (111390-111431)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATCTCAGTAGCGCCAGTAGCACGGAGGAAAAGGCAGTGACGACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATCTCAGTAGCGCCAGTAGCACGGAGGAAAAGGCAGTGACGACCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTGGG         GCTGCGAGCTCAGTCAGGAGAGGCGGACTTGGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCTGGGGTG...CAGGCTGCGAGCTCAGTCAGGAGAGGCGGACTTGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTTCAGACCCCAGCTGGAGGGGAAGCAGAGCTGCAGGCTGTTGCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100221 CCTTCAGACCCCAGCTGGAGGGGAAGCAGAGCTGCAGGCTGTTGCTTCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACG         ATTTGCTTGGGGGAGAAAGCCAAAGAGGAGATGCATCG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100271 ACGGTA...CAGATTTGCTTGGGGGAGAAAGCCAAAGAGGAGATGCATCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGTGGAGATCCTGCCCCCAGCAAACCAGGAGGACAAGAAGATGCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100437 CGTGGAGATCCTGCCCCCAGCAAACCAGGAGGACAAGAAGATGCAGCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCACCATTGCCTCACTCCAGGCCTCAGTCCTCCCCATG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100487 TCACCATTGCCTCACTCCAGGCCTCAGTCCTCCCCATGGTG...CAGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCCATGGTAGGAGTGCAGCTTTCTCCCCCAGTTACTTTCCAGCTCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107885 TCCATGGTAGGAGTGCAGCTTTCTCCCCCAGTTACTTTCCAGCTCCGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGGCTCAGGACCCGTGTTCCTCAGTGGCCAGGAACGTTATG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 107935 TGGCTCAGGACCCGTGTTCCTCAGTGGCCAGGAACGTTATGGTA...CAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGCATCAGACCTAACCTGGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGGGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108861 AAGCATCAGACCTAACCTGGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGGGGAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGGAAGAGGAAGAGGAAGATGATGAGGATGAGGATGCAGATATATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108911 GAGGAAGAGGAAGAGGAAGATGATGAGGATGAGGATGCAGATATATCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGAGGAGCAAAGCCCTGTCAAACAAGTCAAAAGGCTGGTGCCCCAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108961 GGAGGAGCAAAGCCCTGTCAAACAAGTCAAAAGGCTGGTGCCCCAGAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGCGAGCGTGGCTAAG         AAAAAAAAGCTGGAAAAAGAAGAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109011 AGGCGAGCGTGGCTAAGGTG...CAGAAAAAAAAGCTGGAAAAAGAAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGGAAATAAG         AGCCAGCGTTAGAGACAAGAGCCCTGTGAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 109286 GAGGAAATAAGGTA...CAGAGCCAGCGTTAGAGACAAGAGCCCTGTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AAAG         GCCAAAGCCACAGCCAGAGCCAAGAAGCCAGGATTCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111275 AAAGGTG...CAGGCCAAAGCCACAGCCAGAGCCAAGAAGCCAGGATTCA

    700     .
    638 AGAAA
        |||||
 111427 AGAAA