seq1 = pF1KB8017.tfa, 1941 bp
seq2 = pF1KB8017/gi568815591f_73983991.tfa (gi568815591f:73983991_74221298), 237308 bp

>pF1KB8017 1941
>gi568815591f:73983991_74221298 (Chr7)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-152  (101758-101854)   100% ->
153-291  (112632-112770)   100% ->
292-401  (113090-113199)   100% ->
402-608  (115042-115248)   100% ->
609-714  (121885-121990)   100% ->
715-881  (122087-122253)   100% ->
882-1065  (123020-123203)   100% ->
1066-1152  (123881-123967)   100% ->
1153-1284  (124915-125046)   100% ->
1285-1344  (127658-127717)   100% ->
1345-1410  (127943-128008)   100% ->
1411-1567  (131812-131968)   100% ->
1568-1623  (136593-136648)   100% ->
1624-1781  (136902-137059)   100% ->
1782-1941  (137149-137308)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAG         GAAGCGAGTTGCCCGTGTGTGCAAGCTGCGGCCAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAAGGTG...CAGGAAGCGAGTTGCCCGTGTGTGCAAGCTGCGGCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGATCTATGATGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAACGCGGACTGGCACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101794 GGATCTATGATGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAACGCGGACTGGCACGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACTGCTTCAG         GTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101844 GACTGCTTCAGGTA...CAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112662 CCAGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAGGACTACTGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGGTGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112712 CCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGGTGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGTTATG         GTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112762 CTGGTTATGGTG...CAGGTGGCTGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTCATCTGCCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113122 TTTCATCTGCCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTG         CGGGCACTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 113172 CGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGGTG...CAGCGGGCACTGCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAGCAGATCCTGCCTGACTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115055 TACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAGCAGATCCTGCCTGACTCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGCTCCCACCTGCCCCACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115105 TGGCTCCCACCTGCCCCACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTCATGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCCGCACGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115155 CTCATGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCCGCACGGCCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACACCGTCCGCGTCCAGGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 115205 CCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACACCGTCCGCGTCCAGGGGTG...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    609    AGTGGATCCGGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121882 CAGAGTGGATCCGGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121932 TCGGAGACCGGATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGGACGAG         ATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCAGCCGCCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 121982 CTGGACGAGGTA...CAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCAGCCGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCACGATACACTGGGCCACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122119 GCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCACGATACACTGGGCCACGGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGGGCCTGAGACCAGCCCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122169 TGGGGCCTGAGACCAGCCCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAGGCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTT         GAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 122219 GAGGCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGTA...CAGGAGGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTGGGCTCCCCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123026 CTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTGGGCTCCCCGGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123076 CCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTCTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCACACCGCATCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123126 CCACACCGCATCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAG         GTGACACACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 123176 CAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTA...CAGGTGACACACCGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCTGATCCGGTTCGACGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123894 AGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCTGATCCGGTTCGACGAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ACCCAGAGGACGTTCCTCAAGGAG         GTGAAGGTCATGCGATG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 123944 ACCCAGAGGACGTTCCTCAAGGAGGTC...CAGGTGAAGGTCATGCGATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCTGGAACACCCCAACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTACAAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124932 CCTGGAACACCCCAACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTACAAGGACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGAGGCTCAACTTCATCACTGAGTACATCAAGGGCGGCACGCTCCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124982 AGAGGCTCAACTTCATCACTGAGTACATCAAGGGCGGCACGCTCCGGGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ATCATCAAGAGCATG         GACAGCCAGTACCCATGGAGCCAGAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 125032 ATCATCAAGAGCATGGTG...CAGGACAGCCAGTACCCATGGAGCCAGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AGTGAGCTTTGCCAAGGACATCGCATCAGGGATG         GCCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 127684 AGTGAGCTTTGCCAAGGACATCGCATCAGGGATGGTG...TAGGCCTACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TCCACTCCATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127950 TCCACTCCATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTCCGCGAG         AACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 128000 GTCCGCGAGGTG...CAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGAGGGCCTGCGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131844 GGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGAGGGCCTGCGGAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131894 TCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TGGATGGCACCTGAGATGATCAACG         GCCGCAGCTATGATGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 131944 TGGATGGCACCTGAGATGATCAACGGTG...CAGGCCGCAGCTATGATGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GAAGGTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 136609 GAAGGTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGGTA...CAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TCATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCGCACCATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136903 TCATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCGCACCATGGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCTGGACCGCTACTGCCCCCCAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136953 TTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCTGGACCGCTACTGCCCCCCAAACTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 CCCCCCGAGCTTCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137003 CCCCCCGAGCTTCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 AGAAGAG         GCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTGGAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137053 AGAAGAGGTG...CAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTGGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 ACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCACTGGGCCCACAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137183 ACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCACTGGGCCCACAGCTGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GCAGCTGGACAGAGGTTTCTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137233 GCAGCTGGACAGAGGTTTCTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGAC

   2050     .    :    .    :    .
   1916 TGCCTGCCCACCCTGAGGTCCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||
 137283 TGCCTGCCCACCCTGAGGTCCCCGAC