seq1 = pF1KB8003.tfa, 489 bp
seq2 = pF1KB8003/gi568815579f_9735345.tfa (gi568815579f:9735345_9949196), 213852 bp

>pF1KB8003 489
>gi568815579f:9735345_9949196 (Chr19)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-271  (103092-103304)   100% ->
272-382  (112686-112796)   100% ->
383-489  (113746-113852)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACGAGGAGAAGCTGCCGCCCGGCTGGGAGAAGCGCATGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACGAGGAGAAGCTGCCGCCCGGCTGGGAGAAGCGCATGAGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTCAG         GCCGAGTGTACTACTTCAACCACATCACTAACG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCTCAGGTG...CAGGCCGAGTGTACTACTTCAACCACATCACTAACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCAGCCAGTGGGAGCGGCCCAGCGGCAACAGCAGCAGTGGTGGCAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103125 CCAGCCAGTGGGAGCGGCCCAGCGGCAACAGCAGCAGTGGTGGCAAAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGCAGGGGGAGCCTGCCAGGGTCCGCTGCTCGCACCTGCTGGTGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103175 GGGCAGGGGGAGCCTGCCAGGGTCCGCTGCTCGCACCTGCTGGTGAAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGCCAGTCACGGCGGCCCTCGTCCTGGCGGCAGGAGAAGATCACCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103225 CAGCCAGTCACGGCGGCCCTCGTCCTGGCGGCAGGAGAAGATCACCCGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAAGGAGGAGGCCCTGGAGCTGATCAACG         GCTACATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103275 CCAAGGAGGAGGCCCTGGAGCTGATCAACGGTG...CAGGCTACATCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGATCAAGTCGGGAGAGGAGGACTTTGAGTCTCTGGCCTCACAGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112697 AAGATCAAGTCGGGAGAGGAGGACTTTGAGTCTCTGGCCTCACAGTTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGACTGCAGCTCAGCCAAGGCCAGGGGAGACCTGGGTGCCTTCAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112747 CGACTGCAGCTCAGCCAAGGCCAGGGGAGACCTGGGTGCCTTCAGCAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383          GTCAGATGCAGAAGCCATTTGAAGACGCCTCGTTTGCGCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112797 GTG...CAGGTCAGATGCAGAAGCCATTTGAAGACGCCTCGTTTGCGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGGACGGGGGAGATGAGCGGGCCCGTGTTCACGGATTCCGGCATCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113787 CGGACGGGGGAGATGAGCGGGCCCGTGTTCACGGATTCCGGCATCCACAT

    500     .    :    .
    474 CATCCTCCGCACTGAG
        ||||||||||||||||
 113837 CATCCTCCGCACTGAG