seq1 = pF1KB7973.tfa, 642 bp
seq2 = pF1KB7973/gi568815581f_42467125.tfa (gi568815581f:42467125_42671600), 204476 bp

>pF1KB7973 642
>gi568815581f:42467125_42671600 (Chr17)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-79  (100495-100531)   100% ->
80-186  (101713-101819)   100% ->
187-286  (102080-102179)   100% ->
287-386  (102383-102482)   100% ->
387-588  (102858-103059)   100% ->
589-642  (104423-104476)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGAGCCGGGCGCCTCTCCCGAGGACCCTTGGGTCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGACGGAGCCGGGCGCCTCTCCCGAGGACCCTTGGGTCAAGGCA...CA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  GTGGAGTATGCCTACAGCGACAACAGCCTGGACCCCG         ATG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100494 GGTGGAGTATGCCTACAGCGACAACAGCCTGGACCCCGGTG...TAGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 ATGAGGACAGTGATTACCACCAGGAGGCCTACAAGGAGTCCTACAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101716 ATGAGGACAGTGATTACCACCAGGAGGCCTACAAGGAGTCCTACAAAGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CGGCGGCGGCGCGCACACACTCAGGCTGAGCAGAAGAGGAGGGACGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101766 CGGCGGCGGCGCGCACACACTCAGGCTGAGCAGAAGAGGAGGGACGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAG         AGAGGCTATGATGACCTTCAGACCATCGTCCCCACTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101816 CAAGGTG...CAGAGAGGCTATGATGACCTTCAGACCATCGTCCCCACTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GCCAGCAGCAGGACTTCTCCATTGGCTCCCAAAAGCTCAGCAAAGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102117 GCCAGCAGCAGGACTTCTCCATTGGCTCCCAAAAGCTCAGCAAAGCCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTTCTACAAAAGA         CCATTGACTACATTCAGTTTTTGCACAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 102167 GTTCTACAAAAGAGTA...TAGCCATTGACTACATTCAGTTTTTGCACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGAGAAGAAAAAGCAGGAGGAGGAGGTGTCCACGTTACGCAAGGATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102411 GGAGAAGAAAAAGCAGGAGGAGGAGGTGTCCACGTTACGCAAGGATGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCGCCCTAAAGATCATGAAAGT         GAACTATGAGCAGATTGTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102461 CCGCCCTAAAGATCATGAAAGTGTA...TAGGAACTATGAGCAGATTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 AAGGCACACCAGGACAACCCCCATGAAGGGGAGGACCAGGTCTCTGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102877 AAGGCACACCAGGACAACCCCCATGAAGGGGAGGACCAGGTCTCTGACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGTCAAGTTCAACGTGTTTCAAGGCATCATGGATTCCCTGTTCCAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102927 GGTCAAGTTCAACGTGTTTCAAGGCATCATGGATTCCCTGTTCCAGTCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCAATGCCTCCATCTCAGTGGCCAGCTTCCAGGAGCTGTCAGCGTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102977 TCAATGCCTCCATCTCAGTGGCCAGCTTCCAGGAGCTGTCAGCGTGTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTCAGCTGGATCGAGGAGCACTGTAAGCCTCAG         ACCCTGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103027 TTCAGCTGGATCGAGGAGCACTGTAAGCCTCAGGTA...CAGACCCTGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    597 GGAGATTGTGATTGGCGTCCTGCACCAATTGAAAAACCAGCTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104431 GGAGATTGTGATTGGCGTCCTGCACCAATTGAAAAACCAGCTTTAC