seq1 = pF1KB7963.tfa, 876 bp
seq2 = pF1KB7963/gi568815581f_51054374.tfa (gi568815581f:51054374_51271601), 217228 bp

>pF1KB7963 876
>gi568815581f:51054374_51271601 (Chr17)

1-71  (100001-100071)   100% ->
72-201  (101278-101407)   100% ->
202-303  (105607-105708)   100% ->
304-416  (106787-106899)   100% ->
417-546  (112454-112583)   100% ->
547-648  (113869-113970)   100% ->
649-761  (115564-115676)   100% ->
762-876  (117114-117228)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGCTACTGTCTACTTTAGGGATCGTCTTTCAAGGCGAGGGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGCTACTGTCTACTTTAGGGATCGTCTTTCAAGGCGAGGGGCCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATCTCAAGCTGTGATACAGG         AACCATGGCCAACTGTGAGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100051 TATCTCAAGCTGTGATACAGGGTA...CAGAACCATGGCCAACTGTGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTACCTTCATTGCGATCAAACCAGATGGGGTCCAGCGGGGTCTTGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101298 GTACCTTCATTGCGATCAAACCAGATGGGGTCCAGCGGGGTCTTGTGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGATTATCAAGCGTTTTGAGCAGAAAGGATTCCGCCTTGTTGGTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101348 GAGATTATCAAGCGTTTTGAGCAGAAAGGATTCCGCCTTGTTGGTCTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTCATGCAA         GCTTCCGAAGATCTTCTCAAGGAACACTACG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101398 ATTCATGCAAGTA...TAGGCTTCCGAAGATCTTCTCAAGGAACACTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGACCTGAAGGACCGTCCATTCTTTGCCGGCCTGGTGAAATACATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105638 TTGACCTGAAGGACCGTCCATTCTTTGCCGGCCTGGTGAAATACATGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCAGGGCCGGTAGTTGCCATG         GTCTGGGAGGGGCTGAATGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105688 TCAGGGCCGGTAGTTGCCATGGTG...GAGGTCTGGGAGGGGCTGAATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGTGAAGACGGGCCGAGTCATGCTCGGGGAGACCAACCCTGCAGACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106807 GGTGAAGACGGGCCGAGTCATGCTCGGGGAGACCAACCCTGCAGACTCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCCTGGGACCATCCGTGGAGACTTCTGCATACAAGTTGGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106857 AGCCTGGGACCATCCGTGGAGACTTCTGCATACAAGTTGGCAGGTG...C

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    417   GACCATGGCCAACCTGGAGCGCACCTTCATCGCCATCAAGCCGGACGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112452 AGGACCATGGCCAACCTGGAGCGCACCTTCATCGCCATCAAGCCGGACGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGTGCAGCGCGGCCTGGTGGGCGAGATCATCAAGCGCTTCGAGCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112502 CGTGCAGCGCGGCCTGGTGGGCGAGATCATCAAGCGCTTCGAGCAGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GATTCCGCCTCGTGGCCATGAAGTTCCTCCGG         GCCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 112552 GATTCCGCCTCGTGGCCATGAAGTTCCTCCGGGTA...CAGGCCTCTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAACACCTGAAGCAGCACTACATTGACCTGAAAGACCGACCATTCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113878 GAACACCTGAAGCAGCACTACATTGACCTGAAAGACCGACCATTCTTCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGGGCTGGTGAAGTACATGAACTCAGGGCCGGTTGTGGCCATG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 113928 TGGGCTGGTGAAGTACATGAACTCAGGGCCGGTTGTGGCCATGGTG...G

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    649   GTCTGGGAGGGGCTGAACGTGGTGAAGACAGGCCGAGTGATGCTTGGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115562 AGGTCTGGGAGGGGCTGAACGTGGTGAAGACAGGCCGAGTGATGCTTGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGACCAATCCAGCAGATTCAAAGCCAGGCACCATTCGTGGGGACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115612 GAGACCAATCCAGCAGATTCAAAGCCAGGCACCATTCGTGGGGACTTCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CATTCAGGTTGGCAG         GAACATCATTCATGGCAGTGATTCAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115662 CATTCAGGTTGGCAGGTA...TAGGAACATCATTCATGGCAGTGATTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TAAAAAGTGCTGAAAAAGAAATCAGCCTATGGTTTAAGCCTGAAGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117140 TAAAAAGTGCTGAAAAAGAAATCAGCCTATGGTTTAAGCCTGAAGAACTG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    838 GTTGACTACAAGTCTTGTGCTCATGACTGGGTCTATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117190 GTTGACTACAAGTCTTGTGCTCATGACTGGGTCTATGAA