seq1 = pF1KB7959.tfa, 792 bp
seq2 = pF1KB7959/gi568815579r_2953822.tfa (gi568815579r:2953822_3162927), 209106 bp

>pF1KB7959 792
>gi568815579r:2953822_3162927 (Chr19)

(complement)

1-228  (100001-100228)   99% ->
229-326  (101671-101768)   100% ->
327-390  (105186-105249)   100% ->
391-435  (106572-106616)   100% ->
436-498  (107202-107264)   100% ->
499-573  (108734-108808)   100% ->
574-792  (108888-109106)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGTCACAAGAATGGCTTCCCTCAGGAAGGCGGCATTACCGCTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGTCACAAGAATGGCTTCCCTCAGGAAGGCGGCATTACCGCTGCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGCAGAAAAGGAAACTGAGGCTCAGCAAGAACCACCGCCCAGCCAGAG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGCAGAAAAGGAAACTAAGGCTCAGCAAGAACCACCGCCCAGCCAGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAGGTCACAGAGCACGTCCGTGGCACGCGTCCAGGTCGTGCCACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAGGTCACAGAGCACGTCCGTGGCACGCGTCCAGGTCGTGCCACAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCCGGCGGCTTCGACGCGGGCAGCCGGGTCCCTTTTCTTTGACAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGCCGGCGGCTTCGACGCGGGCAGCCGGGTCCCTTTTCTTTGACAGATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGAAACCGAGGCCCGGCCGGCTGCCGG         GGCTCCTCGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100201 GGGAAACCGAGGCCCGGCCGGCTGCCGGGTA...CAGGGCTCCTCGCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TACCCCAGCAACTCAAATTCACCACCTCGGACTCCTGCGACCGCATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101684 TACCCCAGCAACTCAAATTCACCACCTCGGACTCCTGCGACCGCATCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACGAATTTCAGCTACTGCAAGCTCAGTACCACAG         CCTCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101734 GACGAATTTCAGCTACTGCAAGCTCAGTACCACAGGTG...CAGCCTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTCGAATGTGACAAGTTGGCCAGTGAGAAGTCAGAGATGCAGCGTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105192 GCTCGAATGTGACAAGTTGGCCAGTGAGAAGTCAGAGATGCAGCGTCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGTGATG         TACTACGAGATGTCCTACGGCTTGAACATCGAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105242 ATGTGATGGTA...CAGTACTACGAGATGTCCTACGGCTTGAACATCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATGCACAAACAG         GCTGAGATCGTCAAAAGGCTGAACGGGAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 106605 ATGCACAAACAGGTA...CAGGCTGAGATCGTCAAAAGGCTGAACGGGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTGTGCCCAGGTCCTGCCCTACCTCTCCCAAGAG         CACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107231 TTGTGCCCAGGTCCTGCCCTACCTCTCCCAAGAGGTA...CAGCACCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGCAGGTCTTGGGAGCCATTGAGAGGGCCAAGCAGGTCACCGCTCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108741 AGCAGGTCTTGGGAGCCATTGAGAGGGCCAAGCAGGTCACCGCTCCCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTGAACTCTATCATCCGA         CAGCAGCTCCAAGCCCACCAGCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 108791 CTGAACTCTATCATCCGAGTA...CAGCAGCAGCTCCAAGCCCACCAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GTCCCAGCTGCAGGCCCTGGCCCTGCCCTTGACCCCACTACCCGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108911 GTCCCAGCTGCAGGCCCTGGCCCTGCCCTTGACCCCACTACCCGTGGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGCAGCCGCCTTCGCTGCCGGCGGTCAGCGCAGGCACCGGCCTCCTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108961 TGCAGCCGCCTTCGCTGCCGGCGGTCAGCGCAGGCACCGGCCTCCTCTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGTCCGCGCTGGGTTCCCAGGCCCACCTCTCCAAGGAAGACAAGAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109011 CTGTCCGCGCTGGGTTCCCAGGCCCACCTCTCCAAGGAAGACAAGAACGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    747 GCACGATGGTGACACCCACCAGGAGGATGATGGCGAGAAGTCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109061 GCACGATGGTGACACCCACCAGGAGGATGATGGCGAGAAGTCGGAT