seq1 = pF1KB7957.tfa, 783 bp
seq2 = pF1KB7957/gi568815578r_36513869.tfa (gi568815578r:36513869_36741335), 227467 bp

>pF1KB7957 783
>gi568815578r:36513869_36741335 (Chr20)

(complement)

1-91  (100001-100091)   100% ->
92-191  (106747-106846)   100% ->
192-278  (107707-107793)   100% ->
279-382  (108638-108741)   100% ->
383-532  (125962-126111)   100% ->
533-665  (126899-127031)   100% ->
666-783  (127350-127467)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAGTCTGCCCAGCAGAAGAAAATCTCTGCCAAGCCCAAGCTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAGTCTGCCCAGCAGAAGAAAATCTCTGCCAAGCCCAAGCTTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCCTCTGTCCAAGGCCAGGGACCTGTGACCATGGAAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100051 TTCCTCTGTCCAAGGCCAGGGACCTGTGACCATGGAAGCAGGTA...TAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAGAAGCAAGGCCACAGCCGTGGCCCTGGGCAGTTTCCCGGCAGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106747 AGAGAAGCAAGGCCACAGCCGTGGCCCTGGGCAGTTTCCCGGCAGGTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCGGCCGAGCTGTCGCTGAGACTCGGGGAGCCATTGACCATCGTCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106797 CCGGCCGAGCTGTCGCTGAGACTCGGGGAGCCATTGACCATCGTCTCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192          GGATGGAGACTGGTGGACGGTGCTGTCTGAAGTCTCAGGCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106847 GTA...CAGGGATGGAGACTGGTGGACGGTGCTGTCTGAAGTCTCAGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAGAGTATAACATCCCCAGCGTCCACGTGGCCAAAGTCTCCCATGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 107748 GAGAGTATAACATCCCCAGCGTCCACGTGGCCAAAGTCTCCCATGGGTG.

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    279      GTGGCTGTATGAGGGCCTGAGCAGGGAGAAAGCAGAGGAACTGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107798 ..CAGGTGGCTGTATGAGGGCCTGAGCAGGGAGAAAGCAGAGGAACTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTTGTTACCTGGGAACCCTGGAGGGGCCTTCCTCATCCGGGAGAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108683 GTTGTTACCTGGGAACCCTGGAGGGGCCTTCCTCATCCGGGAGAGCCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAGGAGAG         GCTCTTACTCTCTGTCAGTCCGCCTCAGCCGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108733 CCAGGAGAGGTG...CAGGCTCTTACTCTCTGTCAGTCCGCCTCAGCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCTGCATCCTGGGACCGGATCAGACACTACAGGATCCACTGCCTTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125994 CCTGCATCCTGGGACCGGATCAGACACTACAGGATCCACTGCCTTGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGCTGGCTGTACATCTCACCGCGCCTCACCTTCCCCTCACTCCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126044 TGGCTGGCTGTACATCTCACCGCGCCTCACCTTCCCCTCACTCCAGGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGTGGACCATTACTCTG         AGCTGGCGGATGACATCTGCTGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 126094 TGGTGGACCATTACTCTGGTA...CAGAGCTGGCGGATGACATCTGCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTACTCAAGGAGCCCTGTGTCCTGCAGAGGGCTGGCCCGCTCCCTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126922 CTACTCAAGGAGCCCTGTGTCCTGCAGAGGGCTGGCCCGCTCCCTGGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGATATACCCCTACCTGTGACTGTGCAGAGGACACCACTCAACTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126972 GGATATACCCCTACCTGTGACTGTGCAGAGGACACCACTCAACTGGAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCTGGACAG         CTCCCTCCTGTTTTCTGAAGCTGCCACAGGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 127022 AGCTGGACAGGTA...CAGCTCCCTCCTGTTTTCTGAAGCTGCCACAGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGGAGTCTCTTCTCAGTGAGGGTCTCCGGGAGTCCCTCAGCTTCTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127381 GAGGAGTCTCTTCTCAGTGAGGGTCTCCGGGAGTCCCTCAGCTTCTACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .
    747 CAGCCTGAATGACGAGGCTGTCTCTTTGGATGATGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127431 CAGCCTGAATGACGAGGCTGTCTCTTTGGATGATGCC