seq1 = pF1KB7954.tfa, 1185 bp
seq2 = pF1KB7954/gi568815583r_50178635.tfa (gi568815583r:50178635_50409798), 231164 bp

>pF1KB7954 1185
>gi568815583r:50178635_50409798 (Chr15)

(complement)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-276  (105666-105833)   100% ->
277-471  (106676-106870)   100% ->
472-619  (108431-108578)   100% ->
620-733  (108897-109010)   100% ->
734-919  (120131-120316)   100% ->
920-1035  (123616-123731)   100% ->
1036-1185  (131015-131164)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCTGGTAGATTTGGGAAAGAAGCTTTTAGAAGCGGCACGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCTGGTAGATTTGGGAAAGAAGCTTTTAGAAGCGGCACGAGCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCAAGATGATGAAGTTCGTATTTTGATGGCAAATGGAGCTCCCTTTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCAAGATGATGAAGTTCGTATTTTGATGGCAAATGGAGCTCCCTTTACTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGACTGG         CTGGGAACTTCTCCACTTCATCTAGCAGCACAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGACTGGGTA...CAGCTGGGAACTTCTCCACTTCATCTAGCAGCACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGGTCATTATTCCACCACAGAGGTACTGCTGCGAGCTGGTGTGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105699 TATGGTCATTATTCCACCACAGAGGTACTGCTGCGAGCTGGTGTGAGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATGCCAGAACCAAAGTGGACCGAACACCATTACATATGGCAGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105749 AGATGCCAGAACCAAAGTGGACCGAACACCATTACATATGGCAGCTTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGGCCATGCCAGCATAGTAGAGGTTTTACTTAAG         CATGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105799 AGGGCCATGCCAGCATAGTAGAGGTTTTACTTAAGGTA...TAGCATGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTGATGTCAATGCAAAGGACATGTTAAAGATGACAGCTCTCCATTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106682 GCTGATGTCAATGCAAAGGACATGTTAAAGATGACAGCTCTCCATTGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACAGAACACAATCATCAAGAGGTGGTGGAACTTTTAATCAAATATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106732 CACAGAACACAATCATCAAGAGGTGGTGGAACTTTTAATCAAATATGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGATGTACACACGCAAAGTAAATTTTGTAAAACTGCATTTGATATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106782 CTGATGTACACACGCAAAGTAAATTTTGTAAAACTGCATTTGATATTTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATAGACAATGGAAATGAAGATTTAGCAGAGATATTACAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106832 ATAGACAATGGAAATGAAGATTTAGCAGAGATATTACAGGTA...TAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCTATGCAGAACCAAATCAACACAAACCCAGAGAGTCCTGACACTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108433 TGCTATGCAGAACCAAATCAACACAAACCCAGAGAGTCCTGACACTGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAATACATGCTGCAACACCACAGTTTATCATTGGACCTGGAGGGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108483 CAATACATGCTGCAACACCACAGTTTATCATTGGACCTGGAGGGGTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACCTAACAGGTCTGGTATCTTCAGAAAATTCATCCAAGGCAACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 108533 AACCTAACAGGTCTGGTATCTTCAGAAAATTCATCCAAGGCAACAGGTA.

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    620      ATGAAACGGGTGTATCTGCTGTTCAGTTTGGAAACTCTTCTACAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108583 ..CAGATGAAACGGGTGTATCTGCTGTTCAGTTTGGAAACTCTTCTACAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAGTATTAGCTACATTAGCTGCCTTAGCTGAAGCATCTGCTCCATTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108942 CAGTATTAGCTACATTAGCTGCCTTAGCTGAAGCATCTGCTCCATTGTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AATTCTTCAGAAACTCCAG         TAGTGGCCACAGAAGAAGTAGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 108992 AATTCTTCAGAAACTCCAGGTT...CAGTAGTGGCCACAGAAGAAGTAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TACTGCAGAATCTGTGGATGGTGCCATTCAGCAAGTAGTTAGTTCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120153 TACTGCAGAATCTGTGGATGGTGCCATTCAGCAAGTAGTTAGTTCAGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTCAGCAAGTCATCACAATAGTTACAGATGGAATTCAGCTTGGAAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120203 GTCAGCAAGTCATCACAATAGTTACAGATGGAATTCAGCTTGGAAATTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CACTCTATTCCAACCAGTGGAATTGGTCAGCCCATCATTGTGACCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120253 CACTCTATTCCAACCAGTGGAATTGGTCAGCCCATCATTGTGACCATGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGATGGACAACAAG         TATTAACAGTACCAGCAACAGACATTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 120303 AGATGGACAACAAGGTT...TAGTATTAACAGTACCAGCAACAGACATTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGAAGAAACTGTTATAAGTGAAGAACCACCAGCTAAGAGACAATGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123643 CTGAAGAAACTGTTATAAGTGAAGAACCACCAGCTAAGAGACAATGTATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAAATAATTGAAAACCGGGTGGAATCTGCAGAAATAGAA         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 123693 GAAATAATTGAAAACCGGGTGGAATCTGCAGAAATAGAAGTA...TAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAGAGAAGCTCTTCAGAAACAGCTGGATGAAGCAAATCGAGAAGCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131017 GAGAGAAGCTCTTCAGAAACAGCTGGATGAAGCAAATCGAGAAGCACAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AATATCGACAGCAGCTCCTAAAGAAAGAACAGGAAGCAGAGGCCTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131067 AATATCGACAGCAGCTCCTAAAGAAAGAACAGGAAGCAGAGGCCTACAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1138 CAGAAGTTGGAAGCTATGACTCGTCTTCAGACTAATAAAGAAGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131117 CAGAAGTTGGAAGCTATGACTCGTCTTCAGACTAATAAAGAAGCTGTT