seq1 = pF1KB7919.tfa, 540 bp
seq2 = pF1KB7919/gi568815586r_42060592.tfa (gi568815586r:42060592_42337727), 277136 bp

>pF1KB7919 540
>gi568815586r:42060592_42337727 (Chr12)

(complement)

1-26  (99548-99573)   100% ->
27-152  (100004-100129)   100% ->
153-305  (175963-176115)   100% ->
306-540  (176902-177136)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGACAAGAAGAGCCCCACCAG         GCCGAAGCGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  99548 ATGGGAGACAAGAAGAGCCCCACCAGGTA...CAGGCCGAAGCGGCAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAAGCCGTCCTCGGATGAGGGTTACTGGGACTGTAGCGTCTGCACCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 GAAGCCGTCCTCGGATGAGGGTTACTGGGACTGTAGCGTCTGCACCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAACAGCGCCGAGGCCTTCAAGTGCATGATGTGCGATGTGCGGAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 GGAACAGCGCCGAGGCCTTCAAGTGCATGATGTGCGATGTGCGGAAGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCTCCACCCG         GAAACCTCGACCTGTCTCCCAGTTGGTTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100119 ACCTCCACCCGGTG...CAGGAAACCTCGACCTGTCTCCCAGTTGGTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACAGCAGGTTACTCAGCAGTTTGTGCCTCCTACACAGTCAAAGAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175993 ACAGCAGGTTACTCAGCAGTTTGTGCCTCCTACACAGTCAAAGAAAGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAAAGATAAAGTAGAAAAAGAAAAAAGTGAAAAGGAAACAACTAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176043 AAAAAGATAAAGTAGAAAAAGAAAAAAGTGAAAAGGAAACAACTAGCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGAATAGCCATAAGAAAACCAG         GCCAAGATTGAAAAATGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 176093 AAGAATAGCCATAAGAAAACCAGGTA...TAGGCCAAGATTGAAAAATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGATCGGAGTAGTGCTCAGCATTTGGAAGTTACTGTTGGAGATCTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176920 GGATCGGAGTAGTGCTCAGCATTTGGAAGTTACTGTTGGAGATCTGACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCATTATTACAGACTTTAAGGAGAAAACAAAGTCACCGCCTGCATCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176970 TCATTATTACAGACTTTAAGGAGAAAACAAAGTCACCGCCTGCATCTAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCTGCTTCTGCAGATCAACACAGTCAAAGCGGCTCTAGCTCTGATAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177020 GCTGCTTCTGCAGATCAACACAGTCAAAGCGGCTCTAGCTCTGATAACAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAGAGAGGAATGTCCAGGTCATCTTCACCCAGAGGAGAAGCCTCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177070 AGAGAGAGGAATGTCCAGGTCATCTTCACCCAGAGGAGAAGCCTCATCAT

    550     .    :    .
    524 TGAATGGAGAATCTCAT
        |||||||||||||||||
 177120 TGAATGGAGAATCTCAT