seq1 = pF1KB7905.tfa, 372 bp
seq2 = pF1KB7905/gi568815597r_108964526.tfa (gi568815597r:108964526_109175066), 210541 bp

>pF1KB7905 372
>gi568815597r:108964526_109175066 (Chr1)

(complement)

1-27  (99120-99146)   100% ->
28-106  (100002-100080)   100% ->
107-204  (108835-108932)   100% ->
205-372  (110374-110541)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGATGAGGAAGAAGACCCCACG         TTTGAGGAAGAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  99120 ATGGCAGATGAGGAAGAAGACCCCACGGTG...TAGTTTGAGGAAGAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGAAGAAATTGGAGGAGGTGCAGAAGGTGGACAGGGTAAAAGAAAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 TGAAGAAATTGGAGGAGGTGCAGAAGGTGGACAGGGTAAAAGAAAGAGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTTTTCTAAAGAAT         TGCGATGTATGATGTATGGCTTTGGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100066 TTTTTTCTAAAGAATGTA...CAGTGCGATGTATGATGTATGGCTTTGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GATGACCAGAATCCTTATACTGAGTCAGTGGATATTCTTGAAGATCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108861 GATGACCAGAATCCTTATACTGAGTCAGTGGATATTCTTGAAGATCTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CATAGAGTTTATCACTGAAATG         ACTCACAAGGCAATGTCAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 108911 CATAGAGTTTATCACTGAAATGGTA...TAGACTCACAAGGCAATGTCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTGGAAGACAAGGTCGAGTACAAGTTGAAGATATCGTCTTCTTGATTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110393 TTGGAAGACAAGGTCGAGTACAAGTTGAAGATATCGTCTTCTTGATTCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGGACCCAAGGAAGTTTGCCAGGGTTAAAGACTTGCTTACTATGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110443 AAGGACCCAAGGAAGTTTGCCAGGGTTAAAGACTTGCTTACTATGAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    324 AGAATTGAAACGAGCTAGAAAAGCATTTGATGAAGCAAATTATGGATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110493 AGAATTGAAACGAGCTAGAAAAGCATTTGATGAAGCAAATTATGGATCT