seq1 = pF1KB7903.tfa, 321 bp
seq2 = pF1KB7903/gi568815592f_34140781.tfa (gi568815592f:34140781_34344881), 204101 bp

>pF1KB7903 321
>gi568815592f:34140781_34344881 (Chr6)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-219  (101932-102015)   100% ->
220-270  (102688-102738)   100% ->
271-321  (104051-104101)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGAGTCGAGCTCGAAGTCCAGCCAGCCCTTGGCCTCCAAGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGAGTCGAGCTCGAAGTCCAGCCAGCCCTTGGCCTCCAAGCAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAGGACGGCACTGAGAAGCGGGGCCGGGGCAGGCCGCGCAAGCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAGGACGGCACTGAGAAGCGGGGCCGGGGCAGGCCGCGCAAGCAGCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGTGAGTCCCGGGACAGCGCTGGTAGGGAGTCAG         AAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 CGGTGAGTCCCGGGACAGCGCTGGTAGGGAGTCAGGTG...CAGAAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCAGCGAAGTGCCAACACCTAAGAGACCTCGGGGCCGACCAAAGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101938 CCCAGCGAAGTGCCAACACCTAAGAGACCTCGGGGCCGACCAAAGGGAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAAAACAAGGGTGCTGCCAAGACCCGG         AAAACCACCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101988 CAAAAACAAGGGTGCTGCCAAGACCCGGGTG...TAGAAAACCACCACAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTCCAGGAAGGAAACCAAGGGGCAGACCCAAAAAACTG         GAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102701 CTCCAGGAAGGAAACCAAGGGGCAGACCCAAAAAACTGGTA...CAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    274 AAGGAGGAAGAGGAGGGCATCTCGCAGGAGTCCTCGGAGGAGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104054 AAGGAGGAAGAGGAGGGCATCTCGCAGGAGTCCTCGGAGGAGGAGCAG