seq1 = pF1KB7890.tfa, 1956 bp
seq2 = pF1KB7890/gi568815582r_50219214.tfa (gi568815582r:50219214_50468774), 249561 bp

>pF1KB7890 1956
>gi568815582r:50219214_50468774 (Chr16)

(complement)

1-49  (100001-100049)   100% ->
50-258  (100477-100685)   100% ->
259-388  (113853-113982)   100% ->
389-446  (114293-114350)   100% ->
447-591  (118608-118752)   100% ->
592-702  (128689-128799)   100% ->
703-887  (133880-134064)   100% ->
888-1011  (135078-135201)   100% ->
1012-1087  (140031-140106)   100% ->
1088-1195  (142384-142491)   100% ->
1196-1331  (142892-143027)   100% ->
1332-1443  (145077-145188)   100% ->
1444-1500  (146737-146793)   100% ->
1501-1615  (147998-148112)   100% ->
1616-1759  (148384-148527)   100% ->
1760-1903  (148745-148888)   100% ->
1904-1956  (149509-149561)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAAGAAGCACAAGAAGCACAAGTCGGACAAACACCTCTACGAGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100001 ATGGGCAAGAAGCACAAGAAGCACAAGTCGGACAAACACCTCTACGAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50         AGTATGTAGAGAAGCCCTTGAAGCTGGTCCTCAAAGTAGGAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TG...AAGAGTATGTAGAGAAGCCCTTGAAGCTGGTCCTCAAAGTAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAACGAAGTCACCGAACTCTCCACGGGCAGCTCGGGGCACGACTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100519 GGAACGAAGTCACCGAACTCTCCACGGGCAGCTCGGGGCACGACTCCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCTTCGAAGACAAAAACGATCATGACAAACACAAGGACAGAAAGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100569 CTCTTCGAAGACAAAAACGATCATGACAAACACAAGGACAGAAAGCGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAGAGAAAGAAAGGAGAGAAGCAGATTCCAGGGGAAGAAAAGGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100619 AAAGAGAAAGAAAGGAGAGAAGCAGATTCCAGGGGAAGAAAAGGGGAGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AACGGAGAAGAGTTAAG         GAGGATAAAAAGAAGCGAGATCGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100669 AACGGAGAAGAGTTAAGGTA...TAGGAGGATAAAAAGAAGCGAGATCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACCGGGTGGAGAATGAGGCAGAAAAAGATCTCCAGTGTCACGCCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113877 GACCGGGTGGAGAATGAGGCAGAAAAAGATCTCCAGTGTCACGCCCCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAGATTAGACTTGCCTCCTGAGAAGCCTCTCACAAGCTCTTTAGCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113927 GAGATTAGACTTGCCTCCTGAGAAGCCTCTCACAAGCTCTTTAGCCAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGAAG         AAGTAGAACAGACACCCCTTCAAGAAGCTTTGAAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113977 AAGAAGGTT...TAGAAGTAGAACAGACACCCCTTCAAGAAGCTTTGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAACTGATGAGACAATTGCAGAG         AAAAGATCCAAGTGCTTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 114328 CAACTGATGAGACAATTGCAGAGGTA...CAGAAAAGATCCAAGTGCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTTTTCATTTCCTGTGACTGATTTTATTGCTCCTGGCTACTCCATGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118626 CTTTTCATTTCCTGTGACTGATTTTATTGCTCCTGGCTACTCCATGATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTAAACACCCAATGGATTTTAGTACCATGAAAGAAAAGATCAAGAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118676 TTAAACACCCAATGGATTTTAGTACCATGAAAGAAAAGATCAAGAACAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GACTATCAGTCCATAGAAGAACTAAAG         GATAACTTCAAACT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 118726 GACTATCAGTCCATAGAAGAACTAAAGGTA...CAGGATAACTTCAAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AATGTGTACTAATGCCATGATTTACAATAAACCAGAGACCATTTATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128703 AATGTGTACTAATGCCATGATTTACAATAAACCAGAGACCATTTATTATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAGCTGCAAAGAAGCTGTTGCACTCAGGAATGAAAATTCTTAGCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 128753 AAGCTGCAAAGAAGCTGTTGCACTCAGGAATGAAAATTCTTAGCCAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    703       GAAAGAATTCAGAGCCTGAAGCAGAGCATAGACTTCATGGCTGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128803 ...TAGGAAAGAATTCAGAGCCTGAAGCAGAGCATAGACTTCATGGCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTTGCAGAAAACTCGAAAGCAGAAAGATGGAACAGACACCTCACAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133924 CTTGCAGAAAACTCGAAAGCAGAAAGATGGAACAGACACCTCACAGAGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGGAGGACGGAGGCTGCTGGCAGAGAGAGAGAGAGGACTCTGGAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133974 GGGAGGACGGAGGCTGCTGGCAGAGAGAGAGAGAGGACTCTGGAGATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAAGCACACGCCTTCAAGAGTCCCAGCAAAGAAAATAAAAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 134024 GAAGCACACGCCTTCAAGAGTCCCAGCAAAGAAAATAAAAAGTA...CAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GAAAGACAAAGATATGCTTGAAGATAAGTTTAAAAGCAATAATTTAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135078 GAAAGACAAAGATATGCTTGAAGATAAGTTTAAAAGCAATAATTTAGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GAGAGCAGGAGCAGCTTGACCGCATCGTGAAGGAATCTGGAGGAAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135128 GAGAGCAGGAGCAGCTTGACCGCATCGTGAAGGAATCTGGAGGAAAGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACCAGGCGGCTTGTGAACAGTCAG         TGCGAATTTGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 135178 ACCAGGCGGCTTGTGAACAGTCAGGTG...CAGTGCGAATTTGAAAGAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AAAACCAGATGGAACAACGACGTTGGGACTTCTCCATCCTGTGGATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140048 AAAACCAGATGGAACAACGACGTTGGGACTTCTCCATCCTGTGGATCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TTGTAGGAG         AGCCAGGCTACTGCCCTGTGAGACTGGGAATG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 140098 TTGTAGGAGGTA...TAGAGCCAGGCTACTGCCCTGTGAGACTGGGAATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ACAACTGGAAGACTTCAGTCTGGAGTGAATACTTTGCAGGGGTTCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142416 ACAACTGGAAGACTTCAGTCTGGAGTGAATACTTTGCAGGGGTTCAAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGATAAAAGGAACAAAGTCACTCCAG         TGTTATATTTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 142466 GGATAAAAGGAACAAAGTCACTCCAGGTG...CAGTGTTATATTTGAATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ATGGGCCCTACAGTTCTTATGCACCGCATTATGACTCCACATTTGCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142907 ATGGGCCCTACAGTTCTTATGCACCGCATTATGACTCCACATTTGCAAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ATCAGCAAGGATGATTCTGATTTAATCTATTCAACCTATGGGGAAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142957 ATCAGCAAGGATGATTCTGATTTAATCTATTCAACCTATGGGGAAGACTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGATCTTCCAAGTGATTTCAG         CATCCATGAGTTTTTGGCCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 143007 TGATCTTCCAAGTGATTTCAGGTG...CAGCATCCATGAGTTTTTGGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CGTGCCAAGATTATCCGTATGTCATGGCAGATAGTTTACTGGATGTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145097 CGTGCCAAGATTATCCGTATGTCATGGCAGATAGTTTACTGGATGTTTTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ACAAAAGGAGGGCATTCCAGGACCCTACAAGAGATGGAGATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 145147 ACAAAAGGAGGGCATTCCAGGACCCTACAAGAGATGGAGATGGTA...TA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1444  TCATTGCCTGAAGATGAAGGCCATACTAGGACACTTGACACAGCAAAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146736 GTCATTGCCTGAAGATGAAGGCCATACTAGGACACTTGACACAGCAAAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AAATGGAG         CAGATTACAGAAGTAGAGCCACCAGGGCGTTTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 146786 AAATGGAGGTG...AAGCAGATTACAGAAGTAGAGCCACCAGGGCGTTTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GACTCCAGTACTCAAGACAGGCTCATAGCGCTGAAAGCAGTAACAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148031 GACTCCAGTACTCAAGACAGGCTCATAGCGCTGAAAGCAGTAACAAATTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TGGCGTTCCAGTTGAAGTTTTTGACTCTGAAG         AAGCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 148081 TGGCGTTCCAGTTGAAGTTTTTGACTCTGAAGGTA...CAGAAGCTGAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TATTCCAGAAGAAACTTGATGAGACCACCAGATTGCTCAGGGAACTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148393 TATTCCAGAAGAAACTTGATGAGACCACCAGATTGCTCAGGGAACTCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GAAGCCCAGAATGAACGTTTGAGCACCAGACCCCCTCCGAACATGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148443 GAAGCCCAGAATGAACGTTTGAGCACCAGACCCCCTCCGAACATGATCTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TCTCTTGGGTCCCTCATACAGAGAAATGCATCTTG         CTGAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 148493 TCTCTTGGGTCCCTCATACAGAGAAATGCATCTTGGTA...TAGCTGAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 AAGTGACCAATAATCTTAAAGAACTTGCACAGCAAGTAACTCCAGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148751 AAGTGACCAATAATCTTAAAGAACTTGCACAGCAAGTAACTCCAGGTGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 ATCGTAAGCACGTATGGAGTTCGAAAAGCAATGGGGATTTCCATTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148801 ATCGTAAGCACGTATGGAGTTCGAAAAGCAATGGGGATTTCCATTCCTTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CCCCGTCATGGAAAACAACTTTGTGGATTTGACAGAAG         ACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 148851 CCCCGTCATGGAAAACAACTTTGTGGATTTGACAGAAGGTA...CAGACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 CTGAAGAACCTAAAAAGACGGATGTTGCTGAGTGTGGACCTGGTGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149512 CTGAAGAACCTAAAAAGACGGATGTTGCTGAGTGTGGACCTGGTGGAAGT