seq1 = pF1KB7886.tfa, 1953 bp
seq2 = pF1KB7886/gi568815582r_14961747.tfa (gi568815582r:14961747_15194233), 232487 bp

>pF1KB7886 1953
>gi568815582r:14961747_15194233 (Chr16)

(complement)

1-89  (100001-100089)   98% ->
90-195  (101620-101725)   100% ->
196-252  (102863-102919)   100% ->
253-342  (107780-107869)   100% ->
343-472  (107976-108105)   100% ->
473-532  (108536-108595)   100% ->
533-596  (109529-109592)   100% ->
597-666  (110652-110721)   100% ->
667-765  (114138-114236)   100% ->
766-858  (117584-117676)   100% ->
859-997  (119373-119511)   100% ->
998-1128  (121154-121284)   100% ->
1129-1259  (122983-123113)   100% ->
1260-1444  (123980-124164)   100% ->
1445-1553  (125957-126065)   100% ->
1554-1706  (128863-129015)   100% ->
1707-1794  (130951-131038)   100% ->
1795-1953  (132329-132487)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCACCGCTACTTCACACGCGTTTGCCGGGAGATGCGGCCGCTTC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCACCGCTGCTTCACACGCGTTTGCCGGGAGATGCGGCCGCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCCTCTGCAGTTAAGAAGCTGGGCGCGTCGAGGACTGG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100051 GTCCTCTGCAGTTAAGAAGCTGGGCGCGTCGAGGACTGGGTA...CAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTCAAATATGCGTGCATTAGAGAATGACTTTTTCAATTCTCCCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101622 TTTCAAATATGCGTGCATTAGAGAATGACTTTTTCAATTCTCCCCCAAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAACTGTTCGGTTTGGTGGAACTGTGACAGAAGTCTTGCTGAAGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101672 AAAACTGTTCGGTTTGGTGGAACTGTGACAGAAGTCTTGCTGAAGTACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAG         GGTGAAACAAATGACTTTGAGTTGTTGAAGAACCAGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101722 AAAGGTA...AAGGGTGAAACAAATGACTTTGAGTTGTTGAAGAACCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTTAGATCCAGACATAAAG         GATGACCAGATCATCAACTGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102900 TGTTAGATCCAGACATAAAGGTA...AAGGATGACCAGATCATCAACTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGCTAGAATTCCGTTCTTCTATCATGTACTTGACAAAAGACTTTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107801 CTGCTAGAATTCCGTTCTTCTATCATGTACTTGACAAAAGACTTTGAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACTTATCAGTATTATATTA         AGATTGCCTTGGTTGAATAGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107851 ACTTATCAGTATTATATTAGTA...TAGAGATTGCCTTGGTTGAATAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GTCAAACAGTAGTGGAAGAGTATTTGGCTTTTCTTGGTAATCTTGTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107998 GTCAAACAGTAGTGGAAGAGTATTTGGCTTTTCTTGGTAATCTTGTATCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCACAGACTGTTTTCCTCAGACCGTGTCTCAGCATGATTGCTTCCCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108048 GCACAGACTGTTTTCCTCAGACCGTGTCTCAGCATGATTGCTTCCCATTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGTGCCTC         CCCGAGTGATCATTAAGGAAGGCGATGTAGATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108098 TGTGCCTCGTA...AAGCCCGAGTGATCATTAAGGAAGGCGATGTAGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTTCAGATTCTGATGATGAAGATGATA         ATCTTCCTGCAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108569 TTTCAGATTCTGATGATGAAGATGATAGTA...CAGATCTTCCTGCAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TTTGACACATGTCACAGAGCCTTGCAAATAATAGCAAGATATGTACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109543 TTTGACACATGTCACAGAGCCTTGCAAATAATAGCAAGATATGTACCATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597          GACACCGTGGTTTCTCATGCCAATACTGGTGGAAAAATTTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109593 GTG...TAGGACACCGTGGTTTCTCATGCCAATACTGGTGGAAAAATTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CATTTGTTCGAAAATCAGAGAGAACACTG         GAATGTTACGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110693 CATTTGTTCGAAAATCAGAGAGAACACTGGTA...TAGGAATGTTACGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 CATAACTTACTAAGGATTAGTGTATATTTTCCAACCTTGAGGCATGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114150 CATAACTTACTAAGGATTAGTGTATATTTTCCAACCTTGAGGCATGAAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TCTGGAGCTTATTATTGAAAAACTACTCAAGTTGGAT         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 114200 TCTGGAGCTTATTATTGAAAAACTACTCAAGTTGGATGTA...TAGGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 ATGCATCCCGGCAGGGTATTGAAGATGCTGAAGAAACAGCAACTCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117588 ATGCATCCCGGCAGGGTATTGAAGATGCTGAAGAAACAGCAACTCAAACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TGTGGTGGGACAGATTCCACGGAAGGATTGTTTAATATG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 117638 TGTGGTGGGACAGATTCCACGGAAGGATTGTTTAATATGGTT...AAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 TGAAGATGAAGAAACTGAACATGAAACAAAGGCTGGTCCTGAACGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119375 TGAAGATGAAGAAACTGAACATGAAACAAAGGCTGGTCCTGAACGGCTCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 ACCAGATGGTGCATCCTGTAGCCGAGCGCCTGGACATCCTGATGTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119425 ACCAGATGGTGCATCCTGTAGCCGAGCGCCTGGACATCCTGATGTCTTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GTTTTGTCCTACATGAAGGATGTCTGCTATGTAGATG         GTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 119475 GTTTTGTCCTACATGAAGGATGTCTGCTATGTAGATGGTA...TAGGTAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 GGTTGATAACGGCAAAACAAAGGATCTATATCGCGACCTGATAAACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121158 GGTTGATAACGGCAAAACAAAGGATCTATATCGCGACCTGATAAACATCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TTGACAAACTCCTGTTGCCCACCCATGCCTCCTGCCATGTACAGTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121208 TTGACAAACTCCTGTTGCCCACCCATGCCTCCTGCCATGTACAGTTTTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 ATGTTTTACCTCTGTAGTTTCAAATTG         GGATTCGCAGAGGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 121258 ATGTTTTACCTCTGTAGTTTCAAATTGGTG...TAGGGATTCGCAGAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 ATTTTTGGAACATCTCTGGAAAAAATTGCAGGACCCAAGTAATCCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122997 ATTTTTGGAACATCTCTGGAAAAAATTGCAGGACCCAAGTAATCCTGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TCATCAGGCAGGCTGCTGGAAATTATATTGGAAGCTTTTTGGCAAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123047 TCATCAGGCAGGCTGCTGGAAATTATATTGGAAGCTTTTTGGCAAGAGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 AAATTTATTCCTCTTAT         TACTGTAAAATCATGCCTAGATCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 123097 AAATTTATTCCTCTTATGTA...TAGTACTGTAAAATCATGCCTAGATCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TTTGGTTAACTGGCTGCACATATACCTTAATAACCAGGATTCGGGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124004 TTTGGTTAACTGGCTGCACATATACCTTAATAACCAGGATTCGGGAACAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 AGGCATTCTGCGATGTTGCTCTCCATGGACCATTTTACTCAGCCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124054 AGGCATTCTGCGATGTTGCTCTCCATGGACCATTTTACTCAGCCTGCCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GCTGTGTTCTACACCTTTGTTTTTAGACACAAGCAGCTTTTGAGCGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124104 GCTGTGTTCTACACCTTTGTTTTTAGACACAAGCAGCTTTTGAGCGGAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CCTGAAAGAAG         GTTTGCAGTATCTTCAGAGTCTGAATTTTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 124154 CCTGAAAGAAGGTC...AAGGTTTGCAGTATCTTCAGAGTCTGAATTTTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 AGCGGATAGTGATGAGCCAGCTAAATCCCCTGAAGATTTGCCTGCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125987 AGCGGATAGTGATGAGCCAGCTAAATCCCCTGAAGATTTGCCTGCCCTCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 GTGGTTAACTTTTTTGCTGCAATCACAAA         TAAGTACCAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 126037 GTGGTTAACTTTTTTGCTGCAATCACAAAGTA...CAGTAAGTACCAGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 CGTCTTCTGCTACACCATCATTGAGAGGAACAATCGCCAGATGCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128875 CGTCTTCTGCTACACCATCATTGAGAGGAACAATCGCCAGATGCTGCCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 TCATTAGGAGTACCGCTGGAGGAGACTCAGTGCAGATCTGCACAAACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128925 TCATTAGGAGTACCGCTGGAGGAGACTCAGTGCAGATCTGCACAAACCCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 CTGGACACCTTCTTCCCCTTTGATCCCTGTGTGCTGAAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 128975 CTGGACACCTTCTTCCCCTTTGATCCCTGTGTGCTGAAGAGGTA...CAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GTCAAAGAAATTCATTGATCCTATTTATCAGGTGTGGGAAGACATGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130951 GTCAAAGAAATTCATTGATCCTATTTATCAGGTGTGGGAAGACATGAGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 CTGAAGAGCTACAGGAGTTCAAGAAACCCATGAAAAAG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 131001 CTGAAGAGCTACAGGAGTTCAAGAAACCCATGAAAAAGGTC...CAGGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 ATAGTGGAAGATGAAGATGATGACTTTCTGAAAGGCGAAGTGCCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132332 ATAGTGGAAGATGAAGATGATGACTTTCTGAAAGGCGAAGTGCCCCAGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 TGATACCGTGATTGGGATCACACCAAGCTCCTTTGACACGCATTTCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132382 TGATACCGTGATTGGGATCACACCAAGCTCCTTTGACACGCATTTCCGAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 GTCCTTCAAGTAGTGTGGGCTCCCCACCCGTGTTGTACATGCAACCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132432 GTCCTTCAAGTAGTGTGGGCTCCCCACCCGTGTTGTACATGCAACCCAGT

   2100     .
   1948 CCCCTC
        ||||||
 132482 CCCCTC