seq1 = pF1KB7827.tfa, 1614 bp
seq2 = pF1KB7827/gi568815579f_43864948.tfa (gi568815579f:43864948_44097471), 232524 bp

>pF1KB7827 1614
>gi568815579f:43864948_44097471 (Chr19)

10-142  (126595-126727)   98% ->
143-235  (126895-126987)   100% ->
236-1614  (131146-132524)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     10 TTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGA
        ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126595 TTGTAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     60 GGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126645 GGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    110 TGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGG         GGCATCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 126695 TGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGTG...CAGGGCATCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126903 CCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAG         GAGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 126953 GATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGTA...TAGGAGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131152 AGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGGTCCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131202 TGGTCCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGAAAATGGTGATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131252 TCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGAAAATGGTGATGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131302 CCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCCCAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 131352 TCCCAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCATCAGTGATGTTCCCATCTTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131402 TCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131452 GTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131502 CACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131552 TCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131602 CATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131652 AATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131702 ATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131752 TCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131802 TATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 ACCATTTAGGTGTGATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131852 ACCATTTAGGTGTGATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131902 TTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATGTGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131952 CAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGTCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCT
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132002 GGTCCACACAGGAGAAAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132052 TCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGTGGAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 132102 AAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGGGATTTTATACAAATTCACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 ACTGTCTTCCCATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132152 ACTGTCTTCCCATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132202 AGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132252 AGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132302 CTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 AAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132352 AAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 TACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132402 TACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132452 TGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTT

   1600     .    :    .    :
   1592 TATCATTATTTCTAAATGACACA
        |||||||||||||||||||||||
 132502 TATCATTATTTCTAAATGACACA